Способ моделирования дормантного состояния mycobacterium tuberculosis in vitro

Изобретение относится к микробиологии и предназначено для моделирования дормантного статуса М. tuberculosis в условиях in vitro. Способ моделирования заключается в генерации дормантного фенотипа микобактерий туберкулеза в жидкой питательной среде в условиях депривации компонентов, необходимых для полноценного роста и размножения М. tuberculosis in vitro. Дормантное состояние М. tuberculosis достигается в интервале между 4 и 11 сутками культивирования микобактерий туберкулеза в модифицированной среде Middlebrook 7Н9, содержащей гидрофосфат натрия (Na2HPO4), дигидрофосфат калия (KH2PO4), сульфат аммония ((NH4)2SO4), L-глютаминовую кислоту (C5H9NO4), цитрат натрия (Na3C6H5O7), сульфат магния (MgSO4), цитрат железа(III)-аммония (Fe(NH4)3(C6H5O7)2), сульфат цинка (ZnSO4), сульфат меди(II) (CuSO4), пиридоксин (C8H11NO3), биотин (C10H16N2O3S), хлорид кальция (CaCl2), глицерин (C3H8O3), Твин-80 (C64H124O26) и дистиллированную воду. Изобретение позволяет упростить способ и может использоваться в экспериментальных и клинических микобактериологических исследованиях. 3 табл., 3 ил.

 

Изобретение относится к микробиологии и может использоваться в клинической и экспериментальной медицине для исследований культур Mycobacterium tuberculosis (М. tuberculosis) в состоянии дормантности, в том числе поиска способов антибактериального воздействия на данный патоген.

Современные представления о дормантности бактерий характеризуют это состояние следующей совокупностью признаков:

- утратой способности к размножению в восприимчивом организме и/или in vitro, определяемой по наличию роста колоний на плотных питательных средах и торможению бактериального роста в жидких питательных средах;

- снижением интенсивности биохимических, энергетических, пластических процессов в бактериальных клетках;

- изменениями типичной морфологии бактериальных клеток;

- а также изменениями экспрессии генов, детерминирующих модификацию метаболических процессов в бактериальных клетках [1-4].

Формирование дормантного фенотипа происходит под воздействием изменения параметров внешней для бактерий среды, в качестве которых могут выступать многие физические, химические, биологические (иммунологические) факторы [2, 5]. Временной интервал, в течение которого бактериальная популяция может находиться в дормантном состоянии, может широко варьировать в зависимости от биологических характеристик микроорганизма и условий его микроокружения. Одним из ключевых признаков дормантного статуса является сохранение бактериальной популяцией или ее частью способности к ресусцитации, т.е. переходу к состоянию активного метаболизма и размножения. Ресусцитация также может наступать вследствие воздействия на бактериальную популяцию внешних стимулов, в том числе удаления фактора, вызвавшего формирование дормантного фенотипа [6].

В клиническом аспекте способность Mycobacterium tuberculosis находиться в дормантном состоянии в клетках зараженного организма создает предпосылки для протекания туберкулезной инфекции в латентной форме (ЛТИ), т.е. без клинических проявлений заболевания и трансмиссии возбудителя. Иммунный ответ, формирующийся при ЛТИ, не приводит к элиминации микобактерий из организма. Состояние ЛТИ может продолжаться длительное время, до нескольких десятков лет [7], неся в себе риски перехода инфекции в активную форму. При переходе в активную форму патоген выходит из состояния функционального покоя, размножается в органах и тканях, индуцирует формирование патоморфологических, в том числе деструктивных изменений, что приводит к развитию заболевания и дальнейшему эпидемическому распространению возбудителя. ЛТИ является наиболее существенным источником активных форм туберкулеза (ТБ) и эпидемического процесса, без воздействия на который невозможно достичь эффективного контроля над данной инфекцией.

Другой клинически важной проблемой является недостижимость полной эрадикации возбудителя из очагов поражения даже при полном клиническом излечении туберкулеза. Локализуясь в посттуберкулезных морфологических изменениях в дормантном состоянии микобактерий туберкулеза (МБТ) обусловливают возможность реактивации специфического патологического процесса и рецидива заболевания [8]. Данную проблему усугубляет феномен лекарственной толерантности дормантных форм М. tuberculosis. Суть его заключается в том, что действие большинства антибактериальных веществ направлено на активно функционирующие и реплицирующиеся бактериальные клетки, и резко ограничено в отношении их дормантных фенотипов [1, 9], что создает препятствия для эффективной этиотропной терапии ТБ и превентивной терапии ЛТИ.

