Композиции и способы модуляции экспрессии рецептора фактора роста фибробластов 4 (fgfr4)

Изобретение относится к области молекулярной биологии. Предложен одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид, способный ингибировать экспрессию рецептора фактора роста фибробластов 4 FGFR4, а также соответствующие композиция и способы лечения диабета, ожирения, метаболического синдрома, ингибирования экспрессии FGFR4, снижения уровня глюкозы и снижения массы тела. Изобретение может быть использовано в медицине для лечения заболеваний, обусловленных экспрессией рецептора фактора роста фибробластов 4. 7 н. и 14 з.п. ф-лы, 21 табл., 4 ил., 14 пр.

 

Текст описания приведен в факсимильном виде.

1. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на нуклеиновую кислоту, кодирующую фактор роста фибробластов 4 (FGFR4), и способный ингибировать экспрессию FGFR4 человека, состоящий из 12-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеиновых оснований (нуклеооснований), содержащую по меньшей мере 12 непрерывных нуклеиновых оснований из последовательности нуклеиновых оснований, выбранной из последовательностей нуклеиновых оснований, представленных в SEQ ID NO:98, 21, 22, 23, 24, 28, 29, 36, 38, 39, 43, 48, 51, 54, 55, 56, 58, 59, 60, 63, 64, 65, 66, 92, 93, 96, 99, 101, 102,103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 140, 141, 142, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 155, 157, 159, 160, 163, 166 и 166, причем олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфоротиоатную межнуклеозидную связь, и/или по меньшей мере один нуклеозид содержит модифицированный сахар, и/или по меньшей мере один нуклеозид содержит модифицированное нуклеооснование.

2. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что он имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 12 непрерывных нуклеиновых оснований из последовательности нуклеиновых оснований, выбранной из последовательностей нуклеиновых оснований, представленных в SEQ ID NO:98, 39, 99, 101, 102, 104, 106, 107, 109, 114, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 128, 130, 131, 132, 133, 134, 136, 137, 141, 144, 146, 147, 150, 151, 152 и 159.

3. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что он имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 12 непрерывных нуклеиновых оснований из последовательности нуклеиновых оснований, выбранной из последовательностей нуклеиновых оснований, представленных в SEQ ID NO:98, 39, 99, 104, 107, 109, 114, 116, 119, 121, 128, 130, 131, 133, 136, 137, 144, 146, 147, 150, 151 и 159.

4. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что он имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 12 непрерывных нуклеиновых оснований из последовательности нуклеиновых оснований, выбранной из SEQ ID NO:98 и SEQ ID NO:99.

5. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что он имеет последовательность нуклеооснований, содержащую по меньшей мере 12 непрерывных нуклеиновых оснований из последовательности нуклеиновых оснований, представленной SEQ ID NO:98.

6. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что он на 90%, 95% или 100% комплементарен нуклеотидной последовательности, кодирующей рецептор фактора роста фибробластов 4, выбранной из нуклеотидных последовательностей, представленных в SEQ ID NO:1-8.

7. Одноцепочечный модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на нуклеиновую кислоту, кодирующую фактор роста фибробластов 4 (FGFR4), и способный ингибировать экспрессию FGFR4 мыши, состоящий из 12-30 связанных нуклеозидов и имеющий последовательность нуклеиновых оснований (нуклеооснований), содержащую по меньшей мере 12 непрерывных нуклеиновых оснований из последовательности нуклеиновых оснований, выбранной из последовательностей нуклеиновых оснований, представленных в SEQ ID NO:15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 85, 86, 87, 88, 89, 90 и 91, причем олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфоротиоатную межнуклеозидную связь, и/или по меньшей мере один нуклеозид содержит модифицированный сахар, и/или по меньшей мере один нуклеозид содержит модифицированное нуклеооснование.

8. Олигонуклеотид по п.7, отличающийся тем, что он на 90%, 95% или 100% комплементарен нуклеотидной последовательности, кодирующей рецептор фактора роста фибробластов мыши 4, выбранной из нуклеотидных последовательностей, представленных в SEQ ID NO:9-14.

9. Олигонуклеотид по п.1 или 7, отличающийся тем, что он содержит по меньшей мере одну фосфоротиоатную межнуклеозидную связь, и где необязательно каждая межнуклеозидная связь в олигонуклеотиде является фосфоротиоатной межнуклеозидной связью.

10. Олигонуклеотид по п.1 или 7, отличающийся тем, что по меньшей мере один нуклеозид олигонуклеотида содержит модифицированный сахар, который необязательно представляет собой бициклический сахар или сахар, содержащий 2′-О-метоксиэтильную группу.

