Способ микроскопического исследования образца, содержащего микрообъекты с разнородными зонами

Способ может быть использован, в частности, для морфологического и текстурного анализа исследуемых образцов материала, например, в гематологии. В способе получают и передают в компьютер последовательность цифровых изображений образца, для каждого пикселя которых определяют его координаты RGB. Осуществляют сегментацию изображения, проводят морфологический анализ и определение геометрических характеристик микрообъектов: площади разнородных зон, площадь микрообъекта, коэффициенты формы разнородных зон, коэффициент формы микрообъекта, отношение площадей разнородных зон. Для каждого пикселя определяют светлоту L и яркость Y в цветовых моделях LUV и YUV, рассчитывают матрицы пространственной смежности для каждой K-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют: R, G, В из цветовой модели RGB, L и Y из цветовых моделей LUV и YUV, и определяют текстурные характеристики: энергию, момент инерции, энтропию, максимальную вероятность, локальную однородность. Рассчитывают матрицы длин серий для каждой Q-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют G из цветовой модели RGB, L и Y из цветовых моделей HLS и YUV, и определяют текстурные характеристики микрообъектов: неоднородность яркости, момент серий, обратный момент серий, неоднородность длин серий, долю изображения в сериях. Полученные характеристики сравнивают с характеристиками эталонных изображений и определяют принадлежность анализируемого микрообъекта к определенному виду. Техническая результат - повышение достоверности, а также информативности и объективности результатов исследования, снижение трудоемкости, расширение функциональных возможностей микроскопического исследования образцов. 9 з.п. ф-лы.

 

Изобретение относится к способам исследования и анализа материалов с помощью оптических и компьютерных средств и может быть использовано, в частности, для морфологического и текстурного анализа исследуемых образцов материала, например, в гематологии.

Известен способ исследования образца, содержащего N видов микрообъектов, где N≥2, из которых по крайней мере один вид имеет две разнородные зоны, например, образца в виде мазка крови (RU 2232988 С1, опубл. 20.07.2004), в котором осуществляют анализ мазка крови, в результате которого подсчитывают количество форменных элементов крови (лейкоцитов, эритроцитов, тромбоцитов) унифицированным способом и оценивают содержание лейкоцитов, эритроцитов и тромбоцитов с учетом гемоконцентрации.

Недостатками известного способа являются высокая трудоемкость, а также недостаточная достоверность результатов и ограниченные функциональные возможности.

Известен способ микроскопического исследования образца, содержащего N видов микрообъектов, где N≥2, из которых по крайней мере один вид имеет две разнородные зоны, например, мазка периферийной крови, содержащего клетки лейкоцитарного ряда (RU 2122733 С1, опубл. 27.11.1998), который выбран в качестве прототипа и в котором с помощью микроскопа осуществляют сканирование поверхности мазка крови, в результате которого получают последовательность изображений, которую с помощью цифровой камеры преобразуют в цифровое изображение, которое передают в компьютер в виде последовательности цифровых изображений, осуществляют сегментацию изображения, используя цветовые координаты RGB, проводят автоматическое распознавание клеток и определяют содержание форменных элементов клеток.

Недостатками прототипа являются высокая трудоемкость, а также низкая достоверность автоматической классификации клеток, что вызывает необходимость эпизодических корректировок со стороны врача, ограниченные функциональные возможности.

Техническая результат, достигаемый при реализации заявляемого изобретения, заключается в повышении достоверности, а также информативности и объективности результатов, снижении трудоемкости, расширении функциональных возможностей микроскопического исследования образцов.

Технический результат достигается за счет того, что в способе микроскопического исследования образца, содержащего N видов микрообъектов, где N≥2, из которых по крайней мере один вид имеет две разнородные зоны, например, мазка периферийной крови, содержащего клетки лейкоцитарного ряда, в котором с помощью микроскопа осуществляют сканирование поверхности образца, в результате которого получают последовательность изображений, которые с помощью цифровой камеры преобразуют в цифровые изображения, которые передают в компьютер в виде последовательности цифровых изображений, в каждом из которых для каждого пикселя определяют его координаты RGB в цветовой модели RGB, описывающей цветояркостные характеристики пикселя,

- осуществляют сегментацию изображения, в результате которой получают карту областей изображения, соответствующих изображению микрообъектов, имеющих две разнородные зоны (ядра и цитоплазмы клеток), и областей изображения, соответствующих фону,

- полученные бинарные изображения микрообъектов используют для проведения морфологического анализа и определения геометрических характеристик микрообъектов, которые включают площади разнородных зон, площадь микрообъекта, коэффициенты формы разнородных зон, коэффициент формы микрообъекта, отношение площадей разнородных зон,

- дополнительно для каждого пикселя каждого изображения микрообъектов определяют светлоту L в цветовой модели LUV и яркость Y в цветовой модели YUV,

- для каждого изображения микрообъекта рассчитывают матрицы пространственной смежности для каждой K-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют: R-красную, G-зеленую, В-синюю из цветовой модели RGB, L-светлоту из цветовой модели LUV и Y-яркость из цветовой модели YUV, и

- определяют текстурные характеристики микрообъектов, которые включают энергию, момент инерции, энтропию, максимальную вероятность, локальную однородность,

- дополнительно для каждого изображения микрообъекта (клетки) рассчитывают матрицы длин серий для каждой Q-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют: G-зеленую из цветовой модели RGB, L-светлоту из цветовой модели HLS и Y-яркость из цветовой модели YUV, и

- определяют текстурные характеристики микрообъектов (клеток), которые включают неоднородность яркости, момент серий, обратный момент серий, неоднородность длин серий, долю изображения в сериях,

- полученные геометрические и текстурные характеристики сравнивают с характеристиками эталонных изображений микрообъектов, содержащихся в базе данных эталонных изображений, и определяют принадлежность анализируемого микрообъекта к определенному виду.