Таким образом, в современных условиях, когда туберкулез остается одной из основных проблем общественного здравоохранения, необходимость поиска эффективного антибактериального воздействия на дормантные формы М. tuberculosis, является крайне актуальным. Моделирование in vitro дормантного состояния МБТ в бактериальных культурах позволит искать новые молекулярные мишени воздействия на данные формы возбудителя и разрабатывать эффективные средства химиотерапии ЛТИ/ТБ.

Известна модель L.G. Wayne, использующая прогредиентную гипоксию для формирования дормантного фенотипа М. tuberculosis в бактериальной культуре в жидкой питательной среде [10]. Недостатком данной модели является неудовлетворительная воспроизводимость, необходимость использования перемешивающих устройств (ротаторов или шейкеров), поддержания герметичных условий культивирования, неудобство отбора аликвот культур и детекции содержания кислорода в питательной среде.

Существуют другие подходы к моделированию дормантного состояния микобактериальных культур. От предлагаемого способа и друг от друга они отличаются тем, что в качестве индуктора дормантного состояния М. tuberculosis in vitro используются различные физико-химические факторы: оксид азота (NO) [11], оксид углерода (СО) [12], низкий рН среды [13, 14], высокая концентрация липидов в среде [15]. Недостатком этих методов является необходимость внесения в культуралные среды дополнительных агентов (DETA/NO, аскорбиновой кислоты, MOPS, комплекса жирных кислот и холестерола), необходимость использования газогенерирующего оборудования, шейкеров, кратковременность (менее 1 суток) поддержания дормантного состояния МБТ после устранения воздействия, или, наоборот, необходимость длительной (от 3 до 6 месяцев) инкубации культур.

Известна "мультистрессовая" модель дормантности М. tuberculosis [16], основанная на длительном (18 суток) одновременном воздействии на микобактериаальную культуру нескольких факторов: низкого содержания кислорода (5%), высокого уровня углекислого газа (10%), низкой концентрации нутриентов в питательной среде (использование 10%-ной среды Дюбо) и низкого уровня рН (5,0). Многофакторность воздействия значительно усложняет воспроизведение данной модели и требует больших материальных затрат.

Известны два способа моделирования дормантных форм микобактерий с помощью генетически трансформированных либо мутантных культур. Один из них предлагает использование рекомбинантной плазмидной ДНК pMind-vapC с нуклеотидной последовательностью, кодирующей ген vapC MSMEG_1284 [17]. Этот способ предназначен для получения только дормантных форм М. smegmatis и не может использоваться в моделях дормантности М. tuberculosis. Кроме того, осуществление данного способа требует проведения дорогостоящих многоэтапных лабораторных манипуляций для получения генетически трансформированной культуры микобактериальных клеток. Второй способ предлагает культивирование стрептомицин-зависимого штамма М. tuberculosis 18b со специфической мутацией (инсерция цитозина в области 530 петли рРНК), но он не может использоваться для других штаммов и изолятов МБТ, не имеющих данной мутации [18].

Существуют модель старвации J.C. Bett и соавт. [19] и модель Салиной Е.Г. и соавт., основанная на культивировании М. tuberculosis в среде Сотона с дефицитом ионов калия. [20]. В старвационной модели, в отличие от заявляемой нами, используется инкубация МБТ в фосфатно-солевом буфере в течение 6 недель. При этом, по данным авторов, снижалась респираторная активность М. tuberculosis и изменялись уровни экспрессии некоторых белков микобактериальными клетками, но не изменялась способность МБТ к росту на плотных питательных средах, что не позволяет отнести полученный фенотип М. tuberculosis к истинно дормантным. Способ, описанный Салиной Е.Г. и соавт., имеет следующие существенные отличия от предлагаемого нами. Во-первых, для моделирования дормантного состояния М. tuberculosis Салина Е.Г. и соавт. применяют питательную среду принципиально другого состава - модифицированную среду Сотона с дефицитом ионов калия, который не встречается в условиях in vivo изолированно. Во-вторых, способ Салиной Е.Г. и соавт. требует более длительных (от 40 суток) сроков для осуществления.

