Способ идентификации личности и установления родства с помощью indel полиморфизмов и набор синтетических олигонуклеотидов для их генотипирования
Изобретение относится к биотехнологии и касается набора коротких биаллельных инсерционно-делеционных (InDel) полиморфизмов в геноме человека, а также к способу генотипирования для идентификации личности и установления кровного родства. Набор для генотипирования включает композицию, образованную парами праймеров для 162 InDel локусов, позволяющую проводить мультиплексную ПЦР. Также в композицию для генотипирования входят аллельспецифичные олигонуклеотидные зонды для гибридизационного анализа. Праймеры подобраны таким образом, чтобы ПЦР-продукт имел минимальную длину, что позволяет успешно анализировать деградированные образцы ДНК. Изобретение позволяет идентифицировать личность и устанавливать родство с существенно более высокой достоверностью в сравнении с аналогами. 7 з.п. ф-лы, 3 ил., 2 табл., 1 пр.
Область техники, к которой относится изобретение
Изобретение относится к области молекулярной генетики, биотехнологии, молекулярной биологии, судебной медицины и криминалистики, относится к набору синтетических олигонуклеотидных праймеров для проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР), а также синтетических олигонуклеотидных ДНК-зондов для последующей гибридизации. Изобретение может быть использовано для идентификации личности и определения кровного родства путем генотипирования 162 инсерционно-делеционных (InDel) полиморфизмов в образцах ДНК человека.
Уровень техники
Актуальной проблемой криминалистики и судебно-медицинской экспертизы является идентификация личности (преступника, жертв преступлений, катастроф, обнаруженных останков, и т.д.). Учитывая достижения пластической хирургии, визуальная идентификация уже не является полностью надежной. Наиболее достоверным способом идентификации личности в современной судебно-медицинской практике является сравнительный анализ ДНК исследуемых биологических образцов. Полное сравнение генетического материала является избыточным, поэтому для исследования используются отдельные полиморфные локусы ДНК, отличающиеся у разных людей в популяции. Подавляющее большинство существующих в настоящее время способов генетической идентификации личности используют индивидуальные различия людей по трем типам маркеров:
STR (англ. short tandem repeat, короткий тандемный повтор), представляющим собой участки ДНК, содержащие небольшие мотивы, повторяющиеся различное число раз (например TAAG-TAAG-TAAG-…);
SNP (англ. single nucleotide polymorphism, однонуклеотидный полиморфизм), представляющим собой вариации одного нуклеотида;
InDel (сокр. от англ. Insertion/Deletion, инсерционно-делеционный полиморфизм) - биаллельный маркер, представляющий собой наличие (инсерция), либо отсутствие (делеция) одного или более нуклеотидов.
Наиболее старый и широко применяемый метод генетической идентификации использует индивидуальные различия людей в длине STR-локусов. Число повторов в одном локусе представляет собой определенный аллель, вариантов которого в популяции несколько. К примеру, каждый из 15 локусов, входящих в коммерческий набор PowerPlex® 16 (Promega Corporation, USA), имеет от 8 до 20 аллелей в российской популяции [1]. И, хотя, отдельный аллель не является строго индивидуальной характеристикой, сочетание 15 аллелей таких полиморфных локусов создает генетический профиль, являющийся высокоспецифичной характеристикой человека. Мерой уникальности генетического профиля принято считать показатель MP (англ. match probability - вероятность случайного совпадения): чем меньше его значение, тем выше идентифицирующий потенциал. МР современных коммерческих наборов для идентификации по STR-локусам составляет от 1⋅10-14 до 1⋅10-17.
Метод генетической идентификации по STR-локусам хорошо себя зарекомендовал, однако, есть несколько проблем, снижающих его ценность, и решение которых является актуальной задачей. Во-первых, известные нам наборы для идентификации по STR-локусам обеспечивают недостаточное значение МР при установлении кровного родства и исследовании сложных образцов (деградированная ДНК, малые количества ДНК) [2,3].
Второй недостаток связан с большой длиной локусов, подвергающихся генотипированию. В судебной экспертной практике ДНК большинства исследуемых биологических объектов фрагментирована, вследствие воздействия биологических и физических факторов среды. Особенно это актуально при исследовании останков, долгое время находившихся в земле. Вероятность успешного анализа такой деградированной ДНК зависит от длины исследуемых локусов, входящих в конкретный набор для идентификации: чем сильнее фрагментирована ДНК, тем короче должны быть таргетные локусы, использующиеся для идентификации. К примеру, длины STR-локусов российского набора для генотипирования COrDIS, находятся в диапазоне от 66 нуклеотидов (локус TPOX) до 450 нуклеотидов (локус D22S1045). И, если, 66 нуклеотидов - это вполне достаточный размер для анализа деградированных образцов, то вероятность успешного исследования локуса, размером в 450 нуклеотидов, резко снижается, что приведет к выпадению аллели, либо всего локуса. Понимание этой проблемы стимулировало разработку наборов, основанных на мини-STR или микросаттелитах, с размерами целевых локусов 70-280 нуклеотидов [4]. Однако, фундаментальным решением этой проблемы является переход к самому короткому типу маркеров - к однонуклеотидным (SNP) и коротким инсерционно-делеционным (InDel) полиморфизмам.
Третья проблема, связана с самой методикой электрофоретической регистрации результатов STR-анализа. При превышении определенной концентрации исследуемой ДНК, возникает т.н. перегруженность: расширяется детектируемый пик длины продукта и становится невозможно точно определить аллель. Ограничение по максимальному количеству исследуемой ДНК требует предварительного измерения и нормализации ее концентрации, что дополнительно усложняет эту рутинную методику, призванную быть максимально простой. Также, ограничением методики является высокая частота мутирования STR-маркеров (10-3 - 10-4 на поколение[5]), что может приводить к неверной интерпретации экспертиз кровного родства.
Как уже было выше сказано, применение коротких маркеров существенно повышает шансы при экспертизах деградированной ДНК. Кроме того, частота мутирования SNP-маркеров в 10 000 - 1 000 000 раз ниже, чем у STR-маркеров [6], что нивелирует риск ошибок при интерпретации экспертиз родства. И финальным аргументом в пользу применения SNP- и InDel-маркеров для генетической идентификации личности, является большое разнообразие методов их генотипирования с помощью гибридизации. Эти методы проще в применении, более производительны, не требуют нормализации концентрации ДНК, что существенно сокращает время и затраты на проведение экспертиз.
Следует также отметить ограничения, которые препятствовали внедрению SNP- и InDel-маркеров в судебно-медицинскую экспертизу. Во-первых, аллели SNP-маркеров представляют собой вариации всего одного нуклеотида. Детектирование гибридизационным методом такого малого различия требует очень точного подбора длины и структуры аллель-специфичных зондов, и это составляет проблему. Для InDel-маркеров такой проблемы не существует, они отлично генотипируются гибридизационными методами, т.к. менее требовательны к точности подбора аллель-специфичных зондов. При этом они сохраняют все достоинства (частоте мутирования, размерам), присущие SNP. Второй недостаток, в сравнении с мультиаллельными STR, - это биаллельная природа, как SNP-, так и InDel-маркеров. Это означает, что для получения столь же уникального генетического профиля, биаллельных маркеров потребуется в 3 раза больше. И здесь возникает новая проблема: увеличение количества маркеров требует соответствующего роста мультиплексности ПЦР. Известно, что увеличение мультиплексности ПЦР повышает конкуренцию между праймерами, что приводит к нестабильности результатов. Нам удалось решить проблему подбора праймеров для ПЦР с очень высокой мультиплексностью. Решение этой проблемы лежит в области точного подбора ПЦР-праймеров для одновременной амплификации нескольких сотен локусов и определяет высокий уровень техники настоящего изобретения.
Настоящее изобретение основано на применении InDel-маркеров, и далее приведен ряд известных решений, использующих InDel-маркеры для идентификации личности.
1. Набор для генотипирования InDel- полиморфизмов на человеческих эухромосомах и Y-хромосоме [7]. Изобретение раскрывает набор для амплификации 47 InDel локусов в аутосомах человека и 2 локусов Y-хромосомы для идентификации половой принадлежности. Набор, раскрываемый в данном изобретении, по заявлению самих авторов, подходит для проведения идентификации среди китайцев. Т.е. маркеры подобраны исходя из частот аллелей в китайской популяции. Протяженность амплифицируемых фрагментов составляет до 200 нуклеотидов, что будет препятствовать успешному анализу деградированной ДНК: учитывая малый размер самих маркеров (от одного до нескольких нуклеотидов), авторы могли бы подобрать праймеры для амплификации более коротких фрагментов, в среднем менее 100 нуклеотидов, если бы использовали для детекции результатов электрофоретическую подвижность, а гибридизационный метод. В связи с трудностью достижения высокой мультиплексности ПЦР, амплификация 49 локусов одного исследуемого образца ДНК происходит в пяти полимеразных цепных реакциях.
Таким образом, к недостаткам данного изобретения следует отнести этническую специфичность панели маркеров, большую длину амплифицируемых фрагментов, необходимость постановки пяти мультиплексных ПЦР (что увеличивает не только стоимость и трудоемкость анализа, но и порой делает экспертизу невозможной, вследствие малого количества ДНК, обнаруживаемого на месте преступления), необходимость измерения и нормализации концентрации исследуемой ДНК.
2. Автоматическое генотипирование высокоинформативной панели из 40 инсерционно-делеционных полиморфизмов [8].
В данной работе авторы предлагают панель для анализа 40 InDel маркеров. Локусы маркеров амплифицируются в четырех мультиплексных ПЦР и имеют длину 78-326 нуклеотидов (средняя длина 154,2 нуклеотида). Панель разрабатывалась для европейской популяции, и имеет величину МР 7.09⋅10-17 для европейцев. Для африканской популяции величина МР уже 1.2⋅10-12, что уже ниже принимаемой судом в качестве доказательной.
Как и в предыдущем изобретении, к недостаткам следует отнести этническую специфичность панели маркеров, большую протяженность амплифицируемых фрагментов, необходимость постановки четырех ПЦР для одного образца.
3. Известен также набор реагентов «Qiagen Investigator DIPplex reagent», выпускаемый компанией Qiagen (Hilden, Germany), набор не запатентован. «Qiagen Investigator DIPplex reagent» рассчитан на исследование 30 InDel маркеров. Локусы маркеров амплифицируются в одной мультиплексной ПЦР и имеют длину до 160 нуклеотидов. МР составляет от 5⋅10-11 для азиатской популяции, до 2⋅10-13 для европейской [9]. Несмотря на то, что характеристики длины амплифицируемых локусов и мультиплексность ПЦР в коммерческом наборе «Qiagen Investigator DIPplex reagent» превосходят аналогичные качества предыдущих двух изобретений, существенным его недостатком является малое количество анализируемых маркеров. Этим обусловлено недостаточное значение МР в целом, и для азиатской популяции, в особенности.
Как видно из описания, все три вышеприведенных аналога схожи между собой по используемому подходу, отличаясь лишь набором маркеров, длинами локусов и мультиплексностью ПЦР. Наиболее близким к заявляемому техническому решению по технической сущности и достигаемому техническому результату является набор DIPplex. Описанный способ принят за прототип изобретения. Основной недостаток прототипа - недостаточное количество маркеров. Особенностью судебно-генетической экспертизы является низкое качество биологических образцов, что зачастую приводит к спорадическим выпадениям результатов по части локусов. Идентифицирующая ценность таких неполных результатов снижается. В связи с этим, необходимо иметь многократный запас по числу исследуемых маркеров, что обеспечит полноценный идентифицирующий профиль даже при выпадении большей части результатов. Увеличение числа анализируемых маркеров связано с фундаментальными методическими проблемами, главная из которых - это выбранный способ регистрации результатов генотипирования по электрофоретической подвижности амплифицированных локусов в геле, т.е. по их длине. Используемый подход всегда будет требовать компромисса между количеством маркеров и их максимальной длиной. Увеличение достоверности результата идентификации требует увеличения числа маркеров, что в свою очередь, будет повышать среднюю длину амплифицируемого локуса (т.к. каждая длина продукта «зарезервирована» за одним аллелем одного маркера), ограничивая возможности анализа деградированной ДНК.
Для устранения указанных недостатков необходимо существенно увеличить число анализируемых маркеров и обеспечить минимально возможную длину амплифицируемых локусов. Это позволит повысить идентифицирующий потенциал и чувствительность метода, как для качественных образцов ДНК, так и для деградировавших. Решение этих задач требует увеличения мультиплексности ПЦР без увеличения числа реакций, т.е. в одной смеси праймеров. Для минимизации длины локусов необходимо уйти от электрофоретического способа регистрации результатов генотипирования, т.к. он связан с длиной ПЦР-продукта. Оптимальным является гибридизационный анализ. При его применении размер амплифицируемого фрагмента каждого локуса будет определяться исключительно качеством зон отжига праймеров на флангах самого маркера. Учитывая, что в геноме человека число таких маркеров-кандидатов избыточно, из них можно выбрать те, для которых можно подобрать праймеры, отжигающиеся достаточно близко к маркеру, и обеспечивающие минимальную длину амплифицируемого фрагмента.
Раскрытие сущности изобретения
Задачей настоящего изобретения является:
- создание универсальной межпопуляционной панели, состоящей из маркеров, обладающих близким по значению дискриминирующим потенциалом в каждой из пяти основных мировых популяций (европейской, африканской, южноазиатской, восточноазиатской и американской);
- улучшение характеристики МР до 1.52⋅10-65 за счет увеличения количества InDel-маркеров, определяющих идентифицирующий профиль;
- сокращение средней длины амплифицируемых локусов до 72,8 п.н. и максимальной до 97 нуклеотидов;
- подбор структур олигонуклеотидных праймеров, обеспечивающих проведение ПЦР в одной реакции для всех локусов;
- подбор структур олигонуклеотидных ДНК-зондов, обеспечивающих достоверное генотипирование методом гибридизации.
Поставленная задача технически решена следующим образом. Для преодоления присущих прототипу недостатков, и достижения идентифицирующих и эксплуатационных характеристик, в большей мере удовлетворяющих потребностям судебно-медицинской экспертизы, в заявляемом техническом решении были введены следующие усовершенствования. Выбраны 162 InDel маркеров, имеющих равномерное распределение частот аллелей в основных мировых популяциях. Для них были подобран набор синтетических праймеров, эффективно амплифицирующих в ходе одной мультиплексной ПЦР локусы всех, входящих в набор маркеров, причем обратный праймер каждого локуса имеет универсальную вставку по 3'-концу. В качестве способа генотипирования (определения присутствующих в образце аллелей всех маркеров) был выбран гибридизационный анализ. Принцип гибридизационного анализа состоит в проведении реакции комплементарного взаимодействия между исследуемым продуктом мультиплексной ПЦР и набором олигонуклеотидных зондов (предварительно закрепленным на поверхности подложки, в микрокаплях геля, на микросферах и т.д.), каждый из которых соответствует определенной аллели маркера. Для детекции результата гибридизации могут быть использованы любые подходящие метки (флуоресцентные, радиоактивные, ферментативные и проч.), предварительно введенные в ПЦР-продукт посредством меченых дезоксинуклеотидтрифосфатов в ходе элонгации, либо путем использования предварительно меченого праймера, или иным способом. В приведенных далее примерах для введения метки мы использовали ПЦР с флуоресцентно-меченым праймером.
Таким образом, заявляемым техническим решением устранены следующие недостатки прототипа:
- Недостаточно низкая вероятность случайного совпадения генотипов, МР, составляющая у прототипа от 5⋅10-11 для азиатской популяции, до 2⋅10-13 для европейской, в заявляемом техническом решении достигает 1.52⋅10-65, что повышает идентифицирующий потенциал метода в 1052 - 1054 раз;
- Панель InDel-маркеров, предложенная в заявляемом техническом решении, является универсальной вне зависимости от популяции. Средние значения частоты минорной аллели (которые в конечном итоге определяют ключевую величину - MP), рассчитанные исходя их данных исследования «1000 Genome Project» [10], практически не отличаются, и составляют для европейской популяции 39,8%, африканской - 39,4%, южноазиатской - 39,9%, восточноазиатской - 39,8% и американской - 39,6%. Это свидетельствует об универсальности выбранной панели маркеров, учитывая крайнюю полярность африканского, азиатского и европейского генофонда.
- Протяженность амплифицируемых фрагментов прототипа составляет от 70 до 160 нуклеотидов [11], среднее значение длины 115 нуклеотидов, медиана 115 нуклеотидов. В заявляемом техническом решении протяженность амплифицируемых фрагментов прототипа составляет от 55 до 97 нуклеотидов, среднее значение длины 72,8 нуклеотида, медиана 72 нуклеотида.
Выбор праймеров, входящих в предмет настоящего изобретения, характеризуется тем, что праймеры подбирали таким образом, чтобы они обеспечивали равномерную амплификацию всех целевых локусов.
Основными аспектами данного изобретения являются синтетические олигонуклеотиды, приведенные в Таблицах 1 и 2, а также Перечне последовательностей (SEQ ID N0: 1-SEQ ID N0: 648).
Предлагаемый набор синтетических олигонуклеотидов для амплификации целевых локусов, содержащих генотипируемые InDel-маркеры, характеризуется тем, что содержит 1) локус-специфичные праймеры следующего нуклеотидного состава (SEQ ID N0: 1-SEQ ID N0: 324):
Таблица 1. ПЦР-праймеры для амплификации локусов, содержащих InDel полиморфизмы.