11. Олигонуклеотид по п.1 или 7, отличающийся тем, что по меньшей мере один нуклеозид олигонуклеотида содержит модифицированное нуклеооснование, которое необязательно представляет собой 5-метилцитозин.

12. Олигонуклеотид по п.1 или 7, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит:
гэп-сегмент, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов;
5′ фланкирующий сегмент, состоящий из связанных нуклеозидов;
3′ фланкирующий сегмент, состоящий из связанных нуклеозидов;
причем гэп-сегмент расположен между 5′ фланкирующим сегментом и 3′ фланкирующим сегментом, и каждый нуклеозид каждого фланкирующего сегмента содержит модифицированный сахар.

13. Олигонуклеотид по п.1 или 7, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит:
гэп-сегмент, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; 5′ фланкирующий сегмент, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; 3' фланкирующий сегмент, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; причем гэп-сегмент расположен между 5′ фланкирующим сегментом и 3' фланкирующим сегментом, где каждый нуклеозид каждого фланкирующего сегмента содержит 2′-О-метоксиэтилсахар; и где каждая межнуклеозидная связь представляет собой фосфоротиоатную связь.

14. Олигонуклеотид по п.1 или 7, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов.

15. Композиция для лечения диабета, ожирения или метаболического синдрома, содержащая эффективное количество олигонуклеотида по п.1 или 7 или его соли и фармацевтический приемлемый носитель или разбавитель.

16. Способ лечения диабета, ожирения или метаболического синдрома, включающий введение субъекту олигонуклеотида по любому из пп.1-14 или композиции по п.15.

17. Способ по п.16, отличающийся тем, что одновременно с олигонуклеотидом вводят агент против ожирения или агент, снижающий уровень глюкозы или нейролептик.

18. Способ ингибирования экспрессии рецептора фактора роста фибробластов 4 в человеческих клетках или тканях, включающий контактирование указанных клеток или тканей с олигонуклеотидом по любому из пп.1-14 или композицией по п.15.

19. Способ повышения уровня метаболизма, включающий введение субъекту олигонуклеотида по любому из пп.1-14 или композиции по п.15.

20. Способ снижения уровня глюкозы или повышения чувствительности к инсулину или их комбинация, включающий введение субъекту олигонуклеотида по любому из пп.1-14 или композиции по п.15.

21. Способ снижения массы тела или содержания телесного жира или их комбинации, включающий введение субъекту олигонуклеотида по любому из пп.1-14 или композиции по п.15.



 

Похожие патенты:
Изобретение относится к области биохимии и молекулярной биологии, а именно к способу очистки синтетических олигодезоксирибонуклеотидов. Основной задачей настоящего изобретения является разработка эффективного способа очистки олигодезоксирибонуклеотидов с высоким выходом и высокой степенью очистки от производных кремниевой кислоты, пригодного для крупномасштабного синтеза.

Группа изобретений относится к области биохимии. Предложен сосуд из пластика для сорбирования нуклеиновых кислот из жидкой среды.
Изобретение относится к области биохимии. .

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к экспрессионным конструкциям, и может быть использовано для экспрессии иммуноглобулина. .

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к средствам и методам диагностики и дифференцирования разных типов рака молочной железы, и может быть использовано в медицине.

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к лиофилизированному ДНК-составу для применения в способе лечения ишемического заболевания и к способу лечения ишемического заболевания у индивидуума.

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к получению белков шелка различных насекомых, и может быть использовано в медицине для создания фармацевтически приемлемого носителя.

Изобретение относится к медицине и касается фармацевтической композиции для вызова иммунного ответа против опухолеассоциированных макрофагов, содержащей минигенную конструкцию ДНК, которая кодирует полипептид, в фармацевтически приемлемом носителе, где полипептид содержит три иммуногенных фрагмента легумаина, связанных вместе линкерными пептидами, и где каждый линкерный пептид состоит из последовательности ААА или AAY.

Изобретение относится к области медицины и касается опосредованного PHKi ингибирования RHO-киназы для лечения глазных нарушений. .