Известна жидкая питательная среда (бульон) Middlebrook 7Н9 следующего состава:

На 1,0 л дистиллированной воды:

Альбумин бычьей сыворотки 5,0 г
Гидрофосфат натрия (Na2HPO4) 2,5 г
Декстроза (C6H12O6) 2,0 г
Дигидрофосфат калия (KH2PO4) 1,0 г
Хлорид натрия (NaCl) 0,85 г
Сульфат аммония ((NH4)2SO4) 0,5 г
L-глютаминовая кислота (C5H9NO4) 0,5 г
Цитрат натрия (Na3C6H5O7) 0,1 г
Сульфат магния (MgSO4) 0,05 г
Цитрат железа(III)-аммония (Fe(NH4)3(C6H5O7)2) 0,04 г
Каталаза 0,003 г
Сульфат цинка (ZnSO4) 0,001 г
Сульфат меди(II) (CuSO4) 0,001 г
Пиридрксин (C8H11NO3) 0,001 г
Биотин (C10H16N2O3S) 0,0005 г
Хлорид кальция (CaCl2) 0,0005 г
Глицерин (C3H8O3) 2,0 мл [21, 22].

Данная среда представляет собой неселективную питательную среду для культивирования микобактерий и не предназначена для получения дормантных форм М. tuberculosis.

Предлагаемый способ моделирования дормантного состояния Mycobacterium tuberculosis in vitro представляет собой получение дормантного фенотипа М. tuberculosis в интервале между 4 и 11 сутками инкубации в модифицированной среде Middlebrook 7Н9 следующего состава:

Гидрофосфат натрия (Na2HPO4) 2,5 г
Дигидрофосфат калия (KH2PO4) 1,0 г
Сульфат аммония ((NH4)2SO4) 0,5 г
L-глютаминовая кислота (C5H9NO4) 0,5 г
Цитрат натрия (Na3C6H5O7) 0,1 г
Сульфат магния (MgSO4) 0,05 г
Цитрат железа(III)-аммония (Fe(NH4)3(C6H5O7)2) 0,04 г
Сульфат цинка (ZnSO4) 0,001 г
Сульфат меди(II) (CuSO4) 0,001 г
Пиридрксин (C8H11NO3) 0,001 г
Биотин (C10H16N2O3S) 0,0005 г
Хлорид кальция (CaCl2) 0,0005 г
Глицерин (C3H8O3) 2,0 мл
Твин-80 (C64H124O26) 0,5 мл
Вода дистиллированная до 1,0 л,

в которой индуктором дормантного фенотипа М. tuberculosis является депривация альбумина бычьей сыворотки, декстрозы, хлорида натрия и каталазы. Способ прост в осуществлении, не требует специального оборудования и дополнительных материальных ресурсов. Возможность использования в модели унифицированных сред Middlebrook 7Н9 промышленного производства позволяет получать воспроизводимые результаты моделирования.

Способ осуществляют следующим образом.

Для приготовления модифицированной питательной среды можно использовать два подхода:

1. Модифицированную питательную среду готовят из навесок следующих компонентов:

Гидрофосфат натрия (Na2HPO4) 2,5 г
Дигидрофосфат калия (KH2PO4) 1,0 г
Сульфат аммония ((NH4)2SO4) 0,5 г
L-глютаминовая кислота (C5H9NO4) 0,5 г
Цитрат натрия (Na3C6H5O7) 0,1 г
Сульфат магния (MgSO4) 0,05 г
Цитрат железа(III)-аммония (Fe(NH4)3(C6H5O7)2) 0,04 г
Сульфат цинка (ZnSO4) 0,001 г
Сульфат меди(II) (CuSO4) 0,001 г
Пиридрксин (C8H11NO3) 0,001 г
Биотин (C10H16N2O3S) 0,0005 г
Хлорид кальция (CaCl2) 0,0005 г
Глицерин (C3H8O3) 2,0 мл
Твин-80 (C64H124O26) 0,5 мл

добавляют до 1 л. дистиллированной воды, перемешивают до полного растворения, разливают по флаконам в необходимых объемах, стерилизуют автоклавированием при 121°С в течение 10 минут, рН готовой среды - 6,8±0,3.