| SEQ ID NO: | Номер полиморфизма | Название | Последовательность 5’-3’ |
| 1 | rs3059749 | 01_007_F | TGGACTTTATTATTATGGTCTGGAGCAGCA |
| 2 | rs3059749 | 01_007_R | TGCATGAGTGATTCCTTAAAACCAGACAC |
| 3 | rs34338895 | 01_031_F | AGCCATGTAGATGCTRTCATCAACAGCT |
| 4 | rs34338895 | 01_031_R | TGCAATTTTGGATACCAATGACCACAAGA |
| 5 | rs67091803 | 01_041_F | ACTTTGTGACCGTCTTCTCTCTTGG |
| 6 | rs67091803 | 01_041_R | CCAAGAGGGGTGCACTGCTCC |
| 7 | rs5774423 | 01_059_F | GCACAGAATCCAGCAGGTAGTAAGGG |
| 8 | rs5774423 | 01_059_R | CACAATGTTAAATCTGTTTGTTAAGGGGAG |
| 9 | rs113565562 | 01_083_F | TGATCACTGTATTCCTGACCCAGTTTCA |
| 10 | rs113565562 | 01_083_R | CACTTTAACTTCTGTTTAGAACACATAGT |
| 11 | rs111706466 | 01_101_F | AGTGTAAAAAYGACTGCTTAGACATTTCT |
| 12 | rs111706466 | 01_101_R | TCATTTGACAGATATTGAATCAAATTGGATTCTGA |
| 13 | rs11394524 | 01_119_F | AGCAGCAGGTAAAACAACTATCGTTC |
| 14 | rs11394524 | 01_119_R | CTAGGGGAGCCAGAGAGCCTTTTC |
| 15 | rs72082809 | 01_154_F | ACAGATTCCTTTGATTGCCTGATGAG |
| 16 | rs72082809 | 01_154_R | GCCGGTGCATTCTCCCCTTCAG |
| 17 | rs35379245 | 01_170_F | CTTGTTTCAGATATGCAGGCTGAGA |
| 18 | rs35379245 | 01_170_R | TGCTrGCAAACTTAGGCAATTAAGTTAACATC |
| 19 | rs71107464 | 01_192_F | TCTAGTTGAGTCACTTGAGCTCTATTAGAC |
| 20 | rs71107464 | 01_192_R | AACTCCTAACTGCTTAATGTAGCAGG |
| 21 | rs66944170 | 01_208_F | TGGTCACTCCTCTTTGCACTGCG |
| 22 | rs66944170 | 01_208_R | CCCATCCTCCCGAAGCACATCTAC |
| 23 | rs35126101 | 01_223_F | GGAGAGGGGTGTCCGACTCAGG |
| 24 | rs35126101 | 01_223_R | CCTTCCTGAGACAGCTGAAATGT |
| 25 | rs35994297 | 01_233_F | CAACATTGCAAAAATGAACGCTGACTAC |
| 26 | rs35994297 | 01_233_R | CTCTATACTTAGTCATTTGTTGCATTTCTGG |
| 27 | rs34450453 | 01_240_F | CTTCAATGAAGAACTGTTAAGAATTAAAGGC |
| 28 | rs34450453 | 01_240_R | CTTAAAATATGTAGTGTGTACCCAATCATTTGC |
| 29 | rs10693974 | 02_011_F | CACGTGGGTGGTCACTCACACC |
| 30 | rs10693974 | 02_011_R | CTTATCTCCAATAGATCAGTGAAGAAACAGG |
| 31 | rs66610049 | 02_036_F | GCCATAGAATTTCTCTCATGGCTCTAC |
| 32 | rs66610049 | 02_036_R | GTGAAATTCAGCTATAAGGAGATGAAGCC |
| 33 | rs68130608 | 02_042_F | AGAGGAGAATGAATGTTGGAGTAAGC |
| 34 | rs68130608 | 02_042_R | CAGAGTGACAGGTCAACACTTACCC |
| 35 | rs11424237 | 02_061_F | AGGCCTGTAATGGATTACAAAATGGCCACA |
| 36 | rs11424237 | 02_061_R | AGCAAAGTCACATTGCAAATTCTTGTACATATAATGATGG |
| 37 | rs72339906 | 02_080_F | CAGCTCTAAGACCACACATTCTGC |
| 38 | rs72339906 | 02_080_R | ACTGGCCATGCAGGTATTCTAGG |
| 39 | rs5832955 | 02_101_F | TCAGGGTTGACCAGCAGTTTAAGTG |
| 40 | rs5832955 | 02_101_R | GAATTCAGTTTTCACTCATGAGTTTAGCTG |
| 41 | rs5833488 | 02_113_F | AGGCGGAAATAAGTGACCCAGAGAAAAACGCT |
| 42 | rs5833488 | 02_113_R | TGCCGCCTCCTGCAACTCCTTCA |
| 43 | rs77093320 | 02_150_F | AGGCACCTTGTGAGAAAAGATTGG |
| 44 | rs77093320 | 02_150_R | CCTAGGCTTGCTGGGAAGTCCTC |
| 45 | rs111665673 | 02_215_F | ACCCAAGAATATGAAGGACCAACTG |
| 46 | rs111665673 | 02_215_R | TCATCACATTCTGCACTCATAATCAGC |
| 47 | rs57993635 | 02_231_F | AGGAGACCACTCAAAGAATCCTACTC |
| 48 | rs57993635 | 02_231_R | TCAGTTTAGGTGCACAGAATAAGTCAC |
| 49 | rs35926392 | 03_016_F | AGGACCAAGGCTGCAGAGAAAGG |
| 50 | rs35926392 | 03_016_R | CGGCTCTCCTTCCAAGTCAGGAC |
| 51 | rs139738417 | 03_030_F | TGATGTAATTTAAAGTGAGCCAGCCAGACRTA |
| 52 | rs139738417 | 03_030_R | TGACTCTTCTCCCACCTAACTCAAGTTTGA |
| 53 | rs66976303 | 03_063_F | GTTAGGAAATRATCCCAGGAAATAGGAATG |
| 54 | rs66976303 | 03_063_R | CTACTCCATCATAGGCTCTTGTATTGG |
| 55 | rs57495895 | 03_082_F | CTGTGTTGTATTCTGTTATTGCTACTTGC |
| 56 | rs57495895 | 03_082_R | TTGCCATTCTAAGATTTCTCTCTTCCTG |
| 57 | rs35291341 | 03_100_F | CGTTCACATGTCAGGTACTAACTCTC |
| 58 | rs35291341 | 03_100_R | TGGTGGGGATGAGGTACAGACTG |
| 59 | rs35464243 | 03_107_F | CAATCTAAGTTGTCTTACCCTGTGGC |
| 60 | rs35464243 | 03_107_R | TTTCTAGTTCTCATATTCCATGATTGTATTTTGAG |
| 61 | rs10540628 | 03_124_F | AGGAATGACAGGAAAGTCTTAATGAGC |
| 62 | rs10540628 | 03_124_R | ACATCATGCATTGTTTGAATCATCTCTG |
| 63 | rs35588182 | 03_162_F | CTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGC |
| 64 | rs35588182 | 03_162_R | AGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGTG |
| 65 | rs150470881 | 03_182_F | GAGTCCCTCTCTTTCTACTGTWTGGAATAGT |
| 66 | rs150470881 | 03_182_R | AGAGGTACAAAGAGAAGCTGGTACCA |
| 67 | rs75445531 | 03_194_F | TTCCTGGACGTGTGAATTGATGC |
| 68 | rs75445531 | 03_194_R | GAAGACAGACAGAACACTCCTGC |
| 69 | rs3834231 | 04_008_F | AGGATCTGGACTTGCTCTGGGGCAG |
| 70 | rs3834231 | 04_008_R | GCAGGGCTCTGGGAAATTTGGGTGC |
| 71 | rs59170274 | 04_027_F | TATTCACTATGGTTACCATGCAGTACAAG |
| 72 | rs59170274 | 04_027_R | TGTTGAACAAACAGTACAAAGTTTCAGAC |
| 73 | rs34184705 | 04_045_F | CAGATCGCTGGGCTATTAGGTG |
| 74 | rs34184705 | 04_045_R | TACTGGCCAGCTGCAGCCTCTAC |
| 75 | rs56281469 | 04_056_F | GCTGTGGAGTATAATTTGTAGGGAGAC |
| 76 | rs56281469 | 04_056_R | CATACTGTATCTTACTTGAGTGTTTCATCTC |
| 77 | rs10707593 | 04_065_F | TGGGAATACTAGGGAAGCATTGGGAAGTGACT |
| 78 | rs10707593 | 04_065_R | RGCTATTGGTACCAGACATAAACRTATATGCA |
| 79 | rs35932180 | 04_085_F | GTTCAAGCAATAATCATTGATCTGTGCC |
| 80 | rs35932180 | 04_085_R | GTGAGTCTTATTTTTTCCCTGTGTCTGT |
| 81 | rs72273695 | 04_112_F | AGTAACTTCTCCATGCATCACATTATTC |
| 82 | rs72273695 | 04_112_R | CACAAACAGAGGCCAGGTAA |
| 83 | rs70938781 | 04_137_F | ACCTGCCCTGACTATATCTGTA |
| 84 | rs70938781 | 04_137_R | CATATCAGCTTTTTCCTCCTCCTTCA |
| 85 | rs34581182 | 04_154_F | TCTCACAAAATATACATGTAGCAGTGGATA |
| 86 | rs34581182 | 04_154_R | GTTACTGAAGGTAGTATAGCTCTAGGCA |
| 87 | rs3067059 | 04_177_F | CCTTCCCTTCCATTTTGTATATCTG |
| 88 | rs3067059 | 04_177_R | CCTAGTCAGAGGAACATTTTGAAG |
| 89 | rs61235135 | 05_003_F | CTCTGTTCCTTTGCTGAAAAATGAC |
| 90 | rs61235135 | 05_003_R | AGATGTTTTCAGGTGGGAGGAATA |
| 91 | rs113132739 | 05_013_F | GGAAGATGATGTGAATGTACACAAG |
| 92 | rs113132739 | 05_013_R | TGTGGCAGTCCTAGTCCAGTCTC |
| 93 | rs142490175 | 05_065_F | CCCATATATTTTCCTTCCTGGTGCA |
| 94 | rs142490175 | 05_065_R | CCCTACCCTGACAAATACATGAACTA |
| 95 | rs572636473 | 05_074_F | TGTTCCTTATTTCTGGAAGAGCCC |
| 96 | rs572636473 | 05_074_R | TGCCAGACCTATGCATAAAAAAGG |
| 97 | rs138124389 | 05_087_F | GCTAAACATTGAGCACACATGGA |
| 98 | rs138124389 | 05_087_R | GATTGTTTTTTAACCCATGCCCTTTC |
| 99 | rs34990478 | 05_096_F | CTAGCAAGGGTGAGAATTAGTGACT |
| 100 | rs34990478 | 05_096_R | GAACACATCTTGGTAAGCAGCACT |
| 101 | rs6149192 | 05_115_F | TGCAGTTCAGCTGACTTCAC |
| 102 | rs6149192 | 05_115_R | GGGGTTAAGAGTTTCAGCATG |
| 103 | rs145918302 | 05_119_F | CCTAACTACCTGTTTACAAGGCAATTCA |
| 104 | rs145918302 | 05_119_R | CACAGTTTGGAAATGGTTAATTGTATTCT |
| 105 | rs66881681 | 05_132_F | GGAACTCCAGGACCCAACAGA |
| 106 | rs66881681 | 05_132_R | AGCCATGTTTCTGTCTCAGCA |
| 107 | rs10701589 | 05_141_F | AGGCTTCTAATTGGTTTCCGCA |
| 108 | rs10701589 | 05_141_R | CAAGATATAATAACAAATCAGAGTGGA |
| 109 | rs3832355 | 05_151_F | TGCTGCTGTGAAGATGAGAAGG |
| 110 | rs3832355 | 05_151_R | GTAGGGGCTTTGGTAAATATAGTCA |
| 111 | rs10560231 | 05_180_F | AGCCATGCGTTGCTTTAAGCCA |
| 112 | rs10560231 | 05_180_R | CCCAGCCTGTAGTATGTTTCAATATCAT |
| 113 | rs35948562 | 06_007_F | CTCACTACCAAGTCAAACCCA |
| 114 | rs35948562 | 06_007_R | TGAGGGAATAGGCGCAGTATA |
| 115 | rs56071028 | 06_016_F | CATGGTCCCAAAGCCATCACAGC |
| 116 | rs56071028 | 06_016_R | ACACATTGCTCCTTCTTCATCATC |
| 117 | rs10529292 | 06_031_F | AGCCTCTTTGCRTGGCTCTTTCTGGC |
| 118 | rs10529292 | 06_031_R | AGTGTGTACGATTTCATTTCTGATGTCTCT |
| 119 | rs376539574 | 06_057_F | AGATCCTCGCTAATCAATTAGAGCACA |
| 120 | rs376539574 | 06_057_R | AGTATTCACATATTTGCAATTAGGATATATTCCT |
| 121 | rs68133212 | 06_071_F | CCAAGGTAAACATCGTTAGTTTCTCCA |
| 122 | rs68133212 | 06_071_R | GAAGCCCAAACAGAAAAGCAAG |
| 123 | rs139823267 | 06_077_F | TTCTCAATGAATACAGCCTGTGACT |
| 124 | rs139823267 | 06_077_R | CTTAGTAAATAGCCTAAGCGATTTTGTCA |
| 125 | rs144273778 | 06_087_F | CAGTTCCCACCTGTATGCTGTG |
| 126 | rs144273778 | 06_087_R | AGGAGGGAGGTGGATCTCAGC |
| 127 | rs56343259 | 06_096_F | TTGCCTCCAAAGTCTCTGACAC |
| 128 | rs56343259 | 06_096_R | ACAAATGACTCTGGCAGAGGTG |
| 129 | rs573860910 | 06_113_F | ACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTG |
| 130 | rs573860910 | 06_113_R | TCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATG |
| 131 | rs141141409 | 06_125_F | ATAGGCAGCTGTGGTATGGGA |
| 132 | rs141141409 | 06_125_R | GTACCTGGCTCCCCTGCTGT |
| 133 | rs71675135 | 06_135_F | AGGGAAATGAAAGACAATTAGAGAAGT |
| 134 | rs71675135 | 06_135_R | TGTCCCTGATCTGTGTTCACAC |
| 135 | rs140327598 | 06_143_F | ATCTTAAAATGCTAGACACTGTTTTAGAG |
| 136 | rs140327598 | 06_143_R | TTTCTTCCACTAGAATGTAAGCC |
| 137 | rs68078431 | 06_153_F | GTGCACATGCATGTTTGAATAG |
| 138 | rs68078431 | 06_153_R | GTATATTCAAAACAAGAGTCGAAGCCA |
| 139 | rs11278298 | 06_158_F | GTGTGACGTTTCAGTTAATAGTGGTGG |
| 140 | rs11278298 | 06_158_R | TCTCCTGCATAAAGTATGAATTTTCGT |
| 141 | rs566489451 | 06_167_F | CCTTGAGCCTGGCTGTAATC |
| 142 | rs566489451 | 06_167_R | CATGGTAGGCCCACAGGAAATA |
| 143 | rs35345873 | 07_010_F | AGAAGAGAAAAGTGAGGTAGTTGCTA |
| 144 | rs35345873 | 07_010_R | ATGGTTGCATATTAATGCCTAAGCTTG |
| 145 | rs71552214 | 07_023_F | CCCAAGCACTTTTCTATATTCTATCACCTCTG |
| 146 | rs71552214 | 07_023_R | TTGGGTTAATGTGTGTTGTATTCAGC |
| 147 | rs34786735 | 07_040_F | GCATAATTGATAGATCAGCTCTAGAAGAATYAC |
| 148 | rs34786735 | 07_040_R | ACTGCTTTCCTCACAGATTTGTACATTCA |
| 149 | rs377131771 | 07_062_F | GGATGATTCCACTTGAATCCATTCAAAGA |
| 150 | rs377131771 | 07_062_R | CCTTTGGAACCATTGAATAGAAAGGAATG |
| 151 | rs1610906 | 07_082_F | CCAGTAGACACAATGATATTGACAAATAG |
| 152 | rs1610906 | 07_082_R | GCAGGATATTTTGATATTGAGAGTTTG |
| 153 | rs112677752 | 07_097_F | CAGAGACTATCTTAAATATGCATTTCTATG |
| 154 | rs112677752 | 07_097_R | CCTAACAGCTCGACAAATATTGCAG |
| 155 | rs35830730 | 07_112_F | CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTG |
| 156 | rs35830730 | 07_112_R | TCTGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTC |
| 157 | rs3216282 | 07_126_F | CCAAGTTCATACAAAGTTCACAACCA |
| 158 | rs3216282 | 07_126_R | CAACAATGAAAAAAACATCTATAGTAGCACT |
| 159 | rs35575707 | 07_140_F | TTCCACATTGTGCTGGTGGTTCT |
| 160 | rs35575707 | 07_140_R | CTCAACACTGGCAGGTATAGCA |
| 161 | rs71520104 | 07_153_F | TGCGGTTCCATCAAAGCCACARCCCTG |
| 162 | rs71520104 | 07_153_R | AACAAGACATAGGGTGACCGTAGTG |
| 163 | rs35146459 | 08_002_F | GACTGTCCATTGTTTGCTGCACTTGTC |
| 164 | rs35146459 | 08_002_R | AGGGAATGACGCTCATGGGAGG |
| 165 | rs36048750 | 08_013_F | TCCATGAGAATAACTATAGTATGCTAAGTAATACAT |
| 166 | rs36048750 | 08_013_R | TCCACTGAGAATACATGATCTATTAAGTAAAATG |
| 167 | rs34168882 | 08_033_F | TGGACCCAATAAAACTTGGTGAAATAAAATG |
| 168 | rs34168882 | 08_033_R | TCAAGTCTTGTCCTATCATGTTTCTGATGA |
| 169 | rs35604660 | 08_058_F | TGCTCTCTGAACAGACGTCATGG |
| 170 | rs35604660 | 08_058_R | GCTATACAGTGCTGGAGAAATACTCTG |
| 171 | rs34067160 | 08_064_F | ACCCCTCACCCTTTACTTTGTAGG |
| 172 | rs34067160 | 08_064_R | CAAAGAGGCATATTTTGGGGTGG |
| 173 | rs138172268 | 08_082_F | CAGGGTTTGTGAATGCACCAATC |
| 174 | rs138172268 | 08_082_R | TTTCCAAGTCCCCACCAGAGGAG |
| 175 | rs35679778 | 08_103_F | TAAGCTCAGGGAAGCACTGCCTGACA |
| 176 | rs35679778 | 08_103_R | AGAGCAACCATCCCCCACCCCC |
| 177 | rs11323264 | 08_125_F | TCCACGGCACCACATTCAAGGCCTCTG |
| 178 | rs11323264 | 08_125_R | AGCAGAGGCGAAGTGTGAGACCTGT |
| 179 | rs6150855 | 08_139_F | GGAGTAAAAACTTCCTGAGGCCTC |
| 180 | rs6150855 | 08_139_R | GCAAACCATTCAGGAAGCGTGGA |
| 181 | rs147918543 | 09_000_F | ACACTCACTGATCAAGGATTTCTAAAACCA |
| 182 | rs147918543 | 09_000_R | AGCCTATAAGACATTCCTTTATGAGTGATACAAAGTC |
| 183 | rs66509579 | 09_021_F | GGGTTATTTCTATATAAAAACGAGCATAAAATTATAGCAG |
| 184 | rs66509579 | 09_021_R | TAACACCATGTTTTTTCTTCAAAAATGTGCATC |
| 185 | rs371766957 | 09_064_F | GTACTGACAGAAGGCTCATGAGTTA |
| 186 | rs371766957 | 09_064_R | ATTACCACACCACTCTTTACTACAG |
| 187 | rs71493646 | 09_072_F | ATTCCTCTTGACATCCAGCCACCC |
| 188 | rs71493646 | 09_072_R | CTAGCAAGACAGACATACAAGCTG |
| 189 | rs34499887 | 09_084_F | CCTCGAGGTGGCTTGTTTGRGTGC |
| 190 | rs34499887 | 09_084_R | ACCTGCCCACCAACCTGACCCA |
| 191 | rs59923204 | 09_109_F | AGACCAGAAATTGGAAAATGTTACAGTGGTC |
| 192 | rs59923204 | 09_109_R | ACCAAGGACACATAGCTGACAAATGGA |
| 193 | rs55952736 | 09_117_F | AATTTATTTTCTCCATAAACTACCTAGTCTCA |
| 194 | rs55952736 | 09_117_R | GCAATGTTATTGTTCCATTGTGTCTTAGTCT |
| 195 | rs71953876 | 09_132_F | TTACTGAGATGCCCAACCTGCGT |
| 196 | rs71953876 | 09_132_R | CCGTTTCCTCCGCACTTATGCTGC |
| 197 | rs368278029 | 10_001_F | GCTATACCATTTCTCCTATTGTATA |
| 198 | rs368278029 | 10_001_R | AGGTAGCRTAGAGTAGAAGAAACAGTGTAAC |
| 199 | rs71281575 | 10_026_F | CCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGC |
| 200 | rs71281575 | 10_026_R | TAGGAGGCCGAAGCGGGAGG |
| 201 | rs202245860 | 10_035_F | TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG |
| 202 | rs202245860 | 10_035_R | TGCGGTGGCACGATCTGGGCTC |
| 203 | rs34948479 | 10_047_F | GAGTCATGATTCACRAGCAGTTGTAAGCAATG |
| 204 | rs34948479 | 10_047_R | TGGGGAAAACTGGGTACAGGGTACAGT |
| 205 | rs10552811 | 10_071_F | GAGTCACCCAGAGGGATTTTGACAAT |
| 206 | rs10552811 | 10_071_R | CCCACTTAGAAAAATCCAATGAGAATCTCA |
| 207 | rs10555357 | 10_085_F | TCAGCCACAGAGGAACAGCCAG |
| 208 | rs10555357 | 10_085_R | GCTTTGCCCAACTCACAGAATTAC |
| 209 | rs140576359 | 10_117_F | AGGAATTCATGGCTTAGGTTGGAAC |
| 210 | rs140576359 | 10_117_R | CCGATCTATATTCCTGTTCTGATGTC |
| 211 | rs10544160 | 10_128_F | CAGCACTGAAATTTAAAATCCTGGTCCT |
| 212 | rs10544160 | 10_128_R | CCGCCAGGGAAAACAAGCCACATG |
| 213 | rs10583916 | 11_006_F | ACTTCCTGTATCATTAATTCCACCTAG |
| 214 | rs10583916 | 11_006_R | GCAGCACTCTGAACTTTTTATTGTCTC |
| 215 | rs113764748 | 11_020_F | TAGGAGTTCTGACTCAGTTCTGGTG |
| 216 | rs113764748 | 11_020_R | CTGACCAAAACTCAATGGCCTTTC |
| 217 | rs57958958 | 11_034_F | ATGGGCGTATAAATATTGCCTTTCTCA |
| 218 | rs57958958 | 11_034_R | AGACACACTCCCTAAGGTGTTATATG |
| 219 | rs138278630 | 11_059_F | TGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCA |
| 220 | rs138278630 | 11_059_R | TGGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCAC |
| 221 | rs74933486 | 11_084_F | CTACCAGCTCTTTGTGTGTCCTAGA |
| 222 | rs74933486 | 11_084_R | TTCTTAGAACTTTCCATATGGCCATTG |
| 223 | rs35847449 | 11_094_F | TTATGCTATAAATTAGCAAACCCAACACATC |
| 224 | rs35847449 | 11_094_R | GCAGTTCACCCTCTAAAACCATTCACTC |
| 225 | rs143339028 | 11_111_F | AGAGGGAGGAGTCGTGATTGTCT |
| 226 | rs143339028 | 11_111_R | CTGAGCAGGCTGCCGGAAAC |
| 227 | rs11394480 | 11_135_F | AAGCCCTTGGCCATACATAAGGCTC |
| 228 | rs11394480 | 11_135_R | GGGAGTGGGAGAATGAGCTCTCC |
| 229 | rs10533848 | 12_013_F | GCCTTCTCTGCTCTCTTTTGTG |
| 230 | rs10533848 | 12_013_R | GCTATTATCCACTCTTGCAGATGAAG |
| 231 | rs35955982 | 12_024_F | TTCACTGCTTGTGTGGTCTTATATAATCAAAAC |
| 232 | rs35955982 | 12_024_R | AGTGTAGTCTACTCTGTTCATTTTACACC |
| 233 | rs10571534 | 12_074_F | TCAAGAGGTAATCTGAARACAGGTCTTTC |
| 234 | rs10571534 | 12_074_R | ACTCAGYAGGCCTAGGTTGCTC |
| 235 | rs10689649 | 12_090_F | CCCATTTATAAGCCAATGTTTCATTGTC |
| 236 | rs10689649 | 12_090_R | ACATCATTTAAATGGAGAGAGTAGCTG |
| 237 | rs150767158 | 12_100_F | ATTGCTTTTTATGACACTACYCCTCATGC |
| 238 | rs150767158 | 12_100_R | TGGGTCCAGACAAATCACAAGGGTTC |
| 239 | rs10706208 | 12_128_F | ACCTGAAATTGATTCAAATGTGTCATGTGATCTTTCAAAC |
| 240 | rs10706208 | 12_128_R | TGTCATATAACAGAATGTGACTTTGAC |
| 241 | rs142669819 | 13_039_F | GGACTTCCTAAGATACACTTCGATTG |
| 242 | rs142669819 | 13_039_R | ACTGGGTTGGAACATCCAAAACAATC |
| 243 | rs5803618 | 13_053_F | TCAGATATATGGCTCGGTAGCCTCCCYGA |
| 244 | rs5803618 | 13_053_R | TCAAACCTAATGCCTGTCTAAGTAGAC |
| 245 | rs371764729 | 13_069_F | ACCATCTCAYCCCADTTAGAATGGCGATC |
| 246 | rs371764729 | 13_069_R | TTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAG |
| 247 | rs67650090 | 13_087_F | GTGACATTTCCTTGTCAAAAGAACATTATAG |
| 248 | rs67650090 | 13_087_R | CATTAGGTCATGGTAATTTTCCCTGAG |
| 249 | rs55812371 | 14_056_F | ACCTAGGGATGGAACTTTGGCTTATG |
| 250 | rs55812371 | 14_056_R | CACTATAGAAAACAGGCTTGTGGTTC |
| 251 | rs141061555 | 14_091_F | GGAATTACAATTTATAAATGTAGGTCCACATG |
| 252 | rs141061555 | 14_091_R | CCACACTCATTTGTGTATTTCTACACTG |
| 253 | rs144457716 | 15_046_F | TAYTGTGAAATTGAAGTTTAGAGTCAGTTTCVAAG |
| 254 | rs144457716 | 15_046_R | TCTGCTTGATAACTGTACAACTTTATAGTAAAATGTGAAC |
| 255 | rs112548522 | 15_067_F | TCATCTCCTTGGGAAATGGCC |
| 256 | rs112548522 | 15_067_R | GCACCAGGCTCATCCTATTCTTATTAC |
| 257 | rs112792286 | 15_087_F | GCAGCACCAGTTCTGTCTCCTACTAGTACCTTCAG |
| 258 | rs112792286 | 15_087_R | TTTGCACCAGCCTAATAGTTGGTCTTACAG |
| 259 | rs112880243 | 15_097_F | AGAACACCATGCTTTCTGACAGC |
| 260 | rs112880243 | 15_097_R | CCAGCTATGAAAAGCCAATTGCTG |
| 261 | rs35379530 | 16_000_F | ACTATGGGTTTATCAAGAATTCCAAGTTG |
| 262 | rs35379530 | 16_000_R | GTCAAAGGAAGTTTCACTGTAGGG |
| 263 | rs34436424 | 16_012 _F | CTTAGAGTCATAGTTTACAAACATAAAACCATG |
| 264 | rs34436424 | 16_012 _R | GGCTTAGATATCTCAGACCTACCAATATC |
| 265 | rs3841767 | 16_024_F | CCTTAGCTTGTATCACCCTTTATCATCTG |
| 266 | rs3841767 | 16_024_R | AGAAAGAAGAAAGGAAGTCACACAG |
| 267 | rs35709162 | 16_064_F | AGTGACSKACATTTGGCAAGAAGCCATG |
| 268 | rs35709162 | 16_064_R | AGAGAATTTATTGTCAyGCTTGTGCCAAAGC |
| 269 | rs34816330 | 16_076_F | AGTGAGTCTGTTCAGGGTGCTACATTGCTG |
| 270 | rs34816330 | 16_076_R | GCATACAGAAGCCACTCrGAATACAATTTCAAG |
| 271 | rs11330085 | 17_001_F | GTACCCCACATAGATAGCCGGAAGG |
| 272 | rs11330085 | 17_001_R | TCCTTCCAGCGGTCTCTGTGG |
| 273 | rs5821134 | 17_057_F | TCCCAAAGGAACCCCTATGACT |
| 274 | rs5821134 | 17_057_R | CTCAGGAGCTAGCAGTGGGAG |
| 275 | rs141730340 | 17_083_F | CTCCACTTTCCACTGATGCAG |
| 276 | rs141730340 | 17_083_R | GGGAGGGAGGGGTGCTCGGGAT |
| 277 | rs35023498 | 18_001_F | CTTCATGAATGGTTTGGCACCHGTTCCTTG |
| 278 | rs35023498 | 18_001_R | ACACACTTTTAAACAACAGATCTTGTGATAAC |
| 279 | rs35452393 | 18_030_F | AGCTTGACTAAAGTTTAGTCAACACAGCAAAG |
| 280 | rs35452393 | 18_030_R | TTGTGATTGbCCAAGTGTTCACAACT |
| 281 | rs33990768 | 18_051_F | ACATTCCTCCTGTGGRCTCTGCTGCATC |
| 282 | rs33990768 | 18_051_R | AATTGTGATAGACAAATGCCTGGC |
| 283 | rs66933419 | 18_065_F | GCCACTCAATTTCTAGCCATTGCCTTAGG |
| 284 | rs66933419 | 18_065_R | CCTGAGACATTTGGGTGAAGGTTTGTGTCTAC |
| 285 | rs66502030 | 18_075_F | ACAGCAAAGAGGAGAGAAAGAGCTGAAC |
| 286 | rs66502030 | 18_075_R | AACTACCCTGTTCTAGTCCCGCATCC |
| 287 | rs60503836 | 19_002_F | GGCTCTGTCABCAGGCTGGAGTGCAATGG |
| 288 | rs60503836 | 19_002_R | CTTGAACCCTGGAGACAGAGGTCGCAG |
| 289 | rs112906660 | 19_015_F | GATTTTGTTATATGCAGGGTGTCCTGAAACCA |
| 290 | rs112906660 | 19_015_R | CTCTCACTTTTCTTCTTTATAGTAAGTCATTC |
| 291 | rs112877961 | 19_029_F | CTACHGCAGGGAAAAGGGACTTAGCCGTAGG |
| 292 | rs112877961 | 19_029_R | AGACATCTGCAAGAAMTTTCCAGCAGGC |
| 293 | rs34242584 | 19_044_F | GTAGTGGCTATTTYGTCYGTCAGCTCCTGT |
| 294 | rs34242584 | 19_044_R | ACATTGAAACCCAATCCAAAGAAGCTAAGAATC |
| 295 | rs79282333 | 20_005_F | AAGACACAAAGTKTGGCTTCAGATAAAGAGCA |
| 296 | rs79282333 | 20_005_R | TGCCAAGCTATCTTGTAAGAAATAACTACAC |
| 297 | rs35894782 | 20_020_F | GGATTTTATTGTCTCATATTCTTGAAGTG |
| 298 | rs35894782 | 20_020_R | CAGTAGACAATGCCGAGAAAGAATAG |
| 299 | rs73622051 | 20_039_F | TCTGATTCCAATCTAATACCATAGGGCT |
| 300 | rs73622051 | 20_039_R | GGACTAAGCTTCTCATTGTTGCAGAG |
| 301 | rs66555516 | 20_058_F | TATTATGCCTTTTGTACCCGATGTTTG |
| 302 | rs66555516 | 20_058_R | CCAGTTGGCAGCTGGGAGAGCAAAG |
| 303 | rs138066060 | 21_010_F | TGGGGTGGAGGTGGGGCACAGCCTTGTTAC |
| 304 | rs138066060 | 21_010_R | AGGCCTACTATGAAACTGGAATCTTCACATAC |
| 305 | rs10583984 | 21_038_F | GCTGAATCTACTGTTTGGAGCTTACAATAAG |
| 306 | rs10583984 | 21_038_R | ACCATGTTATTCCAGCTACAATTCTGTG |
| 307 | rs112408318 | 21_042_F | CAGAAATGCATGCACAAGGCACTC |
| 308 | rs112408318 | 21_042_R | TTGCTATTGTAACTAATGTTGCTGAGGAC |
| 309 | rs60228580 | 22_033_F | TTCCTCTTCCGTAGATGGGGATAAGAAGATCTAC |
| 310 | rs60228580 | 22_033_R | TTAAATCTGTGTCTTCATATAATCCTGTTGA |
| 311 | rs67057410 | 22_046_F | TTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACA |
| 312 | rs67057410 | 22_046_R | TGCACTGAGATTGCACCACTACAC |
| 313 | rs35997669 | X_004_F | GCCATAAAAAAGAAAGAAATGCTGCCA |
| 314 | rs35997669 | X_004_R | CTTAGTCCAGTGTTCTCTAGGTTCACG |
| 315 | rs57522085 | X_029_F | GGAAGTTGTCATTGGAACTTCTGCTG |
| 316 | rs57522085 | X_029_R | GGGTTGAGAGTAAGGTATGAAAATTCTGG |
| 317 | rs202172626 | X_083_F | GCAATTTCCAATGTCAAATTAAAATTCTTCTAAC |
| 318 | rs202172626 | X_083_R | CTGTAAATAAGGAGTTTCATTATTTAGTGG |
| 319 | rs34991528 | X_095_F | AGTATGTTTTCAAATCAGGAATTGTGATGT |
| 320 | rs34991528 | X_095_R | GCACAAAAGACCTGGTCAAGACAAAC |
| 321 | rs35020323 | X_138_F | GAGTTTTGCAGAAGGTACAGCAACT |
| 322 | rs35020323 | X_138_R | TCAGTCTTGCATTTGAGAGACAATC |
| 323 | rs10689407 | X_141_F | GACCAAATTCAGTATGCTGGGAGT |
| 324 | rs10689407 | X_141_R | GTAGCCTCCATTTTACCCTGTTCC |
2) дополнительно, каждый обратный праймер с четным номером «Seq ID» (Seq ID NO:2, Seq ID NO:4… Seq ID NO:324), имеет со стороны 5'-конца универсальную олигонуклеотидную вставку, например 5'-TCATTGGATCTCATTA-3', или любую иную. Таким образом, каждый локус-специфичный обратный праймер имеет следующую последовательность: 5'-TCATTGGATCTCATTANNN…..NNN-3' , где “NNN…NNN” - его специфичная составляющая, а “TCATTGGATCTCATTA” - универсальная.
Локус-специфичные праймеры добавляют в количестве, обеспечивающем их конечную концентрацию от 1 нМ до 0,5 мкМ. Помимо приведенных праймеров, в реакционную смесь для амплификации вносят универсальный праймер, имеющий последовательность, идентичную универсальной вставке обратных праймеров, например, 5'-TCATTGGATCTCATTA-3'. В случае применения флуоресцентного маркирования, используют универсальный праймер с флуорофором (например Су5 или Су7) по 5'-концу. Концентрация универсального праймера должна составлять от 0,1 мкМ до 100 мкМ. Также, в реакционную смесь для амплификации входят следующие компоненты:
- смесь дезоксирибонуклеотидтрифосфатов четырех типов (dATP, dTTP, dGTP, dCTP);
- полимераза (Taq-, HotTaq-, или иная);
- реакционный буфер, оптимизированный для работы соответствующей полимеразы, например: 70 mM Tris-HCl (pH 8.8 при 25°C); 17 mM (NH4)2SO4; 0.01% Tween-20. 2 ммоль MgCl2;
- для флуоресцентного маркирования посредством встраивания флуоресцентно-меченых дезоксинуклеотидтрифосфатов в растущую цепь ПЦР-продукта, в реакционную смесь вносят соответствующий меченый дезоксинуклеотидтрифосфат в концентрации, обеспечивающей эффективное мечение (например, 0,05 мМ дУТФ-Су5). Флуоресцентное маркирование может осуществляться как одним из способов, так и их сочетанием.
Подготовленная смесь для амплификации также должна содержать исследуемую ДНК в количестве не менее 1 пкг. В качестве исследуемого образца могут быть использованы образцы ДНК, выделенные из любого биологического материала, содержащего геномную ДНК (кровь, слюна, волосяная луковица, потожировые следы, сперма, мазки со слизистой и бругие). Максимальное количество вносимой ДНК регламентируется лишь вязкостью ее раствора: при очень высоких концентрациях (более 1 мкг/мкл) возрастает вязкость раствора, что затрудняет его перенесение микродозатором. В этом случае рекомендуется разбавить раствор. Внесение компонентов в смесь для амплификации может происходить в любом порядке.
Амплификацию следует проводить в пробирках, стрипах, планшетах или иных емкостях, предназначенных для этой цели. После приготовления, смесь для амплификации помещают в прибор (амплификатор), обеспечивающий циклическую смену температур по заданной программе, например:
| № | Температура | Время | Количество циклов |
| 1 | 95°С | 1 мин | 1 |
| 2 | 95°С | 30 сек | 50 |
| 3 | 64°С | 60 сек | |
| 4 | 72°С | 20 сек | |
| 5 | 95°С | 20 сек | 50 |
| 6 | 50°С | 10 сек | |
| 7 | 72°С | 30 сек | |
| 8 | 72°С | 5 мин | 1 |
Амплификатор должен быть снабжен крышкой, нагреваемой до температуры, исключающей скопление конденсата в верхней части пробирки (стрипа, планшета), обычно 100-110°С. Если используется прибор, не имеющий нагревающейся крышки, то при приготовлении смеси реагентов, в нее необходимо добавить минеральное масло для исключения испарения водной части смеси.
В ходе температурного циклирования на первом этапе (№2-4) происходит симметричная амплификация всех входящих в набор локусов. Универсальный праймер имеет меньшую температуру отжига, чем локус-специфичные праймеры, поэтому на этой стадии он не участвует в реакции. Задача первой стадии - максимально эффективно амплифицировать локус в виде двуцепочечного фрагмента. Т.к. гибридизационный анализ требует присутствия одной цепи, комплементарной иммобилизованному ДНК-зонду (а в результате симметричной ПЦР первого этапа обе цепи связаны друг с другом), требуется стадия асимметричной амплификации. Это происходит на втором этапе: вследствие понижения температуры отжига, в реакцию вступает универсальный праймер. Т.к. он берется в существенно большей концентрации, чем локус-специфичные праймеры, на второй стадии происходит асимметричный синтез той цепи, которая комплементарна соответствующему ДНК-зонду. В итоге такой амплификации образуется смесь преимущественно одноцепочечных меченых ампликонов.
Разработанные нами зонды для генотипирования предлагаемой в данном изобретении панели InDel-маркеров приведены в Таблице 2 и перечне SEQ ID N0: 325-SEQ ID N0: 648.