Предлагаемый способ наиболее целесообразно использовать в гематологии и, прежде всего, для выявления бластных клеток, при этом в качестве образца, содержащего N видов микрообъектов, где N≥2, используют окрашенный сухой мазок периферийной крови, а в качестве микрообъекта, имеющего две разнородные зоны, используют клетки крови лейкоцитарного ряда, имеющие ядро и цитоплазму, причем полученные геометрические и текстурные характеристики сравнивают с характеристиками эталонных изображений бластных клеток, содержащихся в базе данных эталонных изображений бластных и небластных клеток, и определяют принадлежность анализируемой клетки к бластным или небластным.

Кроме того, в случае необходимости способ осуществляют до момента получения заданного суммарного числа обнаруженных клеток крови лейкоцитарного ряда.

При определении принадлежности выявленной клетки к бластным или небластным осуществляют ее визуализацию.

При этом для облегчения идентификации клеток дополнительно визуализируют те изображения клеток из базы данных эталонных изображений бластных и небластных клеток, для которых геометрические и текстурные характеристики наиболее близки к признакам анализируемой клетки.

Полученные изображения клеток с определенными геометрическими и текстурными характеристиками могут быть занесены в базу данных эталонных изображений бластных и небластных клеток.

При этом имеющиеся в базе данных эталонных изображений бластных и небластных клеток изображения могут быть использованы при обучении и контроле знаний.

Расчет коэффициента формы ядра и клетки производят в соответствии со следующими математическими формулами:

- коэффициент формы ядра

,

где Ря - периметр, а Sя - площадь ядра,

- коэффициент формы клетки

,

где Рк - периметр, a Sк - площадь клетки.

Расчет текстурных характеристик на основе матриц пространственной смежности производят в соответствии со следующими математическими формулами:

- энергия

где - элемент матрицы пространственной смежности i-й строки и j-го столбца матрицы пространственной смежности, рассчитанный для К-й компоненты цветного изображения,

- момент инерции

- энтропия

- максимальная вероятность

- локальная однородность

Расчет текстурных характеристик на основе матриц длин серий производят в соответствии со следующими математическими формулами:

- неоднородность яркости

где p(i,j) - яркость соответствующей Q-й цветовой компоненты в точке изображения с координатами i,j,

- момент серий

- обратный момент серий

- неоднородность длин серий

- доля изображения в сериях

Как уже указывалось выше, предложенный способ автоматизированного микроскопического анализа образцов наиболее широкое использование может найти при анализе образцов в виде сухих мазков периферийной крови для выявления наличия в них бластных клеток.

Актуальность решения проблемы идентификации бластных клеток обусловлена следующим. Острый лейкоз - заболевание системы крови, которое при отсутствии лечения может привести к летальному исходу в течение нескольких недель. При этом заболевание протекает без специфических симптомов, что осложняет его раннюю диагностику. При нормальном ходе кроветворения в костном мозге образуются бластные клетки, которые, развиваясь, превращаются в зрелые клетки, после чего попадают в кровь. При остром лейкозе число бластных клеток в костном мозге превышает норму и часть из них переходит в кровь, не пройдя всех стадий развития. Таким образом, возможность достоверного определения наличия бластных клеток в периферической крови позволит осуществлять раннюю диагностику острого лейкоза.

Факт присутствия бластных клеток в периферической крови может быть установлен при первичном обследовании пациента, обратившегося за медицинской помощью в лечебное учреждение, что способствует более ранней диагностике острого лейкоза в этих случаях. Такое решение на практике сталкивается с рядом проблем:

1. При визуальном микроскопическом анализе мазков периферической крови в обычных поликлиниках врачи-лаборанты, как правило, не имеют достаточной квалификации для достоверной идентификации бластной клетки.

2. Автоматические гемоанализаторы, такие как проточные цитометры, при исследовании проб крови, содержащей бластные клетки, выдают ошибочные результаты по ее составу. Поэтому при отклонениях состава крови от нормы и при подозрениях на острый лейкоз обязательным является микроскопическое исследование препаратов крови (по заключению специалистов Российского онкологического научного центра им. Н.Н.Блохина РАМН).

3. Современные компьютерные системы анализа микроскопических изображений гематологических объектов до настоящего времени не обеспечивали достоверного автоматического обнаружения бластных клеток в препаратах крови (по заключению специалистов Гематологического научного центра РАМН). Такое положение обусловлено, по всей видимости, тем, что для идентификации бластных клеток недостаточно применявшихся ранее признаков, описывающих размеры и форму ядра и цитоплазмы клеток.