2. Если модифицированную питательную среду для получения дормантных форм М. tuberculosis готовят из сухой основы среды Middlebrook 7Н9 промышленного производства, то следует навеску сухой основы растворить в дистиллированной воде в соответствии с указаниями производителя, добавить 0,2 об % глицерина и исключить введение в среду добавки ADC. Стерилизацию среды проводят автоклавированием при 121°С в течение 10 минут. рН готовой среды - 6,8±0,3.

Дормантный фенотип М. tuberculosis был получен следующим путем. Модифицированную (депривированную) питательную среду инокулировали суспензией клеток референтного штамма М. tuberculosis H37Rv в физиологическом растворе в концентрации 9,0×108-1,0×109 микробных клеток на миллилитр (мкр кл/мл). Суспензию готовили из бактериальной массы колоний 25-30 дневной культуры (соответствует логарифмической фазе роста), полученной на среде Левенштейна-Йенсена. Итоговая концентрация микробных клеток в депривированной среде может варьировать в пределах 1×106-5×109, в зависимости от цели получения дормантной культуры МБТ; нами использовалась концентрация 2,0×108 мкр кл/мл среды. Инкубацию проводили при 37°С в течение 30 сут. В качестве контроля использовали культуру М. tuberculosis H37RV в стандартной питательной среде Middlebrook 7Н9 в той же концентрации.

Для оценки статуса МБТ в депривированной (экспериментальной) и контрольной культурах начиная со 2 суток инкубации с периодичностью в 1-3 суток: 1) измеряли оптическую плотность исследуемых культур в единицах McFarland (OD600) с помощью нефелометра BD PhoenixSpec (Becton Dickinson); 2) выполняли высевы на стандартную жидкую питательную среду Middlebrook 7Н9, по 500 мкл, и на плотную питательную среду - агар Middlebrook 7Н10, по 20 мкл. Регистрацию высевов на агаре осуществляли по наличию видимого роста с подсчетом количества колониеобразующих единиц (КОЕ) и учетом сроков их появления. Регистрацию характера роста микобактерий в жидкой питательной среде осуществляли в автоматизированной системе культивирования ВАСТЕС 960 MGIT (Becton Dickinson) с учетом сроков его появления и величины индекса роста (ИР). Поскольку ИР в системе ВАСТЕС 960 MGIT прямо пропорционален интенсивности потребления кислорода микроорганизмами [23], по его величине можно судить об интенсивности энергетического метаболизма МБТ. Оценивали также морфологию микобактериальных клеток экспериментальных и контрольных культур микроскопией мазков с окраской по Цилю-Нельсену. Критериями дормантного состояния М. tuberculosis были: 1) торможение прироста бактериальной массы в жидкой культуре, определяемое по динамике величины OD600; 2) неспособность к росту на плотных средах; 3) способность к восстановлению роста на жидких и плотных средах (ресусцитации) после удаления фактора дормантности - при пересеве дормантной культуры в стандартную жидкую питательную среду и/или при добавлении к дормантной культуре компонентов, ранее удаленных из среды (устранения депривации), с последующей инкубацией; 4) изменения морфологии микобактериальных клеток, как дополнительный критерий.

Результаты измерений параметра OD600, представленные на рис. 1, демонстрируют, что за 30-дневный период оптическая плотность экспериментальных культур почти не менялась (SD 0,03, range - 0,12); динамика значений оптической плотности контрольных культур соответствовала классической кривой бактериального роста в бульонной культуре [24]. Таким образом, по данному параметру прироста бактериальной массы МБТ в условиях депривированной питательной среды не наблюдалось, что свидетельствует об отсутствии репликации микобактериальных клеток.

По результатам высевов на плотные среды (таблица 1), депривированные культуры демонстрировали выраженное снижение способности к размножению в течение 2 и 3 суток депривации, начиная с 4 суток - роста на агаре не было. Контрольные культуры в течение всего срока наблюдения давали на агаре сплошной рост колоний в течение 5-6 суток.

По результатам высевов на жидкие среды (ВАСТЕС) экспериментальные культуры сохраняли способность к восстановлению до 10-11 дня депривации (таблица 2). При этом время до детекции роста составляло в экспериментальных культурах 16-29 суток против 1,5-2,5 суток в контрольных культурах. После 12 дней депривации роста (восстановления) МБТ на жидких средах не наблюдалось.