Таблица 2. Аллель-специфичные ДНК-зонды для гибридизации
| SEQ ID NO: | Номер полиморфизма | Название | Последовательность 5’-3’ |
| 325 | rs3059749 | 01_007_I | CAAAACTAAATGAAAGATAATC |
| 326 | rs3059749 | 01_007_D | GCAAAACTAAAAAAGATAATCT |
| 327 | rs34338895 | 01_031_I | GTTAGGACGTGTGRTCTTG |
| 328 | rs34338895 | 01_031_D | GTTAGGACTGTGRTCTTGTG |
| 329 | rs67091803 | 01_041_I | CCTTCATTTCCTCAACTGTG |
| 330 | rs67091803 | 01_041_D | CCTTCATTTCAACTGTGCA |
| 331 | rs5774423 | 01_059_I | CTAAGCAAATACTTAGTTCCC |
| 332 | rs5774423 | 01_059_D | ACTAAGCAAATAGTTCCCTTC |
| 333 | rs113565562 | 01_083_I | TCACTTGTCACACTATGTG |
| 334 | rs113565562 | 01_083_D | TTTCACTTGTCACTATGTG |
| 335 | rs111706466 | 01_101_I | CATTTCTCTAAGTAATCAG |
| 336 | rs111706466 | 01_101_D | GACATTTCTCTAATCAGAA |
| 337 | rs11394524 | 01_119_I | TCAATCATGGGGTAAATGGA |
| 338 | rs11394524 | 01_119_D | ATCAATCATGGGTAAATGGA |
| 339 | rs72082809 | 01_154_I | GTGGGATTGTAAGTAAGAGC |
| 340 | rs72082809 | 01_154_D | AGTGGGATTGTAAGAGCTG |
| 341 | rs35379245 | 01_170_I | GAGACTCAGAGATGTTA |
| 342 | rs35379245 | 01_170_D | CTGAGACTCAGATGTTAA |
| 343 | rs71107464 | 01_192_I | GTGGTTCAAATAATCTATTCC |
| 344 | rs71107464 | 01_192_D | GTGGTTCAAATCTATTCCTG |
| 345 | rs66944170 | 01_208_I | ATTTCAGTTTTCTTCGAGATC |
| 346 | rs66944170 | 01_208_D | TTTTCCTCTTATCAAATCTGG |
| 347 | rs35126101 | 01_223_I | GAAAGACACTGTGAAGGAG |
| 348 | rs35126101 | 01_223_D | GGAAAGACACTGAAGGAGG |
| 349 | rs35994297 | 01_233_I | ATTGTACTTCTTTATTTCCAG |
| 350 | rs35994297 | 01_233_D | GAAATTGTACTTATTTCCAGA |
| 351 | rs34450453 | 01_240_I | CATATTTAAATTGGTTGGTTAAG |
| 352 | rs34450453 | 01_240_D | GCATATTTAAATTGGTTAAGAGC |
| 353 | rs10693974 | 02_011_I | ACCAGGAACTCTGGCCCT |
| 354 | rs10693974 | 02_011_D | CACCAGGATGGCCCTGTT |
| 355 | rs66610049 | 02_036_I | TTCAGAACTGTCTCTGGCA |
| 356 | rs66610049 | 02_036_D | CTTTCAGAACTCTGGCAAT |
| 357 | rs68130608 | 02_042_I | ACACATGCATAATAACCCT |
| 358 | rs68130608 | 02_042_D | CAACACATGCATAACCCTT |
| 359 | rs11424237 | 02_061_I | CAAATTCCTCCCCATCA |
| 360 | rs11424237 | 02_061_D | CAAATTCCTCCCATCAT |
| 361 | rs72339906 | 02_080_I | CTGCAGACAGAGCATGTC |
| 362 | rs72339906 | 02_080_D | CTGCAGACAGCATGTCCT |
| 363 | rs5832955 | 02_101_I | GCTAATTAGGGAACCTTGC |
| 364 | rs5832955 | 02_101_D | AGCTAATTAGGAACCTTGC |
| 365 | rs5833488 | 02_113_I | TATGAAGTAGGTGAAGGA |
| 366 | rs5833488 | 02_113_D | CTATGAAGTAGTGAAGGAG |
| 367 | rs77093320 | 02_150_I | AAGCACCGCCAGAGCTCT |
| 368 | rs77093320 | 02_150_D | GATTGGAAGTCTGAGGACT |
| 369 | rs111665673 | 02_215_I | GTATCATAAAGAGAAAGGGC |
| 370 | rs111665673 | 02_215_D | TGTATCATAAAAAGGGCATG |
| 371 | rs57993635 | 02_231_I | CAAAGAAAGCCTGTTCCTA |
| 372 | rs57993635 | 02_231_D | ACAAAGAAAGCTGTTCCTAG |
| 373 | rs35926392 | 03_016_I | TGAGTCTTGCGCTGACC |
| 374 | rs35926392 | 03_016_D | GTGAGTCTTGCTGACCC |
| 375 | rs139738417 | 03_030_I | CTGCACATAAGCCATAAT |
| 376 | rs139738417 | 03_030_D | TACCTGCACATAATTTCA |
| 377 | rs66976303 | 03_063_I | GAACCAGCGTGATGTAATAG |
| 378 | rs66976303 | 03_063_D | GAATGAAGAAAGGGAATGAG |
| 379 | rs57495895 | 03_082_I | ATAGGTACTGGATTCACAGC |
| 380 | rs57495895 | 03_082_D | CATAGGTACTGATTCACAGC |
| 381 | rs35291341 | 03_100_I | AGATCCCCCTGTTTTCAG |
| 382 | rs35291341 | 03_100_D | AGATCCCCGTTTTCAGTC |
| 383 | rs35464243 | 03_107_I | TAAACTTCACCAAGTACTCTT |
| 384 | rs35464243 | 03_107_D | CATAAACTTCAAGTACTCTTTC |
| 385 | rs10540628 | 03_124_I | CTGTGGAAACACAGAGTAA |
| 386 | rs10540628 | 03_124_D | TCTGTGGAAACAGAGTAAT |
| 387 | rs35588182 | 03_162_I | TGGTGTGATCTCGGCTCA |
| 388 | rs35588182 | 03_162_D | TGGTGTGATCGGCTCACT |
| 389 | rs150470881 | 03_182_I | AGTTTCAGACAGGAATGGT |
| 390 | rs150470881 | 03_182_D | TAGTTTCAGAAGGAATGGT |
| 391 | rs75445531 | 03_194_I | ATGCCTCCTTCTTCTGTAAC |
| 392 | rs75445531 | 03_194_D | GATGCCTCCTTCTGTAACA |
| 393 | rs3834231 | 04_008_I | CCCCAGCTAGGTAGGACT |
| 394 | rs3834231 | 04_008_D | CCCAGCTAGGACTAGCAC |
| 395 | rs59170274 | 04_027_I | TCACTAAAACTTATTCTTG |
| 396 | rs59170274 | 04_027_D | TCACTAAAATTATTCTTGC |
| 397 | rs34184705 | 04_045_I | GGCCATGGGGCATTCTT |
| 398 | rs34184705 | 04_045_D | GGCCATGGGCATTCTTG |
| 399 | rs56281469 | 04_056_I | ATTGCACACTCTGGGTAAG |
| 400 | rs56281469 | 04_056_D | ATTGCACACTGGGTAAGAG |
| 401 | rs10707593 | 04_065_I | TGACTACTCAATTGCAT |
| 402 | rs10707593 | 04_065_D | GTGACTACTAATTGCAT |
| 403 | rs35932180 | 04_085_I | CCAGTCACTCTGTACCAG |
| 404 | rs35932180 | 04_085_D | CCCAGTCACTGTACCAGG |
| 405 | rs72273695 | 04_112_I | TATACATCTGCATTGATTGGA |
| 406 | rs72273695 | 04_112_D | GCACAAATATACATTGGATATTC |
| 407 | rs70938781 | 04_137_I | CCCTACCTTGTAGCTGAC |
| 408 | rs70938781 | 04_137_D | GTACCTATCCGACAACCTG |
| 409 | rs34581182 | 04_154_I | GTGACTTCCTATAAAAACT |
| 410 | rs34581182 | 04_154_D | AGTGACTTCCTAAAAACTC |
| 411 | rs3067059 | 04_177_I | TTCAACTTGACTTGTGTAAC |
| 412 | rs3067059 | 04_177_D | GAATTTCAACTTGTGTAACTT |
| 413 | rs61235135 | 05_003_I | TCTTGCCTCCTTTATTTCC |
| 414 | rs61235135 | 05_003_D | GTCTTGCCTCTTTATTTCCT |
| 415 | rs113132739 | 05_013_I | CATATCTTCACAAGACAAAGG |
| 416 | rs113132739 | 05_013_D | GAAAATCATATCAAAGGGAGA |
| 417 | rs142490175 | 05_065_I | CATGTAATGAAAGGAATAAATCC |
| 418 | rs142490175 | 05_065_D | AAAACATGTAATGAATAAATCCAT |
| 419 | rs572636473 | 05_074_I | CCACCTTCCCCTCCCCT |
| 420 | rs572636473 | 05_074_D | TTTCCACCTTCCCCTTTTTT |
| 421 | rs138124389 | 05_087_I | ATAGACACTGCAGACTACTAG |
| 422 | rs138124389 | 05_087_D | GAAAAAAATAGAGAGGGGAGA |
| 423 | rs34990478 | 05_096_I | CAGCAGCATCATGAGATTT |
| 424 | rs34990478 | 05_096_D | GCAGCAGCATGAGATTTC |
| 425 | rs6149192 | 05_115_I | TGAGACCCTAAACAGAGGA |
| 426 | rs6149192 | 05_115_D | CTTGTGAGACCCAGTTAAG |
| 427 | rs145918302 | 05_119_I | ATAGGGGAACATCTAGATAAC |
| 428 | rs145918302 | 05_119_D | GCTCATAGGGGATCTAGATAACA |
| 429 | rs66881681 | 05_132_I | AGCAGAACAGGAGACTAGG |
| 430 | rs66881681 | 05_132_D | AGCAGAACAGACTAGGTTG |
| 431 | rs10701589 | 05_141_I | CCACTCTGATTGGTTTCCG |
| 432 | rs10701589 | 05_141_D | CTTCCACTCTGGTTTCCG |
| 433 | rs3832355 | 05_151_I | GTGCTCTTACTCAGTTAATGA |
| 434 | rs3832355 | 05_151_D | AGGTGCTCTTAGTTAATGATG |
| 435 | rs10560231 | 05_180_I | CACTAGGTCAATGATAACTTAG |
| 436 | rs10560231 | 05_180_D | CACTAGGTCAATAACTTAGTAC |
| 437 | rs35948562 | 06_007_I | CATTGTAACTCAGTTTTCCC |
| 438 | rs35948562 | 06_007_D | CATTGTAACTGTTTTCCCTC |
| 439 | rs56071028 | 06_016_I | TCAGGTAGCAGAGAAGGG |
| 440 | rs56071028 | 06_016_D | TTCAGGTAGAGAGAAGGGA |
| 441 | rs10529292 | 06_031_I | TCRAAAGCACAGCCAGAGA |
| 442 | rs10529292 | 06_031_D | TTTCRAAAGCGCCAGAGAC |
| 443 | rs376539574 | 06_057_I | TATAAATCATTATTTTAACAGG |
| 444 | rs376539574 | 06_057_D | GATTATAAATCATTTAACAGG |
| 445 | rs68133212 | 06_071_I | GTTCCTCATCTTTCATGGT |
| 446 | rs68133212 | 06_071_D | CTGTTCCTCATTCATGGTT |
| 447 | rs139823267 | 06_077_I | CAGACTCAGTTCATGAACTC |
| 448 | rs139823267 | 06_077_D | TCAGTTCAGACTCCACTGAC |
| 449 | rs144273778 | 06_087_I | GCAGTTAGAAGGAACACTC |
| 450 | rs144273778 | 06_087_D | TGCTGTATGCTGCTATTTG |
| 451 | rs56343259 | 06_096_I | TGAATGCCCGCCCACTC |
| 452 | rs56343259 | 06_096_D | CACTGAATGCCCACTCA |
| 453 | rs573860910 | 06_113_I | GTGTGAGATGGGTATCTCA |
| 454 | rs573860910 | 06_113_D | GTGTGAGATGGTATCTCAT |
| 455 | rs141141409 | 06_125_I | ACATGTCAGTTGTTTCTTAAAT |
| 456 | rs141141409 | 06_125_D | ATTACATGTCAGTTTCTTAAATAA |
| 457 | rs71675135 | 06_135_I | CAGGGGAATGAATGATTTTG |
| 458 | rs71675135 | 06_135_D | GTCAGGGGAATGATTTTGA |
| 459 | rs140327598 | 06_143_I | CAACATTGAACAAAGTCCTTG |
| 460 | rs140327598 | 06_143_D | TATACAACATTGTCCTCATGG |
| 461 | rs68078431 | 06_153_I | ATTTCCCCAATTTGATAATTTTT |
| 462 | rs68078431 | 06_153_D | TTGAATATTTCTTTTTTGTTCAG |
| 463 | rs11278298 | 06_158_I | GCTTTCATTCAGTCAGTCTC |
| 464 | rs11278298 | 06_158_D | AACTATGCTTTCAGTCTCTG |
| 465 | rs566489451 | 06_167_I | GCTGATAACATTCATTCATTC |
| 466 | rs566489451 | 06_167_D | GGCTGATAACATATTCATTCA |
| 467 | rs35345873 | 07_010_I | CAATCAATGGGTGGAACTG |
| 468 | rs35345873 | 07_010_D | CAATCAATGGTGGAACTGG |
| 469 | rs71552214 | 07_023_I | GATTTTGCCTGATAACCTTC |
| 470 | rs71552214 | 07_023_D | TGCTGCTGATTTCTTCTCTT |
| 471 | rs34786735 | 07_040_I | TGAGAAAAGCCCGTGAATG |
| 472 | rs34786735 | 07_040_D | TGAGAAAAGCCGTGAATGT |
| 473 | rs377131771 | 07_062_I | CCATTCGATGACGATTCCA |
| 474 | rs377131771 | 07_062_D | CATTCAATTCCATCCGATAATA |
| 475 | rs1610906 | 07_082_I | CATGATGGTATTATGATCTAGT |
| 476 | rs1610906 | 07_082_D | CATGATGGTATGATCTAGTATG |
| 477 | rs112677752 | 07_097_I | CAGTTAATGTATTTGGTTTCAC |
| 478 | rs112677752 | 07_097_D | CAGTTAATGTTTCACCTGC |
| 479 | rs35830730 | 07_112_I | CTGAGGCAGGAGAATCAC |
| 480 | rs35830730 | 07_112_D | GCTGAGGCAGAGAATCAC |
| 481 | rs3216282 | 07_126_I | ATTAACTCAGATAGCCCTAAG |
| 482 | rs3216282 | 07_126_D | ATTAACTCAGCCCTAAGAAG |
| 483 | rs35575707 | 07_140_I | TATTTGGCAGAGTCTTTTGT |
| 484 | rs35575707 | 07_140_D | ATATTTGGCAGTCTTTTGTTT |
| 485 | rs71520104 | 07_153_I | CTTATTTTCTGTACAGTGTTTTCAC |
| 486 | rs71520104 | 07_153_D | CTTATTTTCACTACGGTCAC |
| 487 | rs35146459 | 08_002_I | TGTCTTTGAGGTTTCCTCC |
| 488 | rs35146459 | 08_002_D | TGTCTTTGAGTTTCCTCCC |
| 489 | rs36048750 | 08_013_I | CATTAGTTTTCCCCATTTTACT |
| 490 | rs36048750 | 08_013_D | ACATTAGTTTTCCCATTTTACTT |
| 491 | rs34168882 | 08_033_I | AGCTTCCTCAGGTAAAATATTT |
| 492 | rs34168882 | 08_033_D | GGAAAGCTTCCTCAGTAAAATATT |
| 493 | rs35604660 | 08_058_I | TCGTACAAAGTGTCTACACTACA |
| 494 | rs35604660 | 08_058_D | TCTCGTACAAAGTCTACACTACA |
| 495 | rs34067160 | 08_064_I | GCTAAACCCAAAATATGAGTG |
| 496 | rs34067160 | 08_064_D | GCTAAACCCAATATGAGTGT |
| 497 | rs138172268 | 08_082_I | GACACTCTGTGTATCTAGCT |
| 498 | rs138172268 | 08_082_D | CGACACTCTGTATCTAGCT |
| 499 | rs35679778 | 08_103_I | ACAGTGGACTGTGGGGGT |
| 500 | rs35679778 | 08_103_D | ACAGTGGATGTGGGGGTG |
| 501 | rs11323264 | 08_125_I | CTCTGTGCAGGCACAGGT |
| 502 | rs11323264 | 08_125_D | CCTCTGTGCAGCACAGGT |
| 503 | rs6150855 | 08_139_I | CAAAGGCTGAGCAGATGC |
| 504 | rs6150855 | 08_139_D | CCTCGCAAATGCCGGCT |
| 505 | rs147918543 | 09_000_I | ACTTTTCTTTTCTCTGAATTTATATAG |
| 506 | rs147918543 | 09_000_D | CACTTTTCTTTTCTTGAATTTATATAG |
| 507 | rs66509579 | 09_021_I | CAGAAAATGATCATGATGCACA |
| 508 | rs66509579 | 09_021_D | TAGCAGAAAATGATGCACATTT |
| 509 | rs371766957 | 09_064_I | AGTCTATTGGAAATGTGCTAC |
| 510 | rs371766957 | 09_064_D | CTAAGTCTATTCTGTGCTACTG |
| 511 | rs71493646 | 09_072_I | ATGTGCTCCTCTCAACATC |
| 512 | rs71493646 | 09_072_D | CATCTATGTGCTCAACATCC |
| 513 | rs34499887 | 09_084_I | CAAAAATGGCAGTAGTGGGTCA |
| 514 | rs34499887 | 09_084_D | AAAATGGCATAGTGGGTCAGG |
| 515 | rs59923204 | 09_109_I | GTCTCAGCTCCTCCATTTGT |
| 516 | rs59923204 | 09_109_D | GTCTCAGCTCTCCATTTGT |
| 517 | rs55952736 | 09_117_I | ATTCAGTTATAGCAACAGAAA |
| 518 | rs55952736 | 09_117_D | TATTCAGTTAAACAGAAAACAG |
| 519 | rs71953876 | 09_132_I | AAGCCTCCACCCACCTTG |
| 520 | rs71953876 | 09_132_D | AAAGCCTCCACCTTGCAG |
| 521 | rs368278029 | 10_001_I | ACTATACTATATAATGTTACAC |
| 522 | rs368278029 | 10_001_D | ACTATACTATATGTTACACTG |
| 523 | rs71281575 | 10_026_I | GGGCTCAAGTGATCCTCCC |
| 524 | rs71281575 | 10_026_D | GGGCTCAAGTATCCTCCCG |
| 525 | rs202245860 | 10_035_I | TGCTTGAACCTGGGAGGTT |
| 526 | rs202245860 | 10_035_D | TGCTTGAACTGGGAGGTTG |
| 527 | rs34948479 | 10_047_I | ATGATACAGAGAGGCCCACT |
| 528 | rs34948479 | 10_047_D | AATGATACAGAGGCCCACTG |
| 529 | rs10552811 | 10_071_I | TGCCCAGGCTACACCCT |
| 530 | rs10552811 | 10_071_D | GATGCCCAGTACACCCTG |
| 531 | rs10555357 | 10_085_I | TGGCTCTTATGCCTTGCC |
| 532 | rs10555357 | 10_085_D | TGGCTCTTGCCTTGCCTA |
| 533 | rs140576359 | 10_117_I | GTTGCCGATATTCCAGGA |
| 534 | rs140576359 | 10_117_D | AAATGTTGCCAGGAGGTG |
| 535 | rs10544160 | 10_128_I | TTCAATGTTATACTCGTCCAT |
| 536 | rs10544160 | 10_128_D | TTCAATGTTACTCGTCCATG |
| 537 | rs10583916 | 11_006_I | GGGAATAACTGAGCATTCTG |
| 538 | rs10583916 | 11_006_D | TGGGAATAACAGCATTCTG |
| 539 | rs113764748 | 11_020_I | CATTAGCATAGCTGGATTTC |
| 540 | rs113764748 | 11_020_D | GCATTAGCATGGATTTCCT |
| 541 | rs57958958 | 11_034_I | GGGGAGCAAATGAATTACCAT |
| 542 | rs57958958 | 11_034_D | TTATGGGGATACCATATAAC |
| 543 | rs138278630 | 11_059_I | CATTGTGGAAGACTATGTG |
| 544 | rs138278630 | 11_059_D | CATTGTGGAAACTATGTGG |
| 545 | rs74933486 | 11_084_I | ATGAGTCTCAGTTTCTTCAT |
| 546 | rs74933486 | 11_084_D | AAATGAGTCTGTTTCTTCATT |
| 547 | rs35847449 | 11_094_I | ATCCAGAGTCCATAGAGTGA |
| 548 | rs35847449 | 11_094_D | CATCCAGAGTCATAGAGTGA |
| 549 | rs143339028 | 11_111_I | CTAACAAAAAGAAGACCATCT |
| 550 | rs143339028 | 11_111_D | TCTAACAAAAAGACCATCTGT |
| 551 | rs11394480 | 11_135_I | TCCGCAGTGGCAGGAGAG |
| 552 | rs11394480 | 11_135_D | TTCCGCAGTGCAGGAGAGC |
| 553 | rs10533848 | 12_013_I | ACACTCAGTTCTCTATTTCAG |
| 554 | rs10533848 | 12_013_D | ACACTCAGTTCTATTTCAGAG |
| 555 | rs35955982 | 12_024_I | TGCMTCCTATATATTTTCAGG |
| 556 | rs35955982 | 12_024_D | TTGCMTCCTATATTTTCAGGTG |
| 557 | rs10571534 | 12_074_I | AATGTGCAGAGTTTGAGCA |
| 558 | rs10571534 | 12_074_D | GAAATGTGCAGTTTGAGCAA |
| 559 | rs10689649 | 12_090_I | GTTTCCAAAACTCTTAGTATCA |
| 560 | rs10689649 | 12_090_D | AGTTTCCAAATTAGTATCAAAC |
| 561 | rs150767158 | 12_100_I | GCCTTCTTCTCATAAGAACCC |
| 562 | rs150767158 | 12_100_D | CATGCCTTCTTAAGAACCCT |
| 563 | rs10706208 | 12_128_I | TCAAACTCTTTTGGAAACGTCAAAG |
| 564 | rs10706208 | 12_128_D | TCAAACTCTTTTGAAACGTCAAAGTCA |
| 565 | rs142669819 | 13_039_I | AGGCAAATGCAATTGATTTC |
| 566 | rs142669819 | 13_039_D | CCCTAGGCAAATTGATTTCA |
| 567 | rs5803618 | 13_053_I | AAGCATTAGCTTTGTCTACT |