Микроскопическому анализу образцов крови на наличие бластных клеток предшествует выявление пациентов, анализы периферической крови которых имеют отклонения от нормы. Для этого при первичном обращении пациента в медицинское учреждение он направляется на проведение анализа периферической крови, выполняемого стандартными для медицинского учреждения средствами. Когда результаты анализа в норме, пациент продолжает плановое обследование. В противном случае назначается дополнительное обследование на выявление бластных клеток в периферической крови.

Ключевым в таком обследовании является применение автоматизированных диагностических систем, позволяющих идентифицировать бластные клетки в препарате периферической крови. Если бластных клеток не обнаруживается, то обследование продолжается в обычном порядке. При наличии бластных клеток врач, обнаруживший бластные клетки, проводит оценку общего анализа крови, консультируется с коллегами, с лечащим врачом данного пациента. По результатам формируется заключение с предупреждением лечащего врача о ситуации и возможных подозрениях на заболевание острым лейкозом. Для разрешения этих подозрений пациент направляется на проведение гематологических исследований, позволяющих уточнить диагноз. При наличии в крови нескольких процентов бластных клеток развитие острого лейкоза неизбежно в течение недель или месяцев. Поэтому важно при микроскопическом анализе мазка крови не пропустить даже одну бластную клетку.

Указанные выше проблемы, связанные с ранним выявлением бластных клеток, подтверждают актуальность предлагаемого способа микроскопического анализа сухих мазков крови с идентификацией бластных клеток.

Предлагаемый способ предназначен не только для обнаружения клеток, которые могут быть отнесены к бластным, но и обеспечить систему поддержки принятия решений по идентификации бластных клеток.

Для этого был создан компьютерный атлас изображений - атлас типовых клеток и клеток, встречающихся в крови при различных заболеваниях, в том числе и при остром лейкозе. На втором этапе создана компьютерная система для распознавания бластных клеток на микроскопическом изображении мазка крови. На третьем этапе разработана последовательность совокупности операций способа автоматизированного анализа мазка крови, основанная на применении компьютерной системы распознавания бластных клеток и компьютерного атласа изображений клеток крови. При этом любую клетку, идентифицированную как бластную, врач, использующий систему, может сравнить с клетками из атласа и на этом основании принять окончательное решение о принадлежности исследуемой клетки к бластным.

Следует отметить, что компьютерный атлас бластных клеток, наряду с применением в диагностике, призван оказать помощь при повышении квалификации врачей и обучении студентов-медиков.

Системы автоматизированного анализа изображений клеток крови могут использоваться как врачами клинико-диагностических лабораторий, так и специалистами-гематологами как средство для консультаций в сложных для диагностики случаях.

На основании результатов исследований состояния вопроса в области автоматизации диагностики острого лейкоза и на основании анализа объектной среды компьютерной системы обработки микроскопических изображений мазков крови предлагается следующая концептуальная модель автоматизированного микроскопического анализа мазка крови при диагностике острых лейкозов

Мконц={Zкр, Рпр, Vмикр, Красп, Аконс, Тбл},

где Мконц - концептуальная модель автоматизированного анализа мазка крови при диагностике острого лейкоза; Zкр - взятие крови у пациента; Рпр - приготовление препарата мазка крови; Vмикр - автоматизированное сканирование мазка с вводом изображений фрагментов препарата в компьютер; Красп - компьютерная обработка изображения мазка крови с целью распознавания бластных клеток; Аконс - анализ результатов распознавания бластных клеток, сравнительная оценка исследуемых клеток с клетками из компьютерного атласа, при необходимости (и технической возможности) - проведение телемедицинских консультаций со специалистами ведущих медицинских центров; Тбл - формирование заключения о типе клетки - бластная или небластная.

Этапы Zкр, Рпр, Vмикр подготовительные, в то время как решающим является этап Красп и Аконс. В то же время, достоверность результата распознавания и сформированного заключения в существенной мере зависят от качества реализации этапов Zкр, Рпр, Vмикр.

Взятие крови проводится по стандартной методике, и мазок крови на предметном стекле также готовится по стандартной методике. Предметное стекло устанавливается на моторизованный столик микроскопа. Особо следует подчеркнуть необходимость строгого соблюдения методик взятия крови и приготовления препарата, а также контроля качества приготовленного препарата на этапе его автоматизированного анализа.

При осуществлении способа микроскопического исследования мазка периферийной крови, содержащего клетки лейкоцитарного ряда, для выявления бластных клеток, с помощью микроскопа осуществляют сканирование поверхности мазка периферийной крови, в результате которого получают последовательность изображений, которые с помощью цифровой камеры преобразуют в цифровые изображения, которые передают в компьютер в виде последовательности цифровых изображений.

После чего осуществляется обработка полученных изображений, которая может быть представлена в виде следующей модели Мо:

Мо={I, J, N, S, Р, К, Т}, где I - модель исходного изображения; J - модель фильтрации изображения; N - модель нормализации яркости и цветового фона изображения; S - модель сегментации изображения, обеспечивающая выделение лейкоцитов; Р - модель вычисления признаков для классификации; K - модель классификации бластных клеток; Т - определение выходных характеристик.