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой антитела, имеющие сайт антигенного связывания, специфично направленный против MN-белка, комбинации и способы применения таких антител.
Изобретение относится к молекулярной биологии и генетике клетки. Предложен способ, включающий этапы предварительной экстракции геномной ДНК, выделения специфической фракции однонитевых G-оверхенгов теломерной ДНК и последующей амплификации их минусовой цепи с дуплекс-специфическим анализом, причем этапы амплификации включают модификацию 3'-концов теломерных оверхенгов с помощью терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы и осуществляются с использованием набора праймеров SEQ ID NO: 1-5. Дуплекс-специфический анализ основан на гибридизации минусовых цепей оверхенгов с набором специфических флуоресцентно-меченных зондов SEQ ID NO: 6-11, соответствующих шести возможным вариантам нуклеотидных окончаний G-цепи теломерной ДНК человека. Степень разгорания зондов в присутствии фермента дуплекс-специфической нуклеазы служит критерием присутствия соответствующего варианта нуклеотидного окончания и мерой его количественного содержания. Полученные профили терминальных нуклеотидов G-цепи теломерной ДНК служат пролиферативными маркерами, указывающими на степень активации деления клетки и определяющими временную продолжительность клеточного цикла. Изобретение является новой разновидностью ДНК-диагностики, предназначено для выявления изменений нуклеотидных окончаний ДНК теломерных областей хромосом, происходящих в ходе клеточного цикла, и может быть использовано в медицине для диагностики и лечения онкологических заболеваний, в иммунологии, трансплантологии, косметологии, дерматологии, геронтологии, клеточной биотехнологии и других областях, заинтересованных в оценке пролиферативного статуса клетки и методах его направленного регулирования. 3 н. п. и 12 з. п. ф-лы, 9 ил., 8 табл., 5 пр.

Изобретение относится к области биотехнологии и касается набора, включающего олигодезоксирибонуклеотидные праймеры и флуоресцентно меченный зонд для идентификации ДНК аденовируса серотипов 3, 4, 7, 14, 21 методом гибридизационно-флуоресцентной полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Представленные праймеры и зонд имеют следующую структуру: внешний праймер 5'→3' 5'-AATGTARTTGGGTCTGTTRGGCAT-3' внутренние праймеры 5'→3' 5'-CCCWTCGATGMTGCCCC-3' 5'-TCMACGGGYACRAAGCGCA-3' зонд 5'→3' ROX-CCTGTCCGGCGATGTGCAT-BHQ2. Изобретение обладает более высокой гомологией к циркулирующим в настоящее время аденовирусам и позволяет идентифицировать ДНК аденовируса серотипов 3, 4, 7, 14, 21. 3 ил., 1 табл.

Изобретение относится к области генной инженерии, конкретно к анализу нарушений, связанных с раком яичников, и может быть использовано в медицине. Способ включает определение геномного статуса метилирования CpG-динуклеотидов в каждой последовательности из группы последовательностей SEQ ID NO:1-10 с использованием набора зондов, специфичных для указанных последовательностей и способных гибридизоваться с последовательностью по всей длине. Указанные последовательности используются в составе чипа для детекции, диагностики или мониторинга пролиферативных нарушений, связанных с пролиферацией клеток яичника, а также для детекции предрасположенности к пролиферативным нарушениям или лечения пролиферативных нарушений яичника. Изобретение позволяет проводить идентификацию пролиферативных нарушений в клетках яичника и выявлять генетическую предрасположенность к указанным нарушениям. 4 н. и 6 з.п. ф-лы, 3 ил., 2 табл., 1 пр.

Изобретение относится к области биохимии, в частности к способу специфического отбора высокоаффинных молекул ДНК (ДНК-аптамеров) к рекомбинантному белку-мишени. Указанный способ включает синтез единой полипептидной цепи рекомбинантного белка, содержащего в своем составе фрагмент глютатион-S-трансферазы, целевой белок-мишень, пептидную последовательность, расщепляемую летальным фактором B. anthracis, и пептид, биотинилирующийся in vivo под действием фермента биотин-лигазы E.coli, связывание полученного рекомбинантного полипептида с библиотекой олигонуклеотидов и иммобилизацию белка на парамагнитных частицах, несущих глютатион, промывку парамагнитных частиц с иммобилизованным полипептидом от несвязавшихся олигонуклеотидов в потоке жидкости, отщепление белка-мишени со связанными ДНК-аптамерами с поверхности парамагнитных частиц летальным фактором B. anthracis, выделение и амплификацию аффинной к рекомбинантному белку-мишени последовательности ДНК в полимеразной цепной реакции и получение набора одноцепочечных ДНК-аптамеров, специфичных к белку-мишени. Изобретение позволяет эффективно получать высокоаффинные специфичные ДНК-аптамеры к рекомбинантным белкам-мишеням. 4 ил., 4 пр.