| 568 | rs5803618 | 13_053_D | AAGCATTAGTTTGTCTACTT |
| 569 | rs371764729 | 13_069_I | AGTCAGCAAACAACAGATGCTGG |
| 570 | rs371764729 | 13_069_D | AGTCAGCAAACAGATGCTGGAGA |
| 571 | rs67650090 | 13_087_I | CATTATCATTGTCTGCATAATCTG |
| 572 | rs67650090 | 13_087_D | GTCATTATCATTGCATAATCTGC |
| 573 | rs55812371 | 14_056_I | GAATATATACATGTTCCATTTTAC |
| 574 | rs55812371 | 14_056_D | GGAATATATTTTTACTAGGAACC |
| 575 | rs141061555 | 14_091_I | TAATAAGTAGTGAGTGAAATACC |
| 576 | rs141061555 | 14_091_D | CTTAATAAGTAGTGAAATACCAG |
| 577 | rs144457716 | 15_046_I | GTTGGAGGACTGACAGTTCACA |
| 578 | rs144457716 | 15_046_D | AAGTTGGAGGACAGTTCACATT |
| 579 | rs112548522 | 15_067_I | CTCAGTAAGAGTTTGTCAAATG |
| 580 | rs112548522 | 15_067_D | GAACTCAGTAAGTCAAATGGG |
| 581 | rs112792286 | 15_087_I | AGTTATTAAAACATTATTTTCTGTAAGA |
| 582 | rs112792286 | 15_087_D | CAGTTATTAAAACATTTTCTGTAAGACC |
| 583 | rs112880243 | 15_097_I | CCTAGCTTTTACTTAAGTGCAG |
| 584 | rs112880243 | 15_097_D | AGCCTAGCTTTTAAGTGCAG |
| 585 | rs35379530 | 16_000_I | TGCATCCTATGAAAATACCC |
| 586 | rs35379530 | 16_000_D | GTGCATCCTATAAAATACCCT |
| 587 | rs34436424 | 16_012 _I | AATGATTAGCGCAATGTGAT |
| 588 | rs34436424 | 16_012 _D | TTAATGATTAGCAATGTGATAT |
| 589 | rs3841767 | 16_024_I | CATCTGGCCCTTGTTCTC |
| 590 | rs3841767 | 16_024_D | ATCATCTGGCTTGTTCTCT |
| 591 | rs35709162 | 16_064_I | GTTGTATAGGGACAGGAGC |
| 592 | rs35709162 | 16_064_D | TGTTGTATAGGACAGGAGCT |
| 593 | rs34816330 | 16_076_I | GACTTCATGTCCCTCTTGAAA |
| 594 | rs34816330 | 16_076_D | TGACTTCATGTCCTCTTGAAA |
| 595 | rs11330085 | 17_001_I | GGACTCTGAGCCAGTACCCC |
| 596 | rs11330085 | 17_001_D | GGACTCTGAGCAGTACCCC |
| 597 | rs5821134 | 17_057_I | TGACTGTTACTCAGGAGAGT |
| 598 | rs5821134 | 17_057_D | CTATGACTGTTAGGAGAGTAAT |
| 599 | rs141730340 | 17_083_I | ACACCTGTGCAGCGCCT |
| 600 | rs141730340 | 17_083_D | AGCACACCTTCCATGAGA |
| 601 | rs35023498 | 18_001_I | GGTGCTGTTCTCGAGATAGT |
| 602 | rs35023498 | 18_001_D | TGGTGCTGTTCGAGATAGT |
| 603 | rs35452393 | 18_030_I | AGGGGAAACATGAGCAGTTG |
| 604 | rs35452393 | 18_030_D | AAGGGGAAACGAGCAGTTGTG |
| 605 | rs33990768 | 18_051_I | TCACTCAATGGTGCCAGGCA |
| 606 | rs33990768 | 18_051_D | CATCACTCAATGTGCCAGGCA |
| 607 | rs66933419 | 18_065_I | AGTGATGGCCCCCACACTTG |
| 608 | rs66933419 | 18_065_D | ACAGTGATGGCCCACACTTG |
| 609 | rs66502030 | 18_075_I | CTGAGACMCTGTGGCTCCTC |
| 610 | rs66502030 | 18_075_D | GAACTGAGACMCTGGCTCCTC |
| 611 | rs60503836 | 19_002_I | TGATCTCGGCTAACTGCGAC |
| 612 | rs60503836 | 19_002_D | TGATCTCGGTAACTGCGACC |
| 613 | rs112906660 | 19_015_I | CCCCTGCAAATAATAAGGA |
| 614 | rs112906660 | 19_015_D | ATCCCCTGCAAATAAGGAATG |
| 615 | rs112877961 | 19_029_I | GAAGCCAGCAGCCTGCTG |
| 616 | rs112877961 | 19_029_D | GGAAGCCAGAGCCTGCTG |
| 617 | rs34242584 | 19_044_I | ATCATTTTATTGTGATTCTTAGC |
| 618 | rs34242584 | 19_044_D | GTATCATTTTATTGATTCTTAGCT |
| 619 | rs79282333 | 20_005_I | TATCTACTCATGTGTGTAGTTA |
| 620 | rs79282333 | 20_005_D | TTATCTACTCGTGTGTAGTTAT |
| 621 | rs35894782 | 20_020_I | CACAAAATAGAATAGGGTTTTC |
| 622 | rs35894782 | 20_020_D | GGCCACAAAATAGGGTTTTCC |
| 623 | rs73622051 | 20_039_I | GCCTTTCTTTATTTATAACTTCTC |
| 624 | rs73622051 | 20_039_D | GAGCCTTTCTTTATAACTTCTCT |
| 625 | rs66555516 | 20_058_I | TTTCCATGTGGTGGACAGG |
| 626 | rs66555516 | 20_058_D | ATTTCCATGTGGACAGGTG |
| 627 | rs138066060 | 21_010_I | ACTACTCCCAGGTGTATGT |
| 628 | rs138066060 | 21_010_D | TACTACTCCAGGTGTATGTG |
| 629 | rs10583984 | 21_038_I | AATATGCAGAGACTCTGAAA |
| 630 | rs10583984 | 21_038_D | GAAATATGCAGACTCTGAAAT |
| 631 | rs112408318 | 21_042_I | AAGACACATACAAGAACGTC |
| 632 | rs112408318 | 21_042_D | CAAAGACACAAGAACGTCC |
| 633 | rs60228580 | 22_033_I | TACTCACATGGTTGTCAACA |
| 634 | rs60228580 | 22_033_D | CTACTCACATGTTGTCAACA |
| 635 | rs67057410 | 22_046_I | ACACAGGCTGGGAGTGTAGT |
| 636 | rs67057410 | 22_046_D | CACACAGGCTGGAGTGTAGTG |
| 637 | rs35997669 | X_004_I | CATCTTCAACAACATGCG |
| 638 | rs35997669 | X_004_D | CCATCTTCAAAACATGCG |
| 639 | rs57522085 | X_029_I | TTCCTACTTCCTAGGGAAC |
| 640 | rs57522085 | X_029_D | TTCCTACTTCTAGGGAACC |
| 641 | rs202172626 | X_083_I | CTTTCATCTTAACTTAAGTTACTG |
| 642 | rs202172626 | X_083_D | ACACTTTCATCTTAAGTTACTG |
| 643 | rs34991528 | X_095_I | GTGATGTTGCCATCCTTG |
| 644 | rs34991528 | X_095_D | GTGATGTTGCATCCTTGAT |
| 645 | rs35020323 | X_138_I | CAGCAACTCTATTTAAATAAATG |
| 646 | rs35020323 | X_138_D | CAGCAACTCTAAATAAATGGA |
| 647 | rs10689407 | X_141_I | AAATTATTTCACATGAGTGCT |
| 648 | rs10689407 | X_141_D | GAAATTATTTCACGAGTGCT |
Для генотипирования с помощью гибридизации, аллель-специфичные ДНК-зонды закрепляются любым известным способом на подложке. Для этого наиболее применима технология биочипов, как двумерных, с креплением зондов к плоскости, так и трехмерных, с иммобилизацией в массе пористого полимерного носителя. Для закрепления ДНК-зондов, к ним может быть привита соответствующая химическая группа, или любое иное соединение, способствующее реализации данной цели. ДНК-зонды располагают на подложке согласно заданной схемы. Схема расположения ячеек может быть произвольной, мы использовали схему, приведенную на Фиг. 1. Для проведения гибридизации ПЦР-продукт обычно смешивают с буферным раствором, который также может содержать денатурирующие агенты (формамид, диметилсульфоксид, гуанидин и другие), и наносят на биочип. Условия гибридизации подбираются таким образом, чтобы флуоресцентно-меченные одноцепочечные фрагменты ДНК специфично связывались с полностью комплементарными им ДНК-зондами, локально иммобилизованными на биочипе. Для того, чтобы определить генотип образца, необходимо зарегистрировать флуоресцентное изображение биочипа. ДНК-зонды, образовавшие совершенные дуплексы с исследуемым фрагментом ДНК, будут флуоресцировать в соответствующем флуорофору диапазоне длин волн. Для регистрации флуоресцентного изображения могут быть использованы сканеры, широкопольные микроскопы, или иные подходящие для этого средства. Флуоресцентное изображение анализируется и обсчитывается с помощью программного обеспечения. Пример такого изображения приведен на Фиг. 2. На Фиг. 3 приведены варианты гибридизационного изображения в зависимости от аллельного состояния маркера в образце. Интерпретация результатов генотипирования проводится экспертом исходя из общеизвестных генетических принципов наследования биаллельных маркеров.
Список литературы:
1. Степанов B.A., Балановский О.П., Мельников А.В., Лаш-Завада А.Ю., Харьков В.Н., Тяжелова Т.В., Ахметова В.Л., Жукова О.В., Шнейдер Ю.В., Шильникова Н.Н., Боринская С.А., Марусин А.В., Спиридонова М.Г., Симонова К.В., Хитринская И.Ю., Раджабов М.О., Романов А.Г., Штыгашева О.В., Кошель СМ., Балановская Е.В., Рыбакова А.В., Хуснутдинова Э.К., Пузырев В.П., Янковский Н.К. Характеристика популяций Российской Федерации по панели пятнадцати локусов, используемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе.// Acta Naturae. 2011. Т.3. №2. С.59-71.
2. Ковтун П.А. Куклев М.Ю. Лапенков М.И. Плахина И.В. Недостаточность аутосомных STR-маркеров для достоверного установления родства в дуэтах родитель - ребенок // Судебно-медицинская экспертиза. М., 2013. №6. С. 17-22.
3. Ефремов И.А. Носиков В.В. Скоблилов Е.Ю. Законова А.Ф. Иванов П.Л. О возможных затруднениях молекулярно-генетической экспертизы при недостаточно высокой индивидуализирующей значимости результатов (на примере сложного случая оспариваемого материнства). // Судебно-медицинская экспертиза. М., 2001. №1. С. 11.
4. Alonso A, Martin P, 
C, Garcia P, Fernandez de Simon L, 
Iturralde M, 
A, Atienza I, Capilla J, 
J, Martinez P, Vallejo G, 
O, E, Real P, Alvarez D, 
A, Sancho M. Challenges of DNA profiling in mass disaster investigations. // Croatian medical journal, 2005. Vol. 46(4): P. 540-548.
5. Burgarella C, 
M. Mutation rate estimates for 110 Y-chromosome STRs combining population and father-son pair data. // Eur. J. Hum. Genet. 2011. №19, P.70-75.
6. Balanovsky,O. Toward a consensus on SNP and STR mutation rates on the human Y-chromosome Hum Genet. 2017. Vol.136, P. 575
7. A kind of mankind's autosome and Y chromosome InDel genetic polymorphisms site composite amplification reagent kit and its application. Патент №CN106868150A.
8. Pena HB, Pena SD. Automated Genotyping of a Highly Informative Panel of 40 Short Insertion-Deletion Polymorphisms Resolved in Polyacrylamide Gels for Forensic Identification and Kinship Analysis. Transfus Med Hemother. // 2012. Vol. 39. №3. P.211-216.
9. Bobby L, La Rue, Ge J, King JL, Budowle B. A validation study of the Qiagen Investigator DIPplex® kit; an INDEL-based assay for human identification . Int J Legal Med // 2012. Vol.126 P.725-737
10. Fairley S, Lowy-Gallego E, Perry E, Flicek P. The International Genome Sample Resource (IGSR) collection of open human genomic variation resources. Nucleic Acids Research.// 2020. Vol. 48. P.941-947.
11. Du W, Peng Z, Feng C, Zhu B, Wang B, Wang Y, Chao L, Chen L. Forensic efficiency and genetic variation of 30 InDels in Vietnamese and Nigerian populations. Oncotarget.// 2017; №8 P.88934-88940
Описание чертежей
На Фигуре 1 приведен один из множества возможных вариантов схемы расположения ячеек с олигонуклеотидными ДНК-зондами, который мы использовали для иллюстрации осуществления данного изобретения. Номера на схеме соответствуют номерам олигонуклеотидов в Перечне последовательностей (SEQ ID NO: 325-648)Данная схема не является принципиальной и дизайн ее может быть произвольным.
На Фигуре 2 приведено флуоресцентное изображение биочипа после проведения гибридизации.
На Фигуре 3 приведены флуоресцентные изображения трех вариантов аллельного состояния любого из используемых в данном изобретении маркера: гомозигота по инсерции (In/In, Фиг. 3А), гетерозигота (In/Del, Фиг.3Б) и гомозигота по делеции (Del/Del, Фиг. 3В).
Осуществление изобретения
Пример 1. Олигонуклеотидный биочип для генотипирования 162 инсерционно-делеционных полиморфизмов.
Олигонуклеотидные ДНК-зонды синтезировалит согласно перечню SEQ ID N0: 325-SEQ ID N0: 648 (Таблица №2) таким образом, что 3’-конец олигонуклеотидов содержит спейсер со свободной аминогруппой. Биочип изготавливали методом сополимеризации олигонуклеотида в акриламидном геле аналогично описаному ранее (Патент на изобретение N 2175972 «Способ иммобилизации олигонуклеотидов, содержащих непредельные группы, в полимерных гидрогелях при формировании микрочипа» Мирзабеков А.Д., Рубина А.Ю., Паньков С.В., Чернов Б.К. Приоритет от 28.12.1999), а именно, готовили полимеризационную смесь, соответствующую 5% полиакриламидному гелю: 5% акриламид-бисакриламид (19:1), 40% глицерин, 2% ацетон, 1,2% ТЕМЕД, 0,1 М натрий фосфатный буфер, pH 7,0. Концентрация ДНК-зондов составляла 200 мкМ. Капли наносили с помощью роботизированной станции QArray 2 (Genetix Ltd, New Milton, Hampshire, UK) на пластиковую подложку. Ячейки наносили рядами, согласно схеме на Фиг. 1. Верхние ячейки в каждом ряду соответствуют инсерционным аллелям, а нижние - делеционным. Диаметр капли 50-100 мкм. Полимеризацию проводили под УФ лампой в атмосфере азота. Время экспозиции 40 мин при длине волны 254 нм. После проведения сополимеризации проводили отмывку от непрореагировавших реагентов в дистиллированой воде. Биочип высушивали при комнатной температуре и помещали на хранение в темное сухое место.
Пример 2. Мультиплексная амплификация 162 локусов, содержащих генотипируемые инсерционно-делеционные полиморфизмы методом ПЦР с целью наработки одноцепочечных флуоресцентно меченых фрагментов.
Из слюны испытуемых выделяли ДНК набором Lumipure (ООО «Биотех-индустрия», Москва). Для мультиплексной наработки всех анализируемых генов использовали ПЦР-праймеры SEQ ID NO: 1-324 в концентрации от 1 нМ до 0,5 мкМ, отличающиеся тем, что каждый обратный праймер с четным номером «Seq ID» (Seq ID NO:2, Seq ID NO:4… Seq ID NO:324), имел со стороны 5'-конца универсальную олигонуклеотидную вставку, с последовательностью 5'-TCATTGGATCTCATTA-3'. Флуоресцентно меченый (Су5-, возб./исп.: 640/657 нм) универсальный праймер Су5-TCATTGGATCTCATTA-3'добавляли в конечной концентрации 6 мкМ. ПЦР проводили на амплификаторе T-100 (Bio-Rad laboratories, США) в объеме 25 мкл реакционной смеси, составом: 1× буфер (67 мМ Трис-HCl, pH 8,6, 166 мМ (NH4)2SO4, 0,01% Тритон Х-100), 2,0 мМ MgCl2, 0,2 мМ каждого из dNTP («Силекс», Россия), ПЦР-праймеры (SEQ ID NO: 1-324) в концентрации от 1 нМ до 0,5 мкМ, 1 мкл геномной ДНК и 2,5 ед. акт. HotTaq-полимеразы («Сибэнзим», Россия). Амплификацию проводили по программе:
| № | Температура | Время | Количество циклов |
| 1 | 95°С | 1 мин | 1 |
| 2 | 95°С | 30 сек | 50 |
| 3 | 64°С | 60 сек | |
| 4 | 72°С | 20 сек | |
| 5 | 95°С | 20 сек | 50 |
| 6 | 50°С | 10 сек | |
| 7 | 72°С | 30 сек | |
| 8 | 72°С | 5 мин | 1 |
Пример 3. Гибридизация флуоресцентно-меченого ПЦР-продукта на биочипе и регистрация результатов.
ПЦР-продукт, полученный в Примере 2 использовали для гибридизации на биочипе, полученном в Примере 1, в буфере следующего состава: 25% формамид (Gibco BRL), 5хSSPE. 30 мкл смеси вносили в гибридизационную камеру биочипа. Гибридизацию проводили в течение 5 ч при температуре 37°С. Отмывку выполняли в буфере 1х SSPE при комнатной температуре в течение 10 мин.
Регистрацию гибридизационной картины производили с помощью универсального аппаратно-программного комплекса (УАПК), производства ООО «БИОЧИП-ИМБ» (Москва). На Фиг.2 приведено флуоресцентное изображение биочипа после гибридизации и отмывки. Описание алгоритма автоматического анализа изображения с помощью программного обеспечения выходит за рамки настоящего изобретения.