При этом I, J и N представляют собой этапы предобработки, которые проводятся в зависимости от качества полученных изображений. При предобработке производится фильтрация шума, нормализация изображения по яркости и цветовым характеристикам. Цель предобработки - улучшить изображение и преобразовать его к виду, который обеспечит успешное решение задачи описания и классификации бластных клеток. Ключевое решение этой задачи связано с определением признаков для автоматического разделения всей области изображения на области лейкоцитов и область фона (к области фона в данном случае относятся и красные клетки крови - эритроциты).

Для этого в каждом из цифровых изображений для каждого пикселя определяют его координаты RGB в цветовой модели RGB, описывающей цветояркостные характеристики пикселя, после чего осуществляют сегментацию изображения, в результате которой получают карту областей изображения, соответствующих изображению двух разнородных зон микрообъектов, т.е. в данном случае ядру и цитоплазме клетки, и областей изображения, соответствующих фону.

Существуют различные методы сегментации изображения. В предлагаемом спсобе она может быть осуществлена следующим образом:

1. Для каждого пикселя изображения с пространственными координатами (x,y) на основе значений цветовых координат RGB вычисляются значения коэффициентов S и I по формулам:

S=1-(3·[min(R, G, B)]/(R+G+B)),

I=1/3·(R+G+B).

2. Производится построение гистограммы значений коэффициентов S для всех пикселов изображения.

3. По полученной гистограмме коэффициентов S определяется значение коэффициента S=Sp, при котором гистограмма впервые образует локальный минимум после локального максимума при движении от бóльших значений S к меньшим.

4. Устанавливаются значения двумерной функции N(x,y) по правилу:

N(x,y)=S(x,y), если S(x,y)>Sp, в противном случае N(x,y)=0.

5. Производится построение гистограммы значений коэффициентов I для всех пикселов изображения.

6. По полученной гистограмме коэффициентов I определяется значение коэффициента I=Ip, при котором гистограмма впервые образует локальный минимум после локального максимума при движении от больших значений I к меньшим.

7. Устанавливаются значения двумерной функции F(x,y) по правилу:

F(x,y)=0, если I(x,y)>Ip, в противном случае F(x,y)=S(x,y)+1.

8. Методом наращивания областей (см., например, Р.Гонсалес, Р.Вудс. Цифровая обработка изображений. Москва: Техносфера, 2005. - 1972 с.) по значениям функции F(x,y)>0, используя в качестве центра кристаллизации точки изображения, для которых N(x,y)>0, определяют функцию принадлежности K(x,y)=1, для точек, принадлежащих наращенной области, и K(x,y)=0 для прочих точек.

9. Определяют откорректированное значение функции принадлежности по формуле K(x,y)=N(x,y), если N(x,y)>1, в противном случае значение функции K(x,y) оставляют без изменения.

10. В результате функция K(x,y) определяет разметку карты областей:

точки с координатами (x,y), для которых K(x,y)=0, принадлежат фону,

точки с координатами (x,y), для которых K(x,y)=1, принадлежат цитоплазме клетки,

точки с координатами (x,y), для которых K(x,y)>1, принадлежат ядру клетки.

Таким образом, получают бинарные изображения клеток, которые используют для проведения морфологического анализа и определения геометрических характеристик клеток, которые включают площадь ядра, площадь клетки, коэффициент формы ядра, коэффициент формы клетки, отношение площади ядра к площади цитоплазмы. При этом расчет коэффициентов формы ядра и клетки производят в соответствии со следующими математическими формулами:

- коэффициент формы ядра

где Ря - периметр, а Sя - площадь ядра,

- коэффициент формы клетки

где Рк - периметр, a Sк - площадь клетки.

Экспериментальная оценка информативности морфологических характеристик клеток для определения бластных и небластных клеток показала, что гистограммы их распределений для этих клеток сильно пересекаются. Таким образом, было установлено, что только этих характеристик недостаточно для надежной идентификации бластных клеток в мазке периферической крови.

По мнению врачей-гематологов одним из определяющих признаков бластной клетки является «нежность» структуры хроматина, однако существующие автоматизированные системы обработки изображений эту характеристику не измеряют. Поэтому рассматривался подход к распознаванию бластных клеток на основе описания структуры хроматина. Для количественного описания характеристики «нежности» хроматина был использован ряд признаков и проведено исследование их информативности. Поскольку «нежность» хроматина у бластных клеток определяется тонкими отдельными нитями, образующими сетку, в отличие от «глыбчатости» лимфоцитов, когда нити как бы сворачиваются в клубки - «глыбки», в основу расчета количественных признаков «нежности» положена оценка различий в значениях цветовых компонент близких точек изображения ядра.

С целью подчеркивания этих различий исследовался метод выделения перепадов яркости с применением оператора Собеля для каждой из цветовых компонент изображения R (красной), G (зеленой) и В (синей). На основе получившегося изображения перепадов интенсивности в каждой из цветовых компонент R, G, В рассчитывался интегральный показатель «нежности» С, при этом чем более «нежный» хроматин, тем больше значение С. В качестве дополнительных признаков использовались признаки, связанные с размерами ядра и цитоплазмы клеток (размер клетки, ядерно-цитоплазматическое отношение). Эксперименты показали, что ошибки классификации бластных и небластных клеток превышают 20%, что недостаточно для практического использования.