Динамика потребления кислорода, регистрируемая по показателю индекса роста ВАСТЕС, также существенно различалась в контрольных, с разным сроком предварительной инкубации в стандартной среде, и экспериментальных культурах (рис. 2). Низкий уровень потребления кислорода и выраженное замедление темпов восстановления депривированных культур при пересеве их в стандартную полносоставную среду свидетельствует о низкой интенсивности протекания окислительно-восстановительных реакций и, соответственно, низкой интенсивности энергетического метаболизма (дыхания) М. tuberculosis, являющихся облигатными аэробами.

Устранение депривации путем добавления к экспериментальным культурам недостающих компонентов также приводило к восстановлению их способности к росту на плотных и жидких средах. Альбумин бычьей сыворотки, декстроза, каталаза, натрия хлорид были добавлены к экспериментальным культурам после 4 и 8 суток депривации до достижения концентраций, соответствующих концентрациям данных компонентов в стандартной среде Middlebrook 7Н9 и инкубированы дополнительно в течение 4 и 8 суток соответственно. Аликвоты восстановленных культур 20 мкл и 500 мкл высевали на агар Middlebrook 7Н10 и бульон Middlebrook 7Н9 ВАСТЕС MGIT соответственно, результаты высевов представлены в таблице 3.

* - в пересчете на 1 мл высева; ** - ПС- плотные среды; *** - ЖС-жидкие среды

То есть добавление в депривированную среду недостающих компонентов после 4 суток депривации и последующие 4 суток ресусцитации и 8/8 суток депривации/ресусцитации приводили к восстановлению способности М. tuberculosis к размножению на жидких средах через 11-8 и 9-5 суток соответственно, а на плотных средах - в сроки 17-12 и 12-5 суток соответственно. Чем дольше было время инкубации МБТ в восстановленной среде после устранения депривации, тем быстрее был переход к состоянию активного размножения при пересеве (таблица 3).

Микроскопическое исследование выявило изменение морфологии МБТ экспериментальных культур по сравнению с контрольными в виде явного преобладания МБТ с меньшей длиной клетки (рис.3).

Таким образом, культивирование М. tuberculosis в бульоне Middlebrook 7Н9 в условиях депривации альбумина бычьей сыворотки, декстрозы, каталазы, хлорида натрия, приводит к формированию фенотипа, характерного для дормантного статуса МБТ. Дормантное состояние МБТ сохраняется и является обратимым к активной репликации в интервале с 4 по 11 сутки культивирования в депривированной питательной среде. Следовательно, предложенный способ моделирует дормантное состояние М. tuberculosis в условиях in vitro.

Предлагаемый способ моделирования дормантного состояния Mycobacterium tuberculosis in vitro в модифицированной питательной среде Middlebrook 7Н9 следующего состава:

Гидрофосфат натрия (Na2HPO4) 2,5 г
Дигидрофосфат калия (KH2PO4) 1,0 г
Сульфат аммония ((NH4)2SO4) 0,5 г
L-глютаминовая кислота (C5H9NO4) 0,5 г
Цитрат натрия (Na3C6H5O7) 0,1 г
Сульфат магния (MgSO4) 0,05 г
Цитрат железа(III)-аммония (Fe(NH4)3(C6H5O7)2) 0,04 г
Сульфат цинка (ZnSO4) 0,001 г
Сульфат меди(II) (CuSO4) 0,001 г
Пиридрксин (C8H11NO3) 0,001 г
Биотин (C10H16N2O3S) 0,0005 г
Хлорид кальция (CaCl2) 0,0005 г
Глицерин (C3H8O3) 2,0 мл
Твин-80 (C64H124O26) 0,5 мл
Вода дистиллированная до 1,0 л,

позволяет получить дормантный фенотип данного патогена в бульонной культуре с минимальными материально-техническими затратами и доступен для любой лаборатории, выполняющей культуральные исследования микобактерий туберкулеза. Предлагаемая модель может использоваться для любых исследований in vitro и/или in vivo (на экспериментальных животных) с целью изучения физических, молекулярно-генетических, биохимических и других характеристик дормантного статуса МБТ, поиска способов бактерицидного воздействия на дормантные формы М. tuberculosis различных антибактериальных агентов (антибиотиков, дезинфектантов, физических факторов среды и т.п.), а также для изучения иммунологических и патогенетических реакций организма в экспериментальных моделях латентной туберкулезной инфекции in vivo. Возможность использования для получения дормантного фенотипа М. tuberculosis стандартизированной по составу питательной среды Middlebrook 7Н9, в том числе промышленного производства, позволяет получать результаты исследований с высокой воспроизводимостью.