--->
SEQUENCE LISTING
<110> Fesenko, Denis O
Ivanovskii, Ivan D
<120> Способ идентификации личности и установления родства с помощью InDel полиморфизмов и набор синтетических олигонуклеотидов для их генотипирования
<130> CID 1.6
<160> 648
<170> PatentIn version 3.1
<210> 1
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_007_F
<400> 1
tggactttat tattatggtc tggagcagca 30
<210> 2
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_007_R
<400> 2
tgcatgagtg attccttaaa accagacac 29
<210> 3
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_031_F
<400> 3
agccatgtag atgctrtcat caacagct 28
<210> 4
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_031_R
<400> 4
tgcaattttg gataccaatg accacaaga 29
<210> 5
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_041_F
<400> 5
actttgtgac cgtcttctct cttgg 25
<210> 6
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_041_R
<400> 6
ccaagagggg tgcactgctc c 21
<210> 7
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_059_F
<400> 7
gcacagaatc cagcaggtag taaggg 26
<210> 8
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_059_R
<400> 8
cacaatgtta aatctgtttg ttaaggggag 30
<210> 9
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_083_F
<400> 9
tgatcactgt attcctgacc cagtttca 28
<210> 10
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_083_R
<400> 10
cactttaact tctgtttaga acacatagt 29
<210> 11
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_101_F
<400> 11
agtgtaaaaa ygactgctta gacatttct 29
<210> 12
<211> 35
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_101_R
<400> 12
tcatttgaca gatattgaat caaattggat tctga 35
<210> 13
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_119_F
<400> 13
agcagcaggt aaaacaacta tcgttc 26
<210> 14
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_119_R
<400> 14
ctaggggagc cagagagcct tttc 24
<210> 15
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_154_F
<400> 15
acagattcct ttgattgcct gatgag 26
<210> 16
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_154_R
<400> 16
gccggtgcat tctccccttc ag 22
<210> 17
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_170_F
<400> 17
cttgtttcag atatgcaggc tgaga 25
<210> 18
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_170_R
<400> 18
tgctrgcaaa cttaggcaat taagttaaca tc 32
<210> 19
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_192_F
<400> 19
tctagttgag tcacttgagc tctattagac 30
<210> 20
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_192_R
<400> 20
aactcctaac tgcttaatgt agcagg 26
<210> 21
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_208_F
<400> 21
tggtcactcc tctttgcact gcg 23
<210> 22
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_208_R
<400> 22
cccatcctcc cgaagcacat ctac 24
<210> 23
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_223_F
<400> 23
ggagaggggt gtccgactca gg 22
<210> 24
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_223_R
<400> 24
ccttcctgag acagctgaaa tgt 23
<210> 25
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_233_F
<400> 25
caacattgca aaaatgaacg ctgactac 28
<210> 26
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_233_R
<400> 26
ctctatactt agtcatttgt tgcatttctg g 31
<210> 27
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_240_F
<400> 27
cttcaatgaa gaactgttaa gaattaaagg c 31
<210> 28
<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_240_R
<400> 28
cttaaaatat gtagtgtgta cccaatcatt tgc 33
<210> 29
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_011_F
<400> 29
cacgtgggtg gtcactcaca cc 22
<210> 30
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_011_R
<400> 30
cttatctcca atagatcagt gaagaaacag g 31
<210> 31
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_036_F
<400> 31
gccatagaat ttctctcatg gctctac 27
<210> 32
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_036_R
<400> 32
gtgaaattca gctataagga gatgaagcc 29
<210> 33
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_042_F
<400> 33
agaggagaat gaatgttgga gtaagc 26
<210> 34
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_042_R
<400> 34
cagagtgaca ggtcaacact taccc 25
<210> 35
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_061_F
<400> 35
aggcctgtaa tggattacaa aatggccaca 30
<210> 36
<211> 40
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_061_R
<400> 36
agcaaagtca cattgcaaat tcttgtacat ataatgatgg 40
<210> 37
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_080_F
<400> 37
cagctctaag accacacatt ctgc 24
<210> 38
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_080_R
<400> 38
actggccatg caggtattct agg 23
<210> 39
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_101_F
<400> 39
tcagggttga ccagcagttt aagtg 25
<210> 40
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_101_R
<400> 40
gaattcagtt ttcactcatg agtttagctg 30
<210> 41
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_113_F
<400> 41
aggcggaaat aagtgaccca gagaaaaacg ct 32
<210> 42
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_113_R
<400> 42
tgccgcctcc tgcaactcct tca 23
<210> 43
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_150_F
<400> 43
aggcaccttg tgagaaaaga ttgg 24
<210> 44
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_150_R
<400> 44
cctaggcttg ctgggaagtc ctc 23
<210> 45
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_215_F
<400> 45
acccaagaat atgaaggacc aactg 25
<210> 46
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_215_R
<400> 46
tcatcacatt ctgcactcat aatcagc 27
<210> 47
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_231_F
<400> 47
aggagaccac tcaaagaatc ctactc 26
<210> 48
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_231_R
<400> 48
tcagtttagg tgcacagaat aagtcac 27
<210> 49
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_016_F
<400> 49
aggaccaagg ctgcagagaa agg 23
<210> 50
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_016_R
<400> 50
cggctctcct tccaagtcag gac 23
<210> 51
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_030_F
<400> 51
tgatgtaatt taaagtgagc cagccagacr ta 32
<210> 52
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_030_R
<400> 52
tgactcttct cccacctaac tcaagtttga 30
<210> 53
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_063_F
<400> 53
gttaggaaat ratcccagga aataggaatg 30
<210> 54
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_063_R
<400> 54
ctactccatc ataggctctt gtattgg 27
<210> 55
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_082_F
<400> 55
ctgtgttgta ttctgttatt gctacttgc 29
<210> 56
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_082_R
<400> 56
ttgccattct aagatttctc tcttcctg 28
<210> 57
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_100_F
<400> 57
cgttcacatg tcaggtacta actctc 26
<210> 58
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_100_R
<400> 58
tggtggggat gaggtacaga ctg 23
<210> 59
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_107_F
<400> 59
caatctaagt tgtcttaccc tgtggc 26
<210> 60
<211> 35
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_107_R
<400> 60
tttctagttc tcatattcca tgattgtatt ttgag 35
<210> 61
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_124_F
<400> 61
aggaatgaca ggaaagtctt aatgagc 27
<210> 62
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_124_R
<400> 62
acatcatgca ttgtttgaat catctctg 28
<210> 63
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_162_F
<400> 63
ctctgtcacc taggctggag tgc 23
<210> 64
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_162_R
<400> 64
agaatcactt gaacccggga ggcagtg 27
<210> 65
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_182_F
<400> 65
gagtccctct ctttctactg twtggaatag t 31
<210> 66
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_182_R
<400> 66
agaggtacaa agagaagctg gtacca 26
<210> 67
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_194_F
<400> 67
ttcctggacg tgtgaattga tgc 23
<210> 68
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_194_R
<400> 68
gaagacagac agaacactcc tgc 23
<210> 69
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_008_F
<400> 69
aggatctgga cttgctctgg ggcag 25
<210> 70
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_008_R
<400> 70
gcagggctct gggaaatttg ggtgc 25
<210> 71
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_027_F
<400> 71
tattcactat ggttaccatg cagtacaag 29
<210> 72
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_027_R
<400> 72
tgttgaacaa acagtacaaa gtttcagac 29
<210> 73
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_045_F
<400> 73
cagatcgctg ggctattagg tg 22
<210> 74
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_045_R
<400> 74
tactggccag ctgcagcctc tac 23
<210> 75
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_056_F
<400> 75
gctgtggagt ataatttgta gggagac 27
<210> 76
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_056_R
<400> 76
catactgtat cttacttgag tgtttcatct c 31
<210> 77
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_065_F
<400> 77
tgggaatact agggaagcat tgggaagtga ct 32
<210> 78
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_065_R
<400> 78
rgctattggt accagacata aacrtatatg ca 32
<210> 79
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_085_F
<400> 79
gttcaagcaa taatcattga tctgtgcc 28
<210> 80
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_085_R
<400> 80
gtgagtctta ttttttccct gtgtctgt 28
<210> 81
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_112_F
<400> 81
agtaacttct ccatgcatca cattattc 28
<210> 82
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_112_R
<400> 82
cacaaacaga ggccaggtaa 20
<210> 83
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_137_F
<400> 83
acctgccctg actatatctg ta 22
<210> 84
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_137_R
<400> 84
catatcagct ttttcctcct ccttca 26
<210> 85
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_154_F
<400> 85
tctcacaaaa tatacatgta gcagtggata 30
<210> 86
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_154_R
<400> 86
gttactgaag gtagtatagc tctaggca 28
<210> 87
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_177_F
<400> 87
ccttcccttc cattttgtat atctg 25
<210> 88
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_177_R
<400> 88
cctagtcaga ggaacatttt gaag 24
<210> 89
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_003_F
<400> 89
ctctgttcct ttgctgaaaa atgac 25
<210> 90
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_003_R
<400> 90
agatgttttc aggtgggagg aata 24
<210> 91
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_013_F
<400> 91
ggaagatgat gtgaatgtac acaag 25
<210> 92
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_013_R
<400> 92
tgtggcagtc ctagtccagt ctc 23
<210> 93
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_065_F
<400> 93
cccatatatt ttccttcctg gtgca 25
<210> 94
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_065_R
<400> 94
ccctaccctg acaaatacat gaacta 26
<210> 95
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_074_F
<400> 95
tgttccttat ttctggaaga gccc 24
<210> 96
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_074_R
<400> 96
tgccagacct atgcataaaa aagg 24
<210> 97
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_087_F
<400> 97
gctaaacatt gagcacacat gga 23
<210> 98
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_087_R
<400> 98
gattgttttt taacccatgc cctttc 26
<210> 99
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_096_F
<400> 99
ctagcaaggg tgagaattag tgact 25
<210> 100
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_096_R
<400> 100
gaacacatct tggtaagcag cact 24
<210> 101
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_115_F
<400> 101
tgcagttcag ctgacttcac 20
<210> 102
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_115_R
<400> 102
ggggttaaga gtttcagcat g 21
<210> 103
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_119_F
<400> 103
cctaactacc tgtttacaag gcaattca 28
<210> 104
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_119_R
<400> 104
cacagtttgg aaatggttaa ttgtattct 29
<210> 105
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_132_F
<400> 105
ggaactccag gacccaacag a 21
<210> 106
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_132_R
<400> 106
agccatgttt ctgtctcagc a 21
<210> 107
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_141_F
<400> 107
aggcttctaa ttggtttccg ca 22
<210> 108
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_141_R
<400> 108
caagatataa taacaaatca gagtgga 27
<210> 109
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_151_F
<400> 109
tgctgctgtg aagatgagaa gg 22
<210> 110
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_151_R
<400> 110
gtaggggctt tggtaaatat agtca 25
<210> 111
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_180_F
<400> 111
agccatgcgt tgctttaagc ca 22
<210> 112
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_180_R
<400> 112
cccagcctgt agtatgtttc aatatcat 28
<210> 113
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_007_F
<400> 113
ctcactacca agtcaaaccc a 21
<210> 114
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_007_R
<400> 114
tgagggaata ggcgcagtat a 21
<210> 115
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_016_F
<400> 115
catggtccca aagccatcac agc 23
<210> 116
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_016_R
<400> 116
acacattgct ccttcttcat catc 24
<210> 117
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_031_F
<400> 117
agcctctttg crtggctctt tctggc 26
<210> 118
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_031_R
<400> 118
agtgtgtacg atttcatttc tgatgtctct 30
<210> 119
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_057_F
<400> 119
agatcctcgc taatcaatta gagcaca 27
<210> 120
<211> 34
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_057_R
<400> 120
agtattcaca tatttgcaat taggatatat tcct 34
<210> 121
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_071_F
<400> 121
ccaaggtaaa catcgttagt ttctcca 27
<210> 122
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_071_R
<400> 122
gaagcccaaa cagaaaagca ag 22
<210> 123
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_077_F
<400> 123
ttctcaatga atacagcctg tgact 25
<210> 124
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_077_R
<400> 124
cttagtaaat agcctaagcg attttgtca 29
<210> 125
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_087_F
<400> 125
cagttcccac ctgtatgctg tg 22
<210> 126
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_087_R
<400> 126
aggagggagg tggatctcag c 21
<210> 127
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_096_F
<400> 127
ttgcctccaa agtctctgac ac 22
<210> 128
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_096_R
<400> 128
acaaatgact ctggcagagg tg 22
<210> 129
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_113_F
<400> 129
actttttaat gatcaccatt ctaactggtg 30
<210> 130
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_113_R
<400> 130
tcagagaaat gcaaatcaaa accacaatg 29
<210> 131
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_125_F
<400> 131
ataggcagct gtggtatggg a 21
<210> 132
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_125_R
<400> 132
gtacctggct cccctgctgt 20
<210> 133
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_135_F
<400> 133
agggaaatga aagacaatta gagaagt 27
<210> 134
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_135_R
<400> 134
tgtccctgat ctgtgttcac ac 22
<210> 135
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_143_F
<400> 135
atcttaaaat gctagacact gttttagag 29
<210> 136
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_143_R
<400> 136
tttcttccac tagaatgtaa gcc 23
<210> 137
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_153_F
<400> 137
gtgcacatgc atgtttgaat ag 22
<210> 138
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_153_R
<400> 138
gtatattcaa aacaagagtc gaagcca 27
<210> 139
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_158_F
<400> 139
gtgtgacgtt tcagttaata gtggtgg 27
<210> 140
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_158_R
<400> 140
tctcctgcat aaagtatgaa ttttcgt 27
<210> 141
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_167_F
<400> 141
ccttgagcct ggctgtaatc 20
<210> 142
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_167_R
<400> 142
catggtaggc ccacaggaaa ta 22
<210> 143
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_010_F
<400> 143
agaagagaaa agtgaggtag ttgcta 26
<210> 144
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_010_R
<400> 144
atggttgcat attaatgcct aagcttg 27
<210> 145
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_023_F
<400> 145
cccaagcact tttctatatt ctatcacctc tg 32
<210> 146
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_023_R
<400> 146
ttgggttaat gtgtgttgta ttcagc 26
<210> 147
<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_040_F
<400> 147
gcataattga tagatcagct ctagaagaat yac 33
<210> 148
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_040_R
<400> 148
actgctttcc tcacagattt gtacattca 29
<210> 149
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_062_F
<400> 149
ggatgattcc acttgaatcc attcaaaga 29
<210> 150
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_062_R
<400> 150
cctttggaac cattgaatag aaaggaatg 29
<210> 151
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_082_F
<400> 151
ccagtagaca caatgatatt gacaaatag 29
<210> 152
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_082_R
<400> 152
gcaggatatt ttgatattga gagtttg 27
<210> 153
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_097_F
<400> 153
cagagactat cttaaatatg catttctatg 30
<210> 154
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_097_R
<400> 154
cctaacagct cgacaaatat tgcag 25
<210> 155
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_112_F
<400> 155
ctgtaatccc agctactcag gaggctg 27
<210> 156
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_112_R
<400> 156
tctgcttccc gggttcaagt gattc 25
<210> 157
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_126_F
<400> 157
ccaagttcat acaaagttca caacca 26
<210> 158
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_126_R
<400> 158
caacaatgaa aaaaacatct atagtagcac t 31
<210> 159
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_140_F
<400> 159
ttccacattg tgctggtggt tct 23
<210> 160
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_140_R
<400> 160
ctcaacactg gcaggtatag ca 22
<210> 161
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_153_F
<400> 161
tgcggttcca tcaaagccac arccctg 27
<210> 162
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_153_R
<400> 162
aacaagacat agggtgaccg tagtg 25
<210> 163
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_002_F
<400> 163
gactgtccat tgtttgctgc acttgtc 27
<210> 164
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_002_R
<400> 164
agggaatgac gctcatggga gg 22
<210> 165
<211> 36
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_013_F
<400> 165
tccatgagaa taactatagt atgctaagta atacat 36
<210> 166
<211> 34
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_013_R
<400> 166
tccactgaga atacatgatc tattaagtaa aatg 34
<210> 167
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_033_F
<400> 167
tggacccaat aaaacttggt gaaataaaat g 31
<210> 168
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_033_R
<400> 168
tcaagtcttg tcctatcatg tttctgatga 30
<210> 169
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_058_F
<400> 169
tgctctctga acagacgtca tgg 23
<210> 170
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_058_R
<400> 170
gctatacagt gctggagaaa tactctg 27
<210> 171
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_064_F
<400> 171
acccctcacc ctttactttg tagg 24
<210> 172
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_064_R
<400> 172
caaagaggca tattttgggg tgg 23
<210> 173
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_082_F
<400> 173
cagggtttgt gaatgcacca atc 23
<210> 174
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_082_R
<400> 174
tttccaagtc cccaccagag gag 23
<210> 175
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_103_F
<400> 175
taagctcagg gaagcactgc ctgaca 26
<210> 176
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_103_R
<400> 176
agagcaacca tcccccaccc cc 22
<210> 177
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_125_F
<400> 177
tccacggcac cacattcaag gcctctg 27
<210> 178
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_125_R
<400> 178
agcagaggcg aagtgtgaga cctgt 25
<210> 179
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_139_F
<400> 179
ggagtaaaaa cttcctgagg cctc 24
<210> 180
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_139_R
<400> 180
gcaaaccatt caggaagcgt gga 23
<210> 181
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_000_F
<400> 181
acactcactg atcaaggatt tctaaaacca 30
<210> 182
<211> 37
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_000_R
<400> 182
agcctataag acattccttt atgagtgata caaagtc 37
<210> 183
<211> 40
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_021_F
<400> 183
gggttatttc tatataaaaa cgagcataaa attatagcag 40
<210> 184
<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_021_R
<400> 184
taacaccatg ttttttcttc aaaaatgtgc atc 33
<210> 185
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_064_F
<400> 185
gtactgacag aaggctcatg agtta 25
<210> 186
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_064_R
<400> 186
attaccacac cactctttac tacag 25
<210> 187
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_072_F
<400> 187
attcctcttg acatccagcc accc 24
<210> 188
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_072_R
<400> 188
ctagcaagac agacatacaa gctg 24
<210> 189
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_084_F
<400> 189
cctcgaggtg gcttgtttgr gtgc 24
<210> 190
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_084_R
<400> 190
acctgcccac caacctgacc ca 22
<210> 191
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_109_F
<400> 191
agaccagaaa ttggaaaatg ttacagtggt c 31
<210> 192
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_109_R
<400> 192
accaaggaca catagctgac aaatgga 27
<210> 193
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_117_F
<400> 193
aatttatttt ctccataaac tacctagtct ca 32
<210> 194
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_117_R
<400> 194
gcaatgttat tgttccattg tgtcttagtc t 31
<210> 195
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_132_F
<400> 195
ttactgagat gcccaacctg cgt 23
<210> 196
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_132_R
<400> 196
ccgtttcctc cgcacttatg ctgc 24
<210> 197
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_001_F
<400> 197
gctataccat ttctcctatt gtata 25
<210> 198
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_001_R
<400> 198
aggtagcrta gagtagaaga aacagtgtaa c 31
<210> 199
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_026_F
<400> 199
ccaggctggt ctcaaactcc tgggc 25
<210> 200
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_026_R
<400> 200
taggaggccg aagcgggagg 20
<210> 201
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_035_F
<400> 201
tactcaggag gctgaggcag gag 23
<210> 202
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_035_R
<400> 202
tgcggtggca cgatctgggc tc 22
<210> 203
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_047_F
<400> 203
gagtcatgat tcacragcag ttgtaagcaa tg 32
<210> 204
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_047_R
<400> 204
tggggaaaac tgggtacagg gtacagt 27
<210> 205
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_071_F
<400> 205
gagtcaccca gagggatttt gacaat 26
<210> 206
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_071_R
<400> 206
cccacttaga aaaatccaat gagaatctca 30
<210> 207
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_085_F
<400> 207
tcagccacag aggaacagcc ag 22
<210> 208
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_085_R
<400> 208
gctttgccca actcacagaa ttac 24
<210> 209
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_117_F
<400> 209
aggaattcat ggcttaggtt ggaac 25
<210> 210
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_117_R
<400> 210
ccgatctata ttcctgttct gatgtc 26
<210> 211
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_128_F
<400> 211
cagcactgaa atttaaaatc ctggtcct 28
<210> 212
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_128_R
<400> 212
ccgccaggga aaacaagcca catg 24
<210> 213
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_006_F
<400> 213
acttcctgta tcattaattc cacctag 27
<210> 214
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_006_R
<400> 214
gcagcactct gaacttttta ttgtctc 27
<210> 215
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_020_F
<400> 215
taggagttct gactcagttc tggtg 25
<210> 216
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_020_R
<400> 216
ctgaccaaaa ctcaatggcc tttc 24
<210> 217
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_034_F
<400> 217
atgggcgtat aaatattgcc tttctca 27
<210> 218
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_034_R
<400> 218
agacacactc cctaaggtgt tatatg 26
<210> 219
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_059_F
<400> 219
tggtgggagt gtaaattagt tcaacca 27
<210> 220
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_059_R
<400> 220
tggttctaga tccttgagga atcaccac 28
<210> 221