В связи с этим был предложен альтернативный подход на основе методов текстурного анализа.

Известно, что текстурные изображения различной природы могут быть описаны на основе оценки статистических свойств распределения значений яркости в изображении. Поэтому, рассматривая изображение ядра клетки крови как текстуру естественного происхождения, можно для ее описания применить метод текстурного анализа, основанный на вычислении матрицы пространственной смежности (матрицы Харалика).

В роли текстурных признаков рассматривался ряд статистик, полученных на основе матриц пространственной смежности: энергии ASM, момента инерции CON, энтропии ENT, максимальной вероятности MPR, локальной однородности LUN.

Данные статистики не исчерпывают весь спектр признаков, которые могут быть получены из матриц пространственной смежности. Однако известно, что указанные статистики несут наибольшую смысловую нагрузку для стохастических текстур естественной природы. По этой причине они были взяты в качестве базисной системы признаков.

Указанные признаки рассчитывались для цветовых компонент, представленных в цветовых моделях, имеющих наиболее широкое применение в задачах анализа и отображения цветных изображений: RGB, HLS, YUV. В результате экспериментальной оценки их информативности по критерию точности распознавания бластных клеток были выбраны R (красный), G (зеленый), В (синий), L (светлота), Y (яркость) как наиболее информативные.

В связи с этим дополнительно для каждого пикселя каждого изображения клеток при реализации способа определяют светлоту L в цветовой модели LUV и яркость Y в цветовой модели YUV, после чего для каждого изображения клетки рассчитывают матрицы пространственной смежности для каждой K-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют: R-красную, G-зеленую, В-синюю из цветовой модели RGB, L-светлоту из цветовой модели LUV и Y-яркость из цветовой модели YUV, и определяют текстурные характеристики клеток, которые включают энергию, момент инерции, энтропию, максимальную вероятность, локальную однородность. При этом расчет текстурных характеристик на основе матриц пространственной смежности производят в соответствии со следующими математическими формулами:

- энергия

где - элемент матрицы пространственной смежности i-й строки и j-го столбца матрицы пространственной смежности, рассчитанный для K-й компоненты цветного изображения,

- момент инерции

- энтропия

- максимальная вероятность

- локальная однородность

В качестве дополнительных текстурных характеристик для описания хроматина ядра клеток крови рассматривались характеристики, описывающие свойства длин серий постоянной яркости. Для длин серий рассчитывались характеристики: неоднородность яркости, момент серий, обратный момент серий, доля изображения в сериях для компонент G, L, Y. Указанные компоненты были выбраны как наиболее информативные из рассмотренных R, G, В, Н, L, S, Y, U, V, исходя из критерия точности распознавания бластных клеток.

Поэтому при осуществлении способа дополнительно для каждого изображения клетки рассчитывают матрицы длин серий для каждой Q-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют: G-зеленую из цветовой модели RGB, L-светлоту из цветовой модели HLS и Y-яркость из цветовой модели YUV, и определяют текстурные характеристики клеток, которые включают неоднородность яркости, момент серий, обратный момент серий, неоднородность длин серий, долю изображения в сериях. При этом расчет текстурных характеристик на основе матриц длин серий производят в соответствии со следующими математическими формулами:

- неоднородность яркости

где p(i,j) - яркость соответствующей Q-й цветовой компоненты в точке изображения с координатами i,j,

- момент серий

- обратный момент серий

- неоднородность длин серии

- доля изображения в сериях

Конечная цель обработки изображения - определить типы клеток крови, находящихся в отсканированной области мазка крови, и провести их классификацию, в результате которой производится отнесение выделенной клетки к одному из известных классов.

Исследовались различные методы классификации - метод ближайших соседей, дискриминантный анализ, нейросетевые технологии и др. Исследования показали, что оптимальным для решения поставленной задачи является метод дискриминантно-линейного разделения.

После этого полученные геометрические и текстурные характеристики сравнивают с характеристиками эталонных изображений бластных клеток, содержащихся в базе данных эталонных изображений бластных и небластных клеток и определяют принадлежность анализируемой клетки к бластным или небластным.

При этом при определении принадлежности выявленной клетки к бластным или небластным осуществляют ее визуализацию, например, на экране монитора. Кроме того, на облегчения сравнения выделенных клеток с эталонными изображениями дополнительно визуализируют те изображения клеток из базы данных эталонных изображений бластных и небластных клеток, для которых геометрические и текстурные характеристики наиболее близки к признакам анализируемой клетки.

Причем по применяемой в практике методике микроскопического анализа мазков крови для определения лейкоцитарной формулы, в ходе формирования которой и производится оценка бластных клеток, необходимо исследовать 100 лейкоцитов. Обычно в поле зрения микроскопа попадает не более 4-х лейкоцитов, а большая часть полей зрения вообще их не содержит. Поэтому цель сканирования мазка состоит в том, чтобы найти на препарате необходимое количество лейкоцитов и ввести их изображения в компьютер. В связи с этим способ может осуществляться до момента получения заданного суммарного числа обнаруженных клеток крови лейкоцитарного ряда.