Список литературы

1. Фтизиатрия, национальное руководство / под ред. М.И. Перельмана. - М. ГЭОТАР-Медна, 2007. - 512 с

2. Zhang Y. Persistent and dormant tubercle bacilli and latent tuberculosis. Frontiers Bioscience, 1 (9): pp. 1136-1156.

3. Rittershaus E.S., Baek S.H., Sassetti C.M. The normalcy of dormancy: common themes in microbial quiescence. Cell Host Microbe. 2013 Jun 12; 13 (6): 643-51. doi: 10.1016/j.chom.2013.05.012.

4. Lipworth S., Hammond R.J., Baron V.O., Hu Y., Coates A., Gillespie S.H. Defining dormancy in mycobacterial disease. Tuberculosis (Edinb). 2016 Jul; 99: 131-42. doi: 10.1016/j.tube.2016.05.006.

5. Gengenbacher M., Kaufmann S.H. Mycobacterium tuberculosis: success through dormancy. FEMS Microbiol Rev. 2012 May; 36 (3): 514-32. doi: 10.1111/j.1574-6976.2012.00331.x.

6. Dworkin J., Shah I.M. Exit from dormancy in microbial organisms. Nat Rev Microbiol. 2010 Dec; 8 (12): 890-6. doi: 10.1038/nrmicro2453.

7. Lillebaek Т., Dirksen A., Vynnycky E., Baess I., Thomsen V., Andersen A.B. Stability of DNA patterns and evidence of Mycobacterium tuberculosis reactivation occurring decades after the initial infection. J Infect Dis. 2003 Oct 1; 188 (7): 1032-9.

8. J.A., Houben R.M., Crampin A.C., Mzembe Т., Mallard K., Coll F. et al. Recurrence due to relapse or reinfection with Mycobacterium tuberculosis: a whole-genome sequencing approach in a large, population-based cohort with a high HIV infection prevalence and active follow-up. J Infect Dis. 2015 Apr l; 211 (7): 1154-63. doi: 10.1093/infdis/jiu574.

9. Warner D.F., Mizrahi V. Tuberculosis chemotherapy: the influence of bacillary stress and damage response pathways on drug efficacy. Clin Microbiol Rev. 2006 Jul; 19 (3): 558-70.

10. Wayne L.G., Hayes L.G. An in vitro model for sequential study of shiftdown of Mycobacterium tuberculosis through two stages of nonreplicating persistence. Infect Immun. 1996 Jun; 64 (6): 2062-9.

11. Voskuil M.I., Schnappinger D., Visconti K.C., Harrell M.I., Dolganov G.M., Sherman D.R., Schoolnik G.K. Inhibition of respiration by nitric oxide induces a Mycobacterium tuberculosis dormancy program. J Exp Med. 2003 Sep 1; 198 (5): 705-13.

12. Shiloh M.U., Manzanillo P., Cox J.S. Mycobacterium tuberculosis senses host-derived carbon monoxide during macrophage infection. Cell Host Microbe. 2008 May 15; 3 (5): 323-30. doi: 10.1016/j.chom.2008.03.007.

13. Кудыкина Ю.К. рН-индуцируемое образование покоящихся форм микобактерий и роль аденилатциклазы в их реактивации, автореф. дис…. канд. мед. наук: 03.01.04 - биохимия / Ю.К. Кудыкина - Москва, 2011. - 24 с.

14. Taneja N.K., Dhingra S., Mittal A., Naresh M., Tyagi J.S. Mycobacterium tuberculosisTranscriptional Adaptation, Growth Arrest and Dormancy Phenotype Development Is Triggered by Vitamin C. PLoS ONE. 2010 5 (5): e10860. doi:10.1371/journal.pone.0010860.

15. Aguilar-Ayala D.A., Tilleman L., Van Nieuwerburgh F., Deforce D., Palomino J.C., Vandamme P. et al. The transcriptome of Mycobacterium tuberculosis in a lipid-rich dormancy model through RNAseq analysis. Sci Rep. 2017 Dec 15; 7 (1): 17665. doi: 10.1038/s41598-017-17751-х.