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой выделенную полинуклеотидную молекулу с функцией rEVE, рекомбинантный вектор экспрессии, экспрессионный шаттл-вектор, клетку-хозяина, а также способы с использованием вышеуказанной выделенной полинуклеотидной молекулы. Данная полинуклеотидная молекула с функцией rEVE может быть использована для получения рекомбинантных белков. Данная полинуклеотидная молекула с функцией rEVE содержит рекомбинантный экспрессионный векторный элемент (rEVE), содержащий последовательность нуклеотидных оснований, выбранную из группы, состоящей из последовательности нуклеотидных оснований SEQ ID NO:1, последовательности нуклеотидных оснований SEQ ID NO:2, фрагмента, усиливающего экспрессию, последовательности SEQ ID NO:1, фрагмента, усиливающего экспрессию, последовательности SEQ ID NO:2, последовательности, комплементарной любой последовательности, указанной выше, или их сочетания. Предложенное изобретение позволяет увеличить уровень экспрессии одного или нескольких белков. 8 н. и 26 з.п. ф-лы, 10 ил., 17 табл., 9 пр.

Изобретение относится к области биохимии, в частности к биологическому ДНК маркеру, позволяющему идентифицировать ген Rx у культурного картофеля S. tuberosum и его гомологи у родственных дикорастущих видов рода Solanum sect. Petota. Изобретение позволяет эффективно идентифицировать ген Rx у культурного картофеля S. tuberosum и его гомологи у родственных дикорастущих видов рода Solanum sect. Petota. 2 ил., 1 пр.

Изобретение относится к области биохимии, в частности к набору синтетических олигонуклеотидов для амплификации и последующего секвенирования ITS1-5.8S-ITS2 сосудистых растений, включающего проведение полимеразой цепной реакции с помощью универсальных праймеров со следующим нуклеотидным составом: primer ITS-for CGTAACAAGGTTTCCGTAG, primer ITS-rew GGAATCCTTGTAAGTTTCTTT. Изобретение позволяет эффективно анализировать структуру внутреннего транскрибируемого спейсера рибосомной ДНК сосудистых растений. 1ил.

Изобретение относится к области медицины, а именно к способу выделения ДНК Mycoplasma hominis (М. hominis) для дальнейшего применения в диагностическом алгоритме. Изобретение представляет способ выделения ДНК Mycoplasma hominis из крови путем ее разделения центрифугированием на супернатант и осадок, последующее обогащение исследуемого материала, выделение ДНК методом аффинной сорбции с добавлением сорбента и лизирующего буфера, инкубацию, трехкратную отмывку сорбентного осадка центрифугированием и удаление надосадочной жидкости, высушиванием сорбентного осадка, добавление раствора для элюции ДНК и детекцию ПЦР-методом. Способ отличается тем, что в качестве исследуемого материала используют осадок цельной крови, а его обогащение производят в процессе выделения ДНК путем удвоения числа пробирок на один образец со 100 мкл осадка цельной крови и 20 мкл сорбента в каждой, в которые перед третьей отмывкой добавляют по 375 мкл отмывочного раствора, а их содержимое соединяют в одну пробирку и к сорбентному осадку добавляют раствор для элюции ДНК в количестве 40 мкл. Изобретение обеспечивает повышение точности диагностики M. Hominis. 1 табл.

Изобретение относится к биотехнологии. Способ получения бифидогенного фактора предусматривает выделение дезоксирибонуклеиновой кислоты из биомассы бифидобактерий путем троекратной обработки ультразвуком при частоте 40 кГц в течение 30 мин с последующей хроматографией объединенных супернатантов на сефарозе Sepharose CL-4В. Способ обеспечивает получение высокочистого образца ДНК из биомассы бифидобактерий. Спектрофотометрическая характеристика чистоты выделенной ДНК составляет 1,88. 2 ил., 2 табл., 2 пр.

Группа изобретений относится к области биотехнологии, в частности к антисмысловым олигомерам, используемым в качестве активного ингредиента в фармацевтических композициях для лечения мышечной дистрофии. Антисмысловой олигомер состоит из нуклеотидной последовательности, 100% комплементарной нуклеотидной последовательности-мишени или нуклеотидной последовательности, в которой 1 или 2 нуклеотида, не комплементарные нуклеотидной последовательности-мишени, содержатся в нуклеотидной последовательности, 100% комплементарной нуклеотидной последовательности-мишени. Нуклеотидная последовательность-мишень представляет собой любую из последовательностей, состоящую из нуклеотидов с 32-го по 56-й или с 36-го по 56-й с 5′-конца 53-го экзона в гене дистрофина человека. При этом 53-й экзон в гене дистрофина человека обладает нуклеотидной последовательностью, выбранной из (a) и (b): (a) нуклеотидная последовательность SEQ ID NO: 1 и (b) нуклеотидная последовательность, обладающая по меньшей мере 90% идентичностью с нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 1. Данный олигомер эффективно обеспечивает вызов пропуска 53-го экзона в гене дистрофина человека. 2 н. и 11 з.п. ф-лы, 19 ил., 7 табл., 6 пр.
Наверх