Полученные в результате осуществления способа изображения клеток с определенными геометрическими и текстурными характеристиками заносят в базу данных эталонных изображений бластных и небластных клеток, что позволяет постоянно увеличивать базу данных и тем самым повышать вероятность правильной классификации клеток. При этом имеющиеся в базе данных эталонных изображений бластных и небластных клеток изображения могут быть использованы при обучении и контроле знаний.

Для оценки предложенного метода автоматизированного анализа изображений мазков крови была подготовлена выборка препаратов из архива Российского онкологического научного центра им. Н.Н.Блохина. Цифровые изображения клеток вводились в компьютер с помощью системы, включающей микроскоп ZEISS Axioplan, цифровую камеру Axiocam.

Изображения анализировалась врачом-экспертом. По результатам этого анализа сформировано описание типов клеток на указанных изображениях. В результате были отобраны клетки, которые удовлетворяют комплексу требований (по качеству окраски, освещения препарата, местоположения в препарате, качеству съемки). Наряду с решением задачи оценки эффективности разрабатываемого метода распознавания бластных клеток сформированная выборка клеток крови явилась основой для создания электронного атласа бластных клеток. Всего было отобрано 1384 лейкоцита, из них 429 бластных клеток и 955 небластных клеток (лимфоциты, моноциты и др.). В результате эксперимента, проведенного в соответствии с предлагаемым способом, получено, что среди бластных клеток неправильно идентифицировано не более 4%, а из небластных клеток распознано как бластные не более 3%.

Таким образом разработан способ автоматизированного микроскопического анализа мазка периферической крови, предназначенный для обнаружения бластных клеток, присутствие которых в мазке периферической крови является одним из существенных оснований для предположений о наличии острого лейкоза. Предлагаемый способ обеспечивает повышение достоверности, а также информативности и объективности результатов, снижение трудоемкости, расширение функциональных возможностей микроскопического исследования образцов.

1. Способ микроскопического исследования образца, содержащего N видов микрообъектов, где N≥2, из которых по крайней мере один вид имеет две разнородные зоны, в котором с помощью микроскопа осуществляют сканирование поверхности образца, в результате которого получают последовательность изображений, которые с помощью цифровой камеры преобразуют в цифровые изображения, которые передают в компьютер в виде последовательности цифровых изображений, в каждом из которых для каждого пикселя определяют его координаты RGB в цветовой модели RGB, описывающей цветояркостные характеристики пикселя,

осуществляют сегментацию изображения, в результате которой получают карту областей изображения, соответствующих изображению двух разнородных зон микрообъектов, и областей изображения, соответствующих фону,

полученные бинарные изображения микрообъектов используют для проведения морфологического анализа и определения геометрических характеристик микрообъектов, которые включают площади разнородных зон, площадь микрообъекта, коэффициенты формы разнородных зон, коэффициент формы микрообъекта, отношение площадей разнородных зон,

дополнительно для каждого пикселя каждого изображения микрообъектов определяют светлоту L в цветовой модели LUV и яркость Y в цветовой модели YUV,

для каждого изображения микрообъекта рассчитывают матрицы пространственной смежности для каждой K-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют: R-красную, G-зеленую, В-синию из цветовой модели RGB, L-светлоту из цветовой модели LUV и Y-яркость из цветовой модели YUV, и

определяют текстурные характеристики микрообъектов, которые включают энергию, момент инерции, энтропию, максимальную вероятность, локальную однородность,

дополнительно для каждого изображения микрообъекта (клетки) рассчитывают матрицы длин серий для каждой Q-й компоненты цветного изображения, в качестве которых используют: G-зеленую из цветовой модели RGB, L-светлоту из цветовой модели HLS и Y-яркость из цветовой модели YUV, и

определяют текстурные характеристики микрообъектов (клеток), которые включают неоднородность яркости, момент серий, обратный момент серий, неоднородность длин серий, доля изображения в сериях,

полученные геометрические и текстурные характеристики сравнивают с характеристиками эталонных изображений микрообъектов, содержащихся в базе данных эталонных изображений и определяют принадлежность анализируемого микрообъекта к определенному виду.

2. Способ по п.1, отличающийся тем, что его используют для выявления бластных клеток, при этом в качестве образца, содержащего N видов микрообъектов, где N≥2, используют окрашенный сухой мазок периферийной крови, а в качестве микрообъекта, имеющего две разнородные зоны, используют клетки крови лейкоцитарного ряда, имеющие ядро и цитоплазму, причем полученные геометрические и текстурные характеристики сравнивают с характеристиками эталонных изображений бластных клеток, содержащихся в базе данных эталонных изображений бластных и небластных клеток и определяют принадлежность анализируемой клетки к бластным или небластным.

3. Способ по п.2, отличающийся тем, что его осуществляют до момента получения заданного суммарного числа обнаруженных клеток крови лейкоцитарного ряда.

4. Способ по п.2 или 3, отличающийся тем, что при определении принадлежности выявленной клетки к бластным или небластным осуществляют ее визуализацию.

5. Способ по п.4, отличающийся тем, что дополнительно визуализируют те изображения клеток из базы данных эталонных изображений бластных и небластных клеток, для которых геометрические и текстурные характеристики наиболее близки к признакам анализируемой клетки.