16. US 8551499 B2 Oct. 8, 2013.

17. RU 2524143 C2, 27.04.2014.

18. Sala C., Dhar N., Hartkoorn R.C., Zhang M., Ha Y.H., Schneider P., Cole S.T. Simple model for testing drugs against nonreplicating Mycobacterium tuberculosis. Antimicrob Agents Chemother. 2010 Oct; 54 (10): 4150-8. doi: 10.1128/AAC.00821-10.

19. Betts J.C., Lukey P.T., Robb L.C., McAdam R.A., Duncan K. Evaluation of a nutrient starvation model of Mycobacterium tuberculosis persistence by gene and protein expression profiling. Mol Microbiol. 2002 Feb; 43 (3): 717-31.

20. Salina E.G., Waddell S.J., Hoffmann N., Rosenkrands I., Butcher P.D., Kaprelyants A.S. Potassium availability triggers Mycobacterium tuberculosis transition to, and resuscitation from, non-culturable (dormant) states. Open Biol. 2014 Oct; 4 (10). pii: 140106. doi: 10.1098/rsob.l40106.

21. Middlebrook, G. 1955. Fitzsimmons Army Hospital Report No. 1, Denver, Colorado.

22. Middlebrook, G., M.L. Cohn. Bacteriology of Tuberculosis: Laboratory Methods. Am J Public Health Nations Health. 1958 Jul; 48 (7): 844-853.

23. Siddiqi S.H., Rusch-Gerdes S. Руководство по работе с Системой ВАСТЕС MGIT 960. FIND, 2006.

24. Шлегель Г. Общая микробиология. М.: Мир, 1987. - 567 с.

Способ моделирования дормантного состояния Mycobacterium tuberculosis in vitro, заключающийся в получении дормантного фенотипа М. tuberculosis в интервале между 4 и 11 сутками культивирования их в модифицированной жидкой питательной среде Middlebrook 7Н9 следующего состава:

Гидрофосфат натрия (Na2HPO4) 2,5 г
Дигидрофосфат калия (KH2PO4) 1,0 г
Сульфат аммония ((NH4)2SO4) 0,5 г
L - глютаминовая кислота (C5H9NO4) 0,5 г
Цитрат натрия (Na3C6H5O7) 0,1 г
Сульфат магния (MgSO4) 0,05 г
Цитрат железа(III)-аммония (Fe(NH4)3(C6H5O7)2) 0,04 г
Сульфат цинка (ZnSO4) 0,001 г
Сульфат меди(II) (CuSO4) 0,001 г
Пиридоксин (C8H11NO3) 0,001 г
Биотин (C10H16N2O3S) 0,0005 г
Хлорид кальция (CaCl2) 0,0005 г
Глицерин (C3H8O3) 2,0 мл
Твин-80 (C64H124O26) 0,5 мл
Вода дистиллированная до 1,0 л



 

Похожие патенты:

Изобретение относится к биотехнологии. Предлагается штамм микроводорослей Chlorella vulgaris, депонированный в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институт физиологии растений им.
Изобретение относится к микробиологии, в частности к бактериологии. Штамм Escherichia coli O144:Н45, характеризующийся отсутствием генов, кодирующих факторы патогенности, специфичных для Shigella spp.

Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано для определения уровня заселенности почв грибами родов Pythium, Fusarium и Helminthosporium возбудителей питиозной, фузариозной и обыкновенной корневых и прикорневых гнилей сельскохозяйственных культур.

Генотерапевтический днк-вектор на основе генотерапевтического днк-вектора vtvaf17, несущий целевой ген, выбранный из группы генов col1a1, col1a2, bmp2, bmp7, для повышения уровня экспрессии этих целевых генов, способ его получения и применения, штамм escherichia coli scs110-af/vtvaf17- col1a1 или escherichia coli scs110-af/vtvaf17- col1a2 или escherichia coli scs110-af/vtvaf17- bmp2 или escherichia coli scs110-af/vtvaf17- bmp7, несущий генотерапевтический днк-вектор, способ его получения, способ производства в промышленных масштабах генотерапевтического днк-вектора // 2707537
Изобретение относится к генной инженерии. Описан генотерапевтический ДНК-вектор на основе генотерапевтического ДНК-вектора VTvaf17, несущий целевой ген, выбранный из группы генов COL1A1, COL1A2, ВМР2, ВМР7, для повышения уровня экспрессии этого целевого гена в организме человека и животных, при этом генотерапевтический ДНК-вектор VTvaf17-COL1A1, или VTvaf17- COL1A2, или VTvaf17- ВМР2, или VTvaf17-ВМР7 имеет нуклеотидную последовательность SEQ ID №1 или SEQ ID №2 или SEQ ID №3 или SEQ ID №4 соответственно.