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_084_F
<400> 221
ctaccagctc tttgtgtgtc ctaga 25
<210> 222
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_084_R
<400> 222
ttcttagaac tttccatatg gccattg 27
<210> 223
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_094_F
<400> 223
ttatgctata aattagcaaa cccaacacat c 31
<210> 224
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_094_R
<400> 224
gcagttcacc ctctaaaacc attcactc 28
<210> 225
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_111_F
<400> 225
agagggagga gtcgtgattg tct 23
<210> 226
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_111_R
<400> 226
ctgagcaggc tgccggaaac 20
<210> 227
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_135_F
<400> 227
aagcccttgg ccatacataa ggctc 25
<210> 228
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_135_R
<400> 228
gggagtggga gaatgagctc tcc 23
<210> 229
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_013_F
<400> 229
gccttctctg ctctcttttg tg 22
<210> 230
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_013_R
<400> 230
gctattatcc actcttgcag atgaag 26
<210> 231
<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_024_F
<400> 231
ttcactgctt gtgtggtctt atataatcaa aac 33
<210> 232
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_024_R
<400> 232
agtgtagtct actctgttca ttttacacc 29
<210> 233
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_074_F
<400> 233
tcaagaggta atctgaarac aggtctttc 29
<210> 234
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_074_R
<400> 234
actcagyagg cctaggttgc tc 22
<210> 235
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_090_F
<400> 235
cccatttata agccaatgtt tcattgtc 28
<210> 236
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_090_R
<400> 236
acatcattta aatggagaga gtagctg 27
<210> 237
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_100_F
<400> 237
attgcttttt atgacactac ycctcatgc 29
<210> 238
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_100_R
<400> 238
tgggtccaga caaatcacaa gggttc 26
<210> 239
<211> 40
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_128_F
<400> 239
acctgaaatt gattcaaatg tgtcatgtga tctttcaaac 40
<210> 240
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_128_R
<400> 240
tgtcatataa cagaatgtga ctttgac 27
<210> 241
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_039_F
<400> 241
ggacttccta agatacactt cgattg 26
<210> 242
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_039_R
<400> 242
actgggttgg aacatccaaa acaatc 26
<210> 243
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_053_F
<400> 243
tcagatatat ggctcggtag cctcccyga 29
<210> 244
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_053_R
<400> 244
tcaaacctaa tgcctgtcta agtagac 27
<210> 245
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_069_F
<400> 245
accatctcay cccadttaga atggcgatc 29
<210> 246
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_069_R
<400> 246
ttcctatttc tccacatcct ctccag 26
<210> 247
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_087_F
<400> 247
gtgacatttc cttgtcaaaa gaacattata g 31
<210> 248
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_087_R
<400> 248
cattaggtca tggtaatttt ccctgag 27
<210> 249
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_056_F
<400> 249
acctagggat ggaactttgg cttatg 26
<210> 250
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_056_R
<400> 250
cactatagaa aacaggcttg tggttc 26
<210> 251
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_091_F
<400> 251
ggaattacaa tttataaatg taggtccaca tg 32
<210> 252
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_091_R
<400> 252
ccacactcat ttgtgtattt ctacactg 28
<210> 253
<211> 35
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_046_F
<400> 253
taytgtgaaa ttgaagttta gagtcagttt cvaag 35
<210> 254
<211> 40
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_046_R
<400> 254
tctgcttgat aactgtacaa ctttatagta aaatgtgaac 40
<210> 255
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_067_F
<400> 255
tcatctcctt gggaaatggc c 21
<210> 256
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_067_R
<400> 256
gcaccaggct catcctattc ttattac 27
<210> 257
<211> 35
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_087_F
<400> 257
gcagcaccag ttctgtctcc tactagtacc ttcag 35
<210> 258
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_087_R
<400> 258
tttgcaccag cctaatagtt ggtcttacag 30
<210> 259
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_097_F
<400> 259
agaacaccat gctttctgac agc 23
<210> 260
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_097_R
<400> 260
ccagctatga aaagccaatt gctg 24
<210> 261
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_000_F
<400> 261
actatgggtt tatcaagaat tccaagttg 29
<210> 262
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_000_R
<400> 262
gtcaaaggaa gtttcactgt aggg 24
<210> 263
<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_012_F
<400> 263
cttagagtca tagtttacaa acataaaacc atg 33
<210> 264
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_012_R
<400> 264
ggcttagata tctcagacct accaatatc 29
<210> 265
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_024_F
<400> 265
ccttagcttg tatcaccctt tatcatctg 29
<210> 266
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_024_R
<400> 266
agaaagaaga aaggaagtca cacag 25
<210> 267
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_064_F
<400> 267
agtgacskac atttggcaag aagccatg 28
<210> 268
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_064_R
<400> 268
agagaattta ttgtcaygct tgtgccaaag c 31
<210> 269
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_076_F
<400> 269
agtgagtctg ttcagggtgc tacattgctg 30
<210> 270
<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_076_R
<400> 270
gcatacagaa gccactcrga atacaatttc aag 33
<210> 271
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_001_F
<400> 271
gtaccccaca tagatagccg gaagg 25
<210> 272
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_001_R
<400> 272
tccttccagc ggtctctgtg g 21
<210> 273
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_057_F
<400> 273
tcccaaagga acccctatga ct 22
<210> 274
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_057_R
<400> 274
ctcaggagct agcagtggga g 21
<210> 275
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_083_F
<400> 275
ctccactttc cactgatgca g 21
<210> 276
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_083_R
<400> 276
gggagggagg ggtgctcggg at 22
<210> 277
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_001_F
<400> 277
cttcatgaat ggtttggcac chgttccttg 30
<210> 278
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_001_R
<400> 278
acacactttt aaacaacaga tcttgtgata ac 32
<210> 279
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_030_F
<400> 279
agcttgacta aagtttagtc aacacagcaa ag 32
<210> 280
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_030_R
<400> 280
ttgtgattgb ccaagtgttc acaact 26
<210> 281
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_051_F
<400> 281
acattcctcc tgtggrctct gctgcatc 28
<210> 282
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_051_R
<400> 282
aattgtgata gacaaatgcc tggc 24
<210> 283
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_065_F
<400> 283
gccactcaat ttctagccat tgccttagg 29
<210> 284
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_065_R
<400> 284
cctgagacat ttgggtgaag gtttgtgtct ac 32
<210> 285
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_075_F
<400> 285
acagcaaaga ggagagaaag agctgaac 28
<210> 286
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_075_R
<400> 286
aactaccctg ttctagtccc gcatcc 26
<210> 287
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_002_F
<400> 287
ggctctgtca bcaggctgga gtgcaatgg 29
<210> 288
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_002_R
<400> 288
cttgaaccct ggagacagag gtcgcag 27
<210> 289
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_015_F
<400> 289
gattttgtta tatgcagggt gtcctgaaac ca 32
<210> 290
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_015_R
<400> 290
ctctcacttt tcttctttat agtaagtcat tc 32
<210> 291
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_029_F
<400> 291
ctachgcagg gaaaagggac ttagccgtag g 31
<210> 292
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_029_R
<400> 292
agacatctgc aagaamtttc cagcaggc 28
<210> 293
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_044_F
<400> 293
gtagtggcta tttygtcygt cagctcctgt 30
<210> 294
<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_044_R
<400> 294
acattgaaac ccaatccaaa gaagctaaga atc 33
<210> 295
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_005_F
<400> 295
aagacacaaa gtktggcttc agataaagag ca 32
<210> 296
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_005_R
<400> 296
tgccaagcta tcttgtaaga aataactaca c 31
<210> 297
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_020_F
<400> 297
ggattttatt gtctcatatt cttgaagtg 29
<210> 298
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_020_R
<400> 298
cagtagacaa tgccgagaaa gaatag 26
<210> 299
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_039_F
<400> 299
tctgattcca atctaatacc atagggct 28
<210> 300
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_039_R
<400> 300
ggactaagct tctcattgtt gcagag 26
<210> 301
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_058_F
<400> 301
tattatgcct tttgtacccg atgtttg 27
<210> 302
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_058_R
<400> 302
ccagttggca gctgggagag caaag 25
<210> 303
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_010_F
<400> 303
tggggtggag gtggggcaca gccttgttac 30
<210> 304
<211> 32
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_010_R
<400> 304
aggcctacta tgaaactgga atcttcacat ac 32
<210> 305
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_038_F
<400> 305
gctgaatcta ctgtttggag cttacaataa g 31
<210> 306
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_038_R
<400> 306
accatgttat tccagctaca attctgtg 28
<210> 307
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_042_F
<400> 307
cagaaatgca tgcacaaggc actc 24
<210> 308
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_042_R
<400> 308
ttgctattgt aactaatgtt gctgaggac 29
<210> 309
<211> 34
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_033_F
<400> 309
ttcctcttcc gtagatgggg ataagaagat ctac 34
<210> 310
<211> 31
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_033_R
<400> 310
ttaaatctgt gtcttcatat aatcctgttg a 31
<210> 311
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_046_F
<400> 311
tttgagacag agtcttgctc tgtcaca 27
<210> 312
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_046_R
<400> 312
tgcactgaga ttgcaccact acac 24
<210> 313
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_004_F
<400> 313
gccataaaaa agaaagaaat gctgcca 27
<210> 314
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_004_R
<400> 314
cttagtccag tgttctctag gttcacg 27
<210> 315
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_029_F
<400> 315
ggaagttgtc attggaactt ctgctg 26
<210> 316
<211> 29
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_029_R
<400> 316
gggttgagag taaggtatga aaattctgg 29
<210> 317
<211> 34
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_083_F
<400> 317
gcaatttcca atgtcaaatt aaaattcttc taac 34
<210> 318
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_083_R
<400> 318
ctgtaaataa ggagtttcat tatttagtgg 30
<210> 319
<211> 30
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_095_F
<400> 319
agtatgtttt caaatcagga attgtgatgt 30
<210> 320
<211> 26
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_095_R
<400> 320
gcacaaaaga cctggtcaag acaaac 26
<210> 321
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_138_F
<400> 321
gagttttgca gaaggtacag caact 25
<210> 322
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_138_R
<400> 322
tcagtcttgc atttgagaga caatc 25
<210> 323
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_141_F
<400> 323
gaccaaattc agtatgctgg gagt 24
<210> 324
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_141_R
<400> 324
gtagcctcca ttttaccctg ttcc 24
<210> 325
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_007_I
<400> 325
caaaactaaa tgaaagataa tc 22
<210> 326
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_007_D
<400> 326
gcaaaactaa aaaagataat ct 22
<210> 327
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_031_I
<400> 327
gttaggacgt gtgrtcttg 19
<210> 328
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_031_D
<400> 328
gttaggactg tgrtcttgtg 20
<210> 329
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_041_I
<400> 329
ccttcatttc ctcaactgtg 20
<210> 330
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_041_D
<400> 330
ccttcatttc aactgtgca 19
<210> 331
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_059_I
<400> 331
ctaagcaaat acttagttcc c 21
<210> 332
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_059_D
<400> 332
actaagcaaa tagttccctt c 21
<210> 333
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_083_I
<400> 333
tcacttgtca cactatgtg 19
<210> 334
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_083_D
<400> 334
tttcacttgt cactatgtg 19
<210> 335
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_101_I
<400> 335
catttctcta agtaatcag 19
<210> 336
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_101_D
<400> 336
gacatttctc taatcagaa 19
<210> 337
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_119_I
<400> 337
tcaatcatgg ggtaaatgga 20
<210> 338
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_119_D
<400> 338
atcaatcatg ggtaaatgga 20
<210> 339
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_154_I
<400> 339
gtgggattgt aagtaagagc 20
<210> 340
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_154_D
<400> 340
agtgggattg taagagctg 19
<210> 341
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_170_I
<400> 341
gagactcaga gatgtta 17
<210> 342
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_170_D
<400> 342
ctgagactca gatgttaa 18
<210> 343
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_192_I
<400> 343
gtggttcaaa taatctattc c 21
<210> 344
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_192_D
<400> 344
gtggttcaaa tctattcctg 20
<210> 345
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_208_I
<400> 345
atttcagttt tcttcgagat c 21
<210> 346
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_208_D
<400> 346
ttttcctctt atcaaatctg g 21
<210> 347
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_223_I
<400> 347
gaaagacact gtgaaggag 19
<210> 348
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_223_D
<400> 348
ggaaagacac tgaaggagg 19
<210> 349
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_233_I
<400> 349
attgtacttc tttatttcca g 21
<210> 350
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_233_D
<400> 350
gaaattgtac ttatttccag a 21
<210> 351
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_240_I
<400> 351
catatttaaa ttggttggtt aag 23
<210> 352
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 01_240_D
<400> 352
gcatatttaa attggttaag agc 23
<210> 353
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_011_I
<400> 353
accaggaact ctggccct 18
<210> 354
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_011_D
<400> 354
caccaggatg gccctgtt 18
<210> 355
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_036_I
<400> 355
ttcagaactg tctctggca 19
<210> 356
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_036_D
<400> 356
ctttcagaac tctggcaat 19
<210> 357
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_042_I
<400> 357
acacatgcat aataaccct 19
<210> 358
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_042_D
<400> 358
caacacatgc ataaccctt 19
<210> 359
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_061_I
<400> 359
caaattcctc cccatca 17
<210> 360
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_061_D
<400> 360
caaattcctc ccatcat 17
<210> 361
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_080_I
<400> 361
ctgcagacag agcatgtc 18
<210> 362
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_080_D
<400> 362
ctgcagacag catgtcct 18
<210> 363
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_101_I
<400> 363
gctaattagg gaaccttgc 19
<210> 364
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_101_D
<400> 364
agctaattag gaaccttgc 19
<210> 365
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_113_I
<400> 365
tatgaagtag gtgaagga 18
<210> 366
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_113_D
<400> 366
ctatgaagta gtgaaggag 19
<210> 367
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_150_I
<400> 367
aagcaccgcc agagctct 18
<210> 368
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_150_D
<400> 368
gattggaagt ctgaggact 19
<210> 369
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_215_I
<400> 369
gtatcataaa gagaaagggc 20
<210> 370
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_215_D
<400> 370
tgtatcataa aaagggcatg 20
<210> 371
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_231_I
<400> 371
caaagaaagc ctgttccta 19
<210> 372
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 02_231_D
<400> 372
acaaagaaag ctgttcctag 20
<210> 373
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_016_I
<400> 373
tgagtcttgc gctgacc 17
<210> 374
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_016_D
<400> 374
gtgagtcttg ctgaccc 17
<210> 375
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_030_I
<400> 375
ctgcacataa gccataat 18
<210> 376
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_030_D
<400> 376
tacctgcaca taatttca 18
<210> 377
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_063_I
<400> 377
gaaccagcgt gatgtaatag 20
<210> 378
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_063_D
<400> 378
gaatgaagaa agggaatgag 20
<210> 379
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_082_I
<400> 379
ataggtactg gattcacagc 20
<210> 380
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_082_D
<400> 380
cataggtact gattcacagc 20
<210> 381
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_100_I
<400> 381
agatccccct gttttcag 18
<210> 382
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_100_D
<400> 382
agatccccgt tttcagtc 18
<210> 383
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_107_I
<400> 383
taaacttcac caagtactct t 21
<210> 384
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_107_D
<400> 384
cataaacttc aagtactctt tc 22
<210> 385
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_124_I
<400> 385
ctgtggaaac acagagtaa 19
<210> 386
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_124_D
<400> 386
tctgtggaaa cagagtaat 19
<210> 387
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_162_I
<400> 387
tggtgtgatc tcggctca 18
<210> 388
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_162_D
<400> 388
tggtgtgatc ggctcact 18
<210> 389
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_182_I
<400> 389
agtttcagac aggaatggt 19
<210> 390
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_182_D
<400> 390
tagtttcaga aggaatggt 19
<210> 391
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_194_I
<400> 391
atgcctcctt cttctgtaac 20
<210> 392
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 03_194_D
<400> 392
gatgcctcct tctgtaaca 19
<210> 393
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_008_I
<400> 393
ccccagctag gtaggact 18
<210> 394
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_008_D
<400> 394
cccagctagg actagcac 18
<210> 395
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_027_I
<400> 395
tcactaaaac ttattcttg 19
<210> 396
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_027_D
<400> 396
tcactaaaat tattcttgc 19
<210> 397
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_045_I
<400> 397
ggccatgggg cattctt 17
<210> 398
<211> 17
<212> DNA
<213> 04_045_D
<400> 398
ggccatgggc attcttg 17
<210> 399
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_056_I
<400> 399
attgcacact ctgggtaag 19
<210> 400
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_056_D
<400> 400
attgcacact gggtaagag 19
<210> 401
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_065_I
<400> 401
tgactactca attgcat 17
<210> 402
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_065_D
<400> 402
gtgactacta attgcat 17
<210> 403
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_085_I
<400> 403
ccagtcactc tgtaccag 18
<210> 404
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_085_D
<400> 404
cccagtcact gtaccagg 18
<210> 405
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_112_I
<400> 405
tatacatctg cattgattgg a 21
<210> 406
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_112_D
<400> 406
gcacaaatat acattggata ttc 23
<210> 407
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_137_I
<400> 407
ccctaccttg tagctgac 18
<210> 408
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_137_D
<400> 408
gtacctatcc gacaacctg 19
<210> 409
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_154_I
<400> 409
gtgacttcct ataaaaact 19
<210> 410
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_154_D
<400> 410
agtgacttcc taaaaactc 19
<210> 411
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_177_I
<400> 411
ttcaacttga cttgtgtaac 20
<210> 412
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 04_177_D
<400> 412
gaatttcaac ttgtgtaact t 21
<210> 413
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_003_I
<400> 413
tcttgcctcc tttatttcc 19
<210> 414
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_003_D
<400> 414
gtcttgcctc tttatttcct 20
<210> 415
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_013_I
<400> 415
catatcttca caagacaaag g 21
<210> 416
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_013_D
<400> 416
gaaaatcata tcaaagggag a 21
<210> 417
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_065_I
<400> 417
catgtaatga aaggaataaa tcc 23
<210> 418
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_065_D
<400> 418
aaaacatgta atgaataaat ccat 24
<210> 419
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_074_I
<400> 419
ccaccttccc ctcccct 17
<210> 420
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_074_D
<400> 420
tttccacctt cccctttttt 20
<210> 421
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_087_I
<400> 421
atagacactg cagactacta g 21
<210> 422
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_087_D
<400> 422
gaaaaaaata gagaggggag a 21
<210> 423
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_096_I
<400> 423
cagcagcatc atgagattt 19
<210> 424
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_096_D
<400> 424
gcagcagcat gagatttc 18
<210> 425
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_115_I
<400> 425
tgagacccta aacagagga 19
<210> 426
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_115_D
<400> 426
cttgtgagac ccagttaag 19
<210> 427
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_119_I
<400> 427
ataggggaac atctagataa c 21
<210> 428
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_119_D
<400> 428
gctcataggg gatctagata aca 23
<210> 429
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_132_I
<400> 429
agcagaacag gagactagg 19
<210> 430
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_132_D
<400> 430
agcagaacag actaggttg 19
<210> 431
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_141_I
<400> 431
ccactctgat tggtttccg 19
<210> 432
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_141_D
<400> 432
cttccactct ggtttccg 18
<210> 433
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_151_I
<400> 433
gtgctcttac tcagttaatg a 21
<210> 434
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_151_D
<400> 434
aggtgctctt agttaatgat g 21
<210> 435
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_180_I
<400> 435
cactaggtca atgataactt ag 22
<210> 436
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 05_180_D
<400> 436
cactaggtca ataacttagt ac 22
<210> 437
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_007_I
<400> 437
cattgtaact cagttttccc 20
<210> 438
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_007_D
<400> 438
cattgtaact gttttccctc 20
<210> 439
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_016_I
<400> 439
tcaggtagca gagaaggg 18
<210> 440
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_016_D
<400> 440
ttcaggtaga gagaaggga 19
<210> 441
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_031_I
<400> 441
tcraaagcac agccagaga 19
<210> 442
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_031_D
<400> 442
tttcraaagc gccagagac 19
<210> 443
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_057_I
<400> 443
tataaatcat tattttaaca gg 22
<210> 444
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_057_D
<400> 444
gattataaat catttaacag g 21
<210> 445
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_071_I
<400> 445
gttcctcatc tttcatggt 19
<210> 446
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_071_D
<400> 446
ctgttcctca ttcatggtt 19
<210> 447
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_077_I
<400> 447
cagactcagt tcatgaactc 20
<210> 448
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_077_D