6. Способ по п.2, отличающийся тем, что полученные изображения клеток с определенными геометрическими и текстурными характеристиками заносят в базу данных эталонных изображений бластных и небластных клеток.

7. Способ по п.2 или 6, отличающийся тем, что используют имеющиеся в базе данных эталонных изображений бластных и небластных клеток изображения при обучении и контроле знаний.

8. Способ по п.2, отличающийся тем, что расчет коэффициентов формы ядра и клетки производят в соответствии со следующими математическими формулами

коэффициент формы ядра

где Ря - периметр, а Sя - площадь ядра,

коэффициент формы клетки

где Рк - периметр, a Sк - площадь клетки.

9. Способ по п.2, отличающийся тем, что расчет текстурных характеристик на основе матриц пространственной смежности производят в соответствии со следующими математическими формулами:

энергия

где - элемент матрицы пространственной смежности i-й строки и j-го столбца матрицы пространственной смежности, рассчитанный для K-й компоненты цветного изображения,

момент инерции

энтропия

максимальная вероятность

локальная однородность

10. Способ по п.2, отличающийся тем, что расчет текстурных характеристик на основе матриц длин серий производят в соответствии со следующими математическими формулами

неоднородность яркости

где p(i,j) - яркость соответствующей Q-й цветовой компоненты в точке изображения с координатами i,j,

момент серий

обратный момент серий

неоднородность длин серий

доля изображения в сериях



 

Похожие патенты:

Изобретение относится к оптической технике, в частности к микроскопам и способам регистрации изображения с их помощью. .

Изобретение относится к области оптическо-электронного приборостроения, предназначено для использования в криминалистике при проведении баллистических экспертиз огнестрельного оружия.

Изобретение относится к области оптико-электронного приборостроения и может быть использовано в криминалистике для проведения трасологических экспертиз пуль и гильз стрелкового оружия и создания банка данных пулегильзотек.

Изобретение относится к медицине, в частности к гистологической технике исследования микропрепэратов. .

Изобретение относится к квантовой электронике, а именно к лазерным проекционным системам, и может быть использовано для визуального контроля БИС, фотошаблонов для исследования микрообъектов в медицине и биологии.

Изобретение относится к медицинскому приборостроению и может быть использовано как в микрохирургии, так и при диагностике для индивидуального и коллективного наблюдения.

Изобретение относится к микроскопии и позволяет повысить качество микрофотографий путем снижения времени экспонирования и повышения точности экспозиции. .

Изобретение относится к области оптико-электронного приборостроения и может быть использовано при проведении баллистических экспертиз огнестрельного оружия

Изобретение относится к медицинской технике

Изобретение относится к оптическому приборостроению в области медицины и направлено на повышение эффективности обнаружения клеточных аномалий при компьютерном анализе, а также в рамкам исследования, объединяющего в себе собственно процесс диагностики и одновременно обучение диагностике, что обеспечивается за счет того, что способ согласно изобретению содержит следующие этапы: осуществляют обработку пробы для обеспечения различения патологических клеток среди здоровых клеток пробы, выполняют, по меньшей мере, одно первое получение изображений пробы, размещенной на аналитической пластинке, таким образом, чтобы получить множество изображений, каждое из которых представляет одну зону аналитической пластинки, при этом упомянутые изображения, расположенные рядом друг с другом, образуют изображение всей пробы так, чтобы создать виртуальную аналитическую пластинку. Отмечают базовую плоскость аналитической пластинки, состоящей из предметной пластинки и покрывной пластинки, расположенной над предметной пластинкой, для получения изображений, при этом упомянутая базовая плоскость определена поверхностью предметной пластинки или покрывной пластинки; и осуществляют, по меньшей мере, одно второе получение изображений на толщине, отличной от толщины пробы первого получения так, чтобы получить множество изображений, соответствующих срезу пробы, осуществленному на разной толщине. 15 з.п. ф-лы, 3 ил.

Изобретение относится к устройству, способу и системе исследования неоднородного жидкого образца, включающего в себя получение множества изображений упомянутого образца, размещенного относительно устройства для образца. Заявленное устройство содержит, по меньшей мере, первый узел оптической регистрации, имеющий оптическую ось, и, по меньшей мере, один блок переноса, выполненный с возможностью перемещения устройства для образца и первого узла оптической регистрации относительно друг друга. Движение устройства для образца и первого узла оптической регистрации относительно друг друга происходит вдоль пути сканирования, который образует угол θ с оптической осью, причем θ находится в пределах от приблизительно 60 до приблизительно 89,5 градусов. Заявленный способ исследования неоднородного жидкого образца включает в себя получение множества изображений упомянутого образца и содержит этапы, на которых размещают образец относительно устройства для образца; размещают устройство для образца относительно вышеуказанного устройства, перемещают устройство для образца и первый узел регистрации относительно друг друга по длине сканирования, причем движение включает в себя движение в направлении вдоль первого пути сканирования, который образует угол θ с оптической осью, причем θ находится в пределах от приблизительно 60 до приблизительно 89,5 градусов, причем электромагнитные волны передают из устройства освещения изображения через область получения изображения в направлении устройства получения изображения и получают множество изображений. Технический результат, достигаемый от реализации заявленной группы изобретений, заключается в освещении образца для передачи электромагнитных волн через область получения изображения в устройстве для образца к устройству получения изображения для усовершенствования устройства для получения множества изображений неоднородного образца. 2 н. и 54 з.п. ф-лы, 11 ил.