Изобретение относится к области биотехнологии. Штамм Rhodococcus ruber ИЭГМ 346, обладающий способностью полностью деструктировать диклофенак натрия, депонирован в Национальном биоресурсном центре - Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов (НБЦ ВКПМ) ФГБУ ГосНИИгенетика НИЦ «Курчатовский институт» под регистрационным номером ВКПМ Ас-2106.

Изобретение относится к биотехнологии, генной инженерии, медицинской микробиологии. Предложена рекомбинантная плазмида pHFQ2.21, экспрессирующая клонированный ген hfq (шаперона) Vibrio cholerae 01 биовара El Tor, встроенный по сайтам Bam HI-PstI в полилинкер векторной плазмиды pQE30, под контролем Т5-промотора.

Изобретение относится к области биотехнологии и генной инженерии. Предложен способ получения штамма Е.

Изобретение относится к биотехнологии. Предложен способ повышения продуктивности бактерий Escherichia coli.

Изобретение относится к биотехнологии. Микробный препарат содержит смесь предварительно высушенных до влажности не более 10% штаммов Rhodococcus erythropolis BKM Ас-2784D, Acinetobacter guillouiae B-3216D, Acinetobacter guillouiae B-3217D в равных объемах с содержанием каждого компонента не менее 1×107 KOE/г.
Изобретение относится к микробиологии, в частности к бактериологии. Штамм Escherichia coli O144:Н45, характеризующийся отсутствием генов, кодирующих факторы патогенности, специфичных для Shigella spp.

Изобретение относится к области биохимии, в частности к штамму бактерий Leptospira interrogans серогруппы Canicola серовара canicola для детекции антител к L. canocola.

Изобретение относится к области биотехнологии. Штамм Rhodococcus ruber ИЭГМ 346, обладающий способностью полностью деструктировать диклофенак натрия, депонирован в Национальном биоресурсном центре - Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов (НБЦ ВКПМ) ФГБУ ГосНИИгенетика НИЦ «Курчатовский институт» под регистрационным номером ВКПМ Ас-2106.

Изобретение относится к микробиологической промышленности и может быть использовано для получения белковой биомассы. Предлагается штамм бактерий Methylococcus capsulatus, депонированный во Всероссийской коллекции микроорганизмов ИБФМ им.

Изобретение относится к иммунобиотическому комплексу для нормализации кишечной микрофлоры организма. Указанный комплекс включает сухую микробную массу живых бактерий и биологически активные вещества (БАВ).

Изобретение относится к микробиологии. Способ производства сухих солей желчных кислот из нативной желчи крупного рогатого скота предусматривает осветление нативной желчи путем добавления активированного угля, прогреванием смеси до заданной температуры и охлаждением с последующей фильтрацией с получением осветленной желчи.

Изобретение относится к биотехнологии. Штамм лактобактерий Enterococcus hirae Т-8 13-2018, обладающий способностью продуцировать молочную кислоту и высокой антагонистической активностью по отношению к условно-патогенной и патогенной микрофлоре депонированный под регистрационным номером ВКПМ В-13055.

Изобретение относится к микробиологии. Изобретение касается нового штамма (вида) микроорганизма – продуцента актифенола.

Изобретение относится к микробиологии и предназначено для моделирования дормантного статуса М. tuberculosis в условиях in vitro. Способ моделирования заключается в генерации дормантного фенотипа микобактерий туберкулеза в жидкой питательной среде в условиях депривации компонентов, необходимых для полноценного роста и размножения М. tuberculosis in vitro. Дормантное состояние М. tuberculosis достигается в интервале между 4 и 11 сутками культивирования микобактерий туберкулеза в модифицированной среде Middlebrook 7Н9, содержащей гидрофосфат натрия, дигидрофосфат калия, сульфат аммония 2SO4), L-глютаминовую кислоту, цитрат натрия, сульфат магния, цитрат железа-аммония 32), сульфат цинка, сульфат меди, пиридоксин, биотин, хлорид кальция, глицерин, Твин-80 и дистиллированную воду. Изобретение позволяет упростить способ и может использоваться в экспериментальных и клинических микобактериологических исследованиях. 3 табл., 3 ил.

Наверх