<400> 448
tcagttcaga ctccactgac 20
<210> 449
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_087_I
<400> 449
gcagttagaa ggaacactc 19
<210> 450
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_087_D
<400> 450
tgctgtatgc tgctatttg 19
<210> 451
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_096_I
<400> 451
tgaatgcccg cccactc 17
<210> 452
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_096_D
<400> 452
cactgaatgc ccactca 17
<210> 453
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_113_I
<400> 453
gtgtgagatg ggtatctca 19
<210> 454
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_113_D
<400> 454
gtgtgagatg gtatctcat 19
<210> 455
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_125_I
<400> 455
acatgtcagt tgtttcttaa at 22
<210> 456
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_125_D
<400> 456
attacatgtc agtttcttaa ataa 24
<210> 457
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_135_I
<400> 457
caggggaatg aatgattttg 20
<210> 458
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_135_D
<400> 458
gtcaggggaa tgattttga 19
<210> 459
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_143_I
<400> 459
caacattgaa caaagtcctt g 21
<210> 460
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_143_D
<400> 460
tatacaacat tgtcctcatg g 21
<210> 461
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_153_I
<400> 461
atttccccaa tttgataatt ttt 23
<210> 462
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_153_D
<400> 462
ttgaatattt cttttttgtt cag 23
<210> 463
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_158_I
<400> 463
gctttcattc agtcagtctc 20
<210> 464
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_158_D
<400> 464
aactatgctt tcagtctctg 20
<210> 465
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_167_I
<400> 465
gctgataaca ttcattcatt c 21
<210> 466
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 06_167_D
<400> 466
ggctgataac atattcattc a 21
<210> 467
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_010_I
<400> 467
caatcaatgg gtggaactg 19
<210> 468
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_010_D
<400> 468
caatcaatgg tggaactgg 19
<210> 469
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_023_I
<400> 469
gattttgcct gataaccttc 20
<210> 470
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_023_D
<400> 470
tgctgctgat ttcttctctt 20
<210> 471
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_040_I
<400> 471
tgagaaaagc ccgtgaatg 19
<210> 472
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_040_D
<400> 472
tgagaaaagc cgtgaatgt 19
<210> 473
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_062_I
<400> 473
ccattcgatg acgattcca 19
<210> 474
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_062_D
<400> 474
cattcaattc catccgataa ta 22
<210> 475
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_082_I
<400> 475
catgatggta ttatgatcta gt 22
<210> 476
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_082_D
<400> 476
catgatggta tgatctagta tg 22
<210> 477
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_097_I
<400> 477
cagttaatgt atttggtttc ac 22
<210> 478
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_097_D
<400> 478
cagttaatgt ttcacctgc 19
<210> 479
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_112_I
<400> 479
ctgaggcagg agaatcac 18
<210> 480
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_112_D
<400> 480
gctgaggcag agaatcac 18
<210> 481
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_126_I
<400> 481
attaactcag atagccctaa g 21
<210> 482
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_126_D
<400> 482
attaactcag ccctaagaag 20
<210> 483
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_140_I
<400> 483
tatttggcag agtcttttgt 20
<210> 484
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_140_D
<400> 484
atatttggca gtcttttgtt t 21
<210> 485
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_153_I
<400> 485
cttattttct gtacagtgtt ttcac 25
<210> 486
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 07_153_D
<400> 486
cttattttca ctacggtcac 20
<210> 487
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_002_I
<400> 487
tgtctttgag gtttcctcc 19
<210> 488
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_002_D
<400> 488
tgtctttgag tttcctccc 19
<210> 489
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_013_I
<400> 489
cattagtttt ccccatttta ct 22
<210> 490
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_013_D
<400> 490
acattagttt tcccatttta ctt 23
<210> 491
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_033_I
<400> 491
agcttcctca ggtaaaatat tt 22
<210> 492
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_033_D
<400> 492
ggaaagcttc ctcagtaaaa tatt 24
<210> 493
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_058_I
<400> 493
tcgtacaaag tgtctacact aca 23
<210> 494
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_058_D
<400> 494
tctcgtacaa agtctacact aca 23
<210> 495
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_064_I
<400> 495
gctaaaccca aaatatgagt g 21
<210> 496
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_064_D
<400> 496
gctaaaccca atatgagtgt 20
<210> 497
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_082_I
<400> 497
gacactctgt gtatctagct 20
<210> 498
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_082_D
<400> 498
cgacactctg tatctagct 19
<210> 499
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_103_I
<400> 499
acagtggact gtgggggt 18
<210> 500
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_103_D
<400> 500
acagtggatg tgggggtg 18
<210> 501
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_125_I
<400> 501
ctctgtgcag gcacaggt 18
<210> 502
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_125_D
<400> 502
cctctgtgca gcacaggt 18
<210> 503
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_139_I
<400> 503
caaaggctga gcagatgc 18
<210> 504
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 08_139_D
<400> 504
cctcgcaaat gccggct 17
<210> 505
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_000_I
<400> 505
acttttcttt tctctgaatt tatatag 27
<210> 506
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_000_D
<400> 506
cacttttctt ttcttgaatt tatatag 27
<210> 507
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_021_I
<400> 507
cagaaaatga tcatgatgca ca 22
<210> 508
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_021_D
<400> 508
tagcagaaaa tgatgcacat tt 22
<210> 509
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_064_I
<400> 509
agtctattgg aaatgtgcta c 21
<210> 510
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_064_D
<400> 510
ctaagtctat tctgtgctac tg 22
<210> 511
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_072_I
<400> 511
atgtgctcct ctcaacatc 19
<210> 512
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_072_D
<400> 512
catctatgtg ctcaacatcc 20
<210> 513
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_084_I
<400> 513
caaaaatggc agtagtgggt ca 22
<210> 514
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_084_D
<400> 514
aaaatggcat agtgggtcag g 21
<210> 515
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_109_I
<400> 515
gtctcagctc ctccatttgt 20
<210> 516
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_109_D
<400> 516
gtctcagctc tccatttgt 19
<210> 517
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_117_I
<400> 517
attcagttat agcaacagaa a 21
<210> 518
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_117_D
<400> 518
tattcagtta aacagaaaac ag 22
<210> 519
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_132_I
<400> 519
aagcctccac ccaccttg 18
<210> 520
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 09_132_D
<400> 520
aaagcctcca ccttgcag 18
<210> 521
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_001_I
<400> 521
actatactat ataatgttac ac 22
<210> 522
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_001_D
<400> 522
actatactat atgttacact g 21
<210> 523
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_026_I
<400> 523
gggctcaagt gatcctccc 19
<210> 524
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_026_D
<400> 524
gggctcaagt atcctcccg 19
<210> 525
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_035_I
<400> 525
tgcttgaacc tgggaggtt 19
<210> 526
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_035_D
<400> 526
tgcttgaact gggaggttg 19
<210> 527
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_047_I
<400> 527
atgatacaga gaggcccact 20
<210> 528
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_047_D
<400> 528
aatgatacag aggcccactg 20
<210> 529
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_071_I
<400> 529
tgcccaggct acaccct 17
<210> 530
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_071_D
<400> 530
gatgcccagt acaccctg 18
<210> 531
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_085_I
<400> 531
tggctcttat gccttgcc 18
<210> 532
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_085_D
<400> 532
tggctcttgc cttgccta 18
<210> 533
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_117_I
<400> 533
gttgccgata ttccagga 18
<210> 534
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_117_D
<400> 534
aaatgttgcc aggaggtg 18
<210> 535
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_128_I
<400> 535
ttcaatgtta tactcgtcca t 21
<210> 536
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 10_128_D
<400> 536
ttcaatgtta ctcgtccatg 20
<210> 537
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_006_I
<400> 537
gggaataact gagcattctg 20
<210> 538
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_006_D
<400> 538
tgggaataac agcattctg 19
<210> 539
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_020_I
<400> 539
cattagcata gctggatttc 20
<210> 540
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_020_D
<400> 540
gcattagcat ggatttcct 19
<210> 541
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_034_I
<400> 541
ggggagcaaa tgaattacca t 21
<210> 542
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_034_D
<400> 542
ttatggggat accatataac 20
<210> 543
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_059_I
<400> 543
cattgtggaa gactatgtg 19
<210> 544
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_059_D
<400> 544
cattgtggaa actatgtgg 19
<210> 545
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_084_I
<400> 545
atgagtctca gtttcttcat 20
<210> 546
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_084_D
<400> 546
aaatgagtct gtttcttcat t 21
<210> 547
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_094_I
<400> 547
atccagagtc catagagtga 20
<210> 548
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_094_D
<400> 548
catccagagt catagagtga 20
<210> 549
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_111_I
<400> 549
ctaacaaaaa gaagaccatc t 21
<210> 550
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_111_D
<400> 550
tctaacaaaa agaccatctg t 21
<210> 551
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_135_I
<400> 551
tccgcagtgg caggagag 18
<210> 552
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 11_135_D
<400> 552
ttccgcagtg caggagagc 19
<210> 553
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_013_I
<400> 553
acactcagtt ctctatttca g 21
<210> 554
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_013_D
<400> 554
acactcagtt ctatttcaga g 21
<210> 555
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_024_I
<400> 555
tgcmtcctat atattttcag g 21
<210> 556
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_024_D
<400> 556
ttgcmtccta tattttcagg tg 22
<210> 557
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_074_I
<400> 557
aatgtgcaga gtttgagca 19
<210> 558
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_074_D
<400> 558
gaaatgtgca gtttgagcaa 20
<210> 559
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_090_I
<400> 559
gtttccaaaa ctcttagtat ca 22
<210> 560
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_090_D
<400> 560
agtttccaaa ttagtatcaa ac 22
<210> 561
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_100_I
<400> 561
gccttcttct cataagaacc c 21
<210> 562
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_100_D
<400> 562
catgccttct taagaaccct 20
<210> 563
<211> 25
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_128_I
<400> 563
tcaaactctt ttggaaacgt caaag 25
<210> 564
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 12_128_D
<400> 564
tcaaactctt ttgaaacgtc aaagtca 27
<210> 565
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_039_I
<400> 565
aggcaaatgc aattgatttc 20
<210> 566
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_039_D
<400> 566
ccctaggcaa attgatttca 20
<210> 567
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_053_I
<400> 567
aagcattagc tttgtctact 20
<210> 568
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_053_D
<400> 568
aagcattagt ttgtctactt 20
<210> 569
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_069_I
<400> 569
agtcagcaaa caacagatgc tgg 23
<210> 570
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_069_D
<400> 570
agtcagcaaa cagatgctgg aga 23
<210> 571
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_087_I
<400> 571
cattatcatt gtctgcataa tctg 24
<210> 572
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 13_087_D
<400> 572
gtcattatca ttgcataatc tgc 23
<210> 573
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_056_I
<400> 573
gaatatatac atgttccatt ttac 24
<210> 574
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_056_D
<400> 574
ggaatatatt tttactagga acc 23
<210> 575
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_091_I
<400> 575
taataagtag tgagtgaaat acc 23
<210> 576
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 14_091_D
<400> 576
cttaataagt agtgaaatac cag 23
<210> 577
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_046_I
<400> 577
gttggaggac tgacagttca ca 22
<210> 578
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_046_D
<400> 578
aagttggagg acagttcaca tt 22
<210> 579
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_067_I
<400> 579
ctcagtaaga gtttgtcaaa tg 22
<210> 580
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_067_D
<400> 580
gaactcagta agtcaaatgg g 21
<210> 581
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_087_I
<400> 581
agttattaaa acattatttt ctgtaaga 28
<210> 582
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_087_D
<400> 582
cagttattaa aacattttct gtaagacc 28
<210> 583
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_097_I
<400> 583
cctagctttt acttaagtgc ag 22
<210> 584
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 15_097_D
<400> 584
agcctagctt ttaagtgcag 20
<210> 585
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_000_I
<400> 585
tgcatcctat gaaaataccc 20
<210> 586
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_000_D
<400> 586
gtgcatccta taaaataccc t 21
<210> 587
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_012 _I
<400> 587
aatgattagc gcaatgtgat 20
<210> 588
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_012 _D
<400> 588
ttaatgatta gcaatgtgat at 22
<210> 589
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_024_I
<400> 589
catctggccc ttgttctc 18
<210> 590
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_024_D
<400> 590
atcatctggc ttgttctct 19
<210> 591
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_064_I
<400> 591
gttgtatagg gacaggagc 19
<210> 592
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_064_D
<400> 592
tgttgtatag gacaggagct 20
<210> 593
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_076_I
<400> 593
gacttcatgt ccctcttgaa a 21
<210> 594
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 16_076_D
<400> 594
tgacttcatg tcctcttgaa a 21
<210> 595
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_001_I
<400> 595
ggactctgag ccagtacccc 20
<210> 596
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_001_D
<400> 596
ggactctgag cagtacccc 19
<210> 597
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_057_I
<400> 597
tgactgttac tcaggagagt 20
<210> 598
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_057_D
<400> 598
ctatgactgt taggagagta at 22
<210> 599
<211> 17
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_083_I
<400> 599
acacctgtgc agcgcct 17
<210> 600
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 17_083_D
<400> 600
agcacacctt ccatgaga 18
<210> 601
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_001_I
<400> 601
ggtgctgttc tcgagatagt 20
<210> 602
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_001_D
<400> 602
tggtgctgtt cgagatagt 19
<210> 603
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_030_I
<400> 603
aggggaaaca tgagcagttg 20
<210> 604
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_030_D
<400> 604
aaggggaaac gagcagttgt g 21
<210> 605
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_051_I
<400> 605
tcactcaatg gtgccaggca 20
<210> 606
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_051_D
<400> 606
catcactcaa tgtgccaggc a 21
<210> 607
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_065_I
<400> 607
agtgatggcc cccacacttg 20
<210> 608
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_065_D
<400> 608
acagtgatgg cccacacttg 20
<210> 609
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_075_I
<400> 609
ctgagacmct gtggctcctc 20
<210> 610
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 18_075_D
<400> 610
gaactgagac mctggctcct c 21
<210> 611
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_002_I
<400> 611
tgatctcggc taactgcgac 20
<210> 612
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_002_D
<400> 612
tgatctcggt aactgcgacc 20
<210> 613
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_015_I
<400> 613
cccctgcaaa taataagga 19
<210> 614
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_015_D
<400> 614
atcccctgca aataaggaat g 21
<210> 615
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_029_I
<400> 615
gaagccagca gcctgctg 18
<210> 616
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_029_D
<400> 616
ggaagccaga gcctgctg 18
<210> 617
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_044_I
<400> 617
atcattttat tgtgattctt agc 23
<210> 618
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 19_044_D
<400> 618
gtatcatttt attgattctt agct 24
<210> 619
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_005_I
<400> 619
tatctactca tgtgtgtagt ta 22
<210> 620
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_005_D
<400> 620
ttatctactc gtgtgtagtt at 22
<210> 621
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_020_I
<400> 621
cacaaaatag aatagggttt tc 22
<210> 622
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_020_D
<400> 622
ggccacaaaa tagggttttc c 21
<210> 623
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_039_I
<400> 623
gcctttcttt atttataact tctc 24
<210> 624
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_039_D
<400> 624
gagcctttct ttataacttc tct 23
<210> 625
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_058_I
<400> 625
tttccatgtg gtggacagg 19
<210> 626
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 20_058_D
<400> 626
atttccatgt ggacaggtg 19
<210> 627
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_010_I
<400> 627
actactccca ggtgtatgt 19
<210> 628
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_010_D
<400> 628
tactactcca ggtgtatgtg 20
<210> 629
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_038_I
<400> 629
aatatgcaga gactctgaaa 20
<210> 630
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_038_D
<400> 630
gaaatatgca gactctgaaa t 21
<210> 631
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_042_I
<400> 631
aagacacata caagaacgtc 20
<210> 632
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 21_042_D
<400> 632
caaagacaca agaacgtcc 19
<210> 633
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_033_I
<400> 633
tactcacatg gttgtcaaca 20
<210> 634
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_033_D
<400> 634
ctactcacat gttgtcaaca 20
<210> 635
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_046_I
<400> 635
acacaggctg ggagtgtagt 20
<210> 636
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 22_046_D
<400> 636
cacacaggct ggagtgtagt g 21
<210> 637
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_004_I
<400> 637
catcttcaac aacatgcg 18
<210> 638
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_004_D
<400> 638
ccatcttcaa aacatgcg 18
<210> 639
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_029_I
<400> 639
ttcctacttc ctagggaac 19
<210> 640
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_029_D
<400> 640
ttcctacttc tagggaacc 19
<210> 641
<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_083_I
<400> 641
ctttcatctt aacttaagtt actg 24
<210> 642
<211> 22
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_083_D
<400> 642
acactttcat cttaagttac tg 22
<210> 643
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_095_I
<400> 643
gtgatgttgc catccttg 18
<210> 644
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_095_D
<400> 644
gtgatgttgc atccttgat 19
<210> 645
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_138_I
<400> 645
cagcaactct atttaaataa atg 23
<210> 646
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_138_D
<400> 646
cagcaactct aaataaatgg a 21
<210> 647
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_141_I
<400> 647
aaattatttc acatgagtgc t 21
<210> 648
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> X_141_D
<400> 648
gaaattattt cacgagtgct 20
<---
1. Набор для генотипирования 162 инсерционно-делеционных полиморфизмов: rs3059749, rs34338895, rs67091803, rs5774423, rs113565562, rs111706466, rs11394524, rs72082809, rs35379245, rs71107464, rs66944170, rs35126101, rs35994297, rs34450453, rs10693974, rs66610049, rs68130608, rs11424237, rs72339906, rs5832955, rs5833488, rs77093320, rs111665673, rs57993635, rs35926392, rs139738417, rs66976303, rs57495895, rs35291341, rs35464243, rs10540628, rs35588182, rs150470881, rs75445531, rs3834231, rs59170274, rs34184705, rs56281469, rs10707593, rs35932180, rs72273695, rs70938781, rs34581182, rs3067059, rs61235135, rs113132739, rs142490175, rs572636473, rs138124389, rs34990478, rs6149192, rs145918302, rs66881681, rs10701589, rs3832355, rs10560231, rs35948562, rs56071028, rs10529292, rs376539574, rs68133212, rs139823267, rs144273778, rs56343259, rs573860910, rs141141409, rs71675135, rs140327598, rs68078431, rs11278298, rs566489451, rs35345873, rs71552214, rs34786735, rs377131771, rs1610906, rs112677752, rs35830730, rs3216282, rs35575707, rs71520104, rs35146459, rs36048750, rs34168882, rs35604660, rs34067160, rs138172268, rs35679778, rs11323264, rs6150855, rs147918543, rs66509579, rs371766957, rs71493646, rs34499887, rs59923204, rs55952736, rs71953876, rs368278029, rs71281575, rs202245860, rs34948479, rs10552811, rs10555357, rs140576359, rs10544160, rs10583916, rs113764748, rs57958958, rs138278630, rs74933486, rs35847449, rs143339028, rs11394480, rs10533848, rs35955982, rs10571534, rs10689649, rs150767158, rs10706208, rs142669819, rs5803618, rs371764729, rs67650090, rs55812371, rs141061555, rs144457716, rs112548522, rs112792286, rs112880243, rs35379530, rs34436424, rs3841767, rs35709162, rs34816330, rs11330085, rs5821134, rs141730340, rs35023498, rs35452393, rs33990768, rs66933419, rs66502030, rs60503836, rs112906660, rs112877961, rs34242584, rs79282333, rs35894782, rs73622051, rs66555516, rs138066060, rs10583984, rs112408318, rs60228580, rs67057410, rs35997669, rs57522085, rs202172626, rs34991528, rs35020323 и rs10689407, состоящий из композиции праймеров SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 324 для амплификации указанных полиморфизмов и аллельспецифичных олигонуклеотидных зондов SEQ ID NO: 325-SEQ ID NO: 648 для генотипирования соответствующих полиморфизмов методом гибридизации.
2. Набор по п. 1, отличающийся тем, что может быть составлен в сокращенном виде путем исключения части праймеров и соответствующих олигонуклеотидных зондов.
3. Набор по п. 1, отличающийся тем, что мечение ПЦР-продукта осуществляется с использованием флуорофора.
4. Набор по п. 3, отличающийся тем, что флуоресцентное мечение ПЦР-продукта осуществляется с помощью праймера, имеющего соответствующую флуоресцентную метку по 5'-концу.
5. Набор по п. 3, отличающийся тем, что флуоресцентное мечение ПЦР-продукта осуществляется с помощью флуоресцентно-меченного дезоксинуклеотидтрифосфата, встраивающегося в растущую цепь ДНК в ходе ПЦР.
6. Набор по п. 3, отличающийся тем, что каждый локусспецифичный обратный праймер с четным номером «Seq ID» (Seq ID NO: 2, Seq ID NO: 4 … Seq ID NO: 324) имеет со стороны 5'-конца универсальную олигонуклеотидную вставку с последовательностью 5'-TCATTGGATCTCATTA-3', и универсальный ПЦР-праймер также имеет последовательность 5'-TCATTGGATCTCATTA-3'.
7. Набор по п. 6, отличающийся тем, что аллельспецифичные олигонуклеотидные зонды иммобилизованы на поверхности подложки.
8. Набор по п. 6, отличающийся тем, что аллельспецифичные олигонуклеотидные зонды иммобилизованы в объеме полимерного носителя.