Изобретение относится к системе (1) формирования изображения образца, предназначенной для передачи изображения клеток или тканей, расположенных в культивационной камере (6), к средствам (7) обработки данных. Система (1) содержит блок (2) микроскопа, предназначенный для использования в культивационной камере (6) и содержащий станину, держатель объекта, размещенный на станине, средства формирования изображения, размещенные на станине и предназначенные для формирования оптического изображения клеток или тканей, расположенных на держателе объекта, и средства захвата изображения, захватывающие изображение, проецируемое средствами формирования изображения. Блок (2) микроскопа содержит выведенные наружу из культивационной камеры (6) соединительные средства (4), которые обеспечивают подачу электропитания к блоку (2) микроскопа и передачу захваченного изображения. Соединительные средства (4) могут быть соединены с блоком (3) управления, предназначенным для использования вне культивационной камеры (6) и передающим захваченное изображение к средствам (7) обработки данных, а блок (3) управления содержит устройства, способные прекращать подачу электропитания к блоку (2) микроскопа, за исключением периода захвата изображения клеток или тканей и передачи захваченного изображения к блоку (3) управления по соединительным средствам (4). Технический результат - повышение надежности экспериментов, проводимых в культивационной камере. 2 н. и 11 з.п. ф-лы, 4 ил., 2 табл.

Изобретение предлагает способ определения местоположения одного или более образцов ткани по существу круглой формы, размещенных на твердом носителе. Способ включает этапы подачи света с заданной длиной волны на образец ткани, в котором этот свет вызывает автофлуоресценцию, идентификацию положения центра образца ткани на основе использования автофлуоресцентного света, корреляцию координат положения центра образца ткани на твердом носителе на основе использования системы координат х, у и составление карты координат образца ткани на твердом носителе для различения областей, содержащих образец ткани, и незаполненных областей на твердом носителе. Также предлагается устройство для определения местоположения одного или более образцов ткани по существу круглой формы, размещенных на твердом носителе. 2 н. и 20 з.п. ф-лы, 3 ил.

Группа изобретений касается микроскопа, способного получать цифровое изображение, имеющее небольшую размытость даже в случае использования широкоугольного объектива с высокой разрешающей способностью. Устройство включает в себя осветительное устройство, оптическую систему для фокусировки изображения объекта и устройство формирования изображения для захвата изображения объекта. При этом устройство формирования изображения включает в себя множество блоков формирования изображения. Каждый из блоков формирования изображения включает в себя датчик изображения и механизм перемещения для перемещения датчика изображения. 3 н. и 11 з.п. ф-лы, 26 ил.

Изобретение относится к способам цитологического или гистологического анализа. Согласно способу производят обработку пробы для выделения патологических клеток среди здоровых. Получают множество изображений пробы, каждое из которых характеризует одну зону пластинки для анализа. Множество изображений, расположенных рядом друг с другом, образуют изображение всей пробы, в результате чего получают виртуальную пластинку для анализа. На полученной виртуальной пластинке выполняют компьютерную обработку по окрашиванию изображений. Указанное окрашивание соответствует виртуальному окрашиванию типа окрашивания по Папаниколау, Шорру, Маю-Грюнвальду-Гимзе или Гимзе. При этом обработка обеспечивает возможность менять указанные цвета и интенсивность цвета по усмотрению лица, производящего анализ. Технический результат - повышение достоверности и качества анализа. 7 з.п. ф-лы, 6 ил.

Изобретение относится к микроскопии отдельных биологических организмов в жидком образце. Изображения, на которых могут быть идентифицированы отдельные биологические организмы, объединяют для создания наборов оптических срезов биологических организмов, и наборы оптических срезов анализируют для определения значения по меньшей мере одного параметра, описывающего микробную активность указанного отдельного биологического организма в каждом контейнере для образца. Техническим результатом является уменьшение времени исследования, повышение надежности и экономической эффективности результата. 2 н. и 23 з.п. ф-лы, 23 ил.

Изобретение относится к способу микроскопического формирования изображения образца цифровым сканером, содержащим датчик, включающий в себя двумерный массив пикселов, и к цифровому сканирующему микроскопу, осуществляющему этот способ. Сканер содержит датчик, включающий в себя двумерный массив пикселов в системе координат XY. Ось Y является перпендикулярной к направлению сканирования. Сканер расположен так, что датчик может формировать изображение косого поперечного сечения образца. Способ содержит этапы активации первого подмассива двумерного массива пикселов. При этом первый подмассив продолжается преимущественно вдоль оси Y при первой координате X (X1) и включает в себя линию пикселов. Первое изображение создают путем формирования изображения первого участка образца посредством первого подмассива пикселов. При этом во время сканирования регулируют первую координату Х до обновленных позиций, при которых сканер определяет строку пикселов, которая будет в фокусе. Технический результат - непрерывная регулировка подмассива формирования изображения во время сканирования относительно фокуса. 2 н. и 13 з.п. ф-лы, 10 ил.
Наверх