Способ прогнозирования риска развития covid-19 у больных гемобластозами



G01N33/50 - химический анализ биологических материалов, например крови, мочи; испытания, основанные на способах связывания биоспецифических лигандов; иммунологические испытания (способы измерения или испытания с использованием ферментов или микроорганизмов иные, чем иммунологические, составы или индикаторная бумага для них, способы образования подобных составов, управление режимами микробиологических и ферментативных процессов C12Q)

Владельцы патента RU 2783422:

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови Федерального медико-биологического агентства" (RU)

Изобретение относится к медицине, а именно к онкогематологии, и может быть использовано для прогнозирования риска возникновения инфекции, вызванной SARS-CoV-2 с поражением легких у больных гемобластозами. Осуществляют оценку полиморфизма генов IL4 и IL10 в геномной ДНК, выделенной из лейкоцитов цельной крови. Проводят анализ распределения генотипов изучаемых локусов. В случае выявления сочетаний генотипов локусов IL10-1082TT × IL4-590CC × IL10-819AG, IL10-1082TT × IL4-590TT × IL10-819AA, IL10-1082TT × IL4-590TT × IL10-819AG, IL10-1082ТС × IL4-590СС × IL10-819AG, IL10-1082TC × IL4-590CT × IL10-819AG, IL10-1082TC × IL4-590ТТ × IL10-819AA, IL10-1082ТС × IL4-590TT × IL10-819AG, IL10-1082СС × IL4-590CC × IL10-819AG, IL10-1082CC × IL4-590ТТ × IL10-819AA, IL10-1082CC × IL4-590TT × IL10-819AG прогнозируют высокий риск поражения легких при COVID-19. Способ обеспечивает эффективное прогнозирование риска развития COVID-19 с поражением легких у больных гемобластозами за счет проведения анализа распределения генотипов локусов IL4 и IL10. 3 ил., 4 табл., 4 пр.

 

Изобретение относится к медицине, а именно к онкогематологии, и может быть использовано для выявления группы высокого риска инфицирования SARS-CoV-2 с поражением легких у больных гемобластозами на основании обнаружения отдельных генотипов и их комбинаций локусов интерлейкинов-4 и -10 (IL4 и IL10).

В декабре 2019 г. вспышка атипичной пневмонии с тяжелым острым респираторным синдромом (SARS) выявлена в г. Ухань в Китае. Быстрая передача от человека к человеку нового антропозоонозного коронавируса (SARS-CoV-2), ответственного за развитие коронавирусного заболевания 2019 года (COVID-19) привела к глобальному всплеску числа заболевших. 11 марта 2020 г. Всемирная организация здравоохранения объявила COVID-19 пандемией [1]. К 19 апреля 2021 г. во всем мире было зарегистрировано более 140 миллионов случаев заражения SARS-CoV-2 и погибло более 3 миллионов человек [2]. Пандемия COVID-19 - это беспрецедентный вызов медицинскому сообществу, создавший множество медицинских, материально-технических, финансовых проблем и трудностей для учреждений здравоохранения при поиске возможностей оказания оптимальной помощи больным онкогематологическими заболеваниями [1, 3, 4]. В то время как клинический спектр проявлений инфекции, вызванный SARS-CoV-2, чрезвычайно широк, начиная от легких или бессимптомных случаев до тяжелого острого респираторного синдрома, стало очевидно, что исход заболевания значительно зависит от факторов, связанных с хозяином, таких как возраст, пол и сопутствующие заболевания [2, 5, 6], включая гемобластозы. Восприимчивость больных с заболеваниями системы крови к SARS-Cov-2 обусловлена, в том числе, структурными особенностями генома человека: не все лица, подвергшиеся воздействию вируса, заражаются, не у всех инфицированных развиваются симптомы болезни, тогда как у части пациентов возникает фатальное течение заболевания с развитием синдрома выброса цитокинов, дыхательной и полиорганной недостаточности [3, 4, 7-10].

Пациенты гематологического профиля представляют собой группу высокого риска развития инфекционных заболеваний, в том числе COVID-19, в связи с аберрантным функционированием иммунной системы и иммуносупрессией, вызванной противоопухолевым лечением [1, 11]. Они более восприимчивы к инфицированию SARS-CoV-2, имеют быстро развивающийся COVID-19 с неблагоприятным течением и высокий риск возникновения тяжелых осложнений, чаще нуждаются в интенсивной терапии и отличаются значительным уровнем смертности по сравнению с общей популяцией и с больными солидными новообразованиями [1, 4, 3, 7, 8, 12]. У госпитализированных пациентов с гемобластозами и с COVID-19 риск летальных исходов оценивается на уровне 39% [4, 11, 13]. В частности, к независимым прогностическим факторам смерти от COVID-19, наблюдаемой у 33% больных множественной миеломой, относят мужской пол, пожилой возраст, прогрессирование заболевания, наличие почечной недостаточности и других сопутствующих заболеваний (артериальная гипертензия, хронические заболевания легких, сахарный диабет и вторые злокачественные новообразования) [4-7, 11, 12].

Хотя патогенез COVID-19 остается, в большей степени, неясным, генетический полиморфизм в локусах хозяина, белковые продукты которых участвуют в распознавании инфекционных агентов, в развитии реинфицирования, воспаления, гипериммунной реакции может играть роль в определении характера течения и исхода заболевания. Ряд данных, полученных при полногеномных исследованиях (GWAS), не имеют прямого биологического отношения к патогенезу заболевания и не всегда позволяют обнаружить мутации, вовлеченные в возникновение и прогрессирование патологического процесса. Поэтому, наряду с GWAS по-прежнему актуальны анализ генов-кандидатов и когортные исследования [2, 10]. Индивидуальные различия в восприимчивости к инфекции SARS-CoV-2 связаны с наличием полиморфизма во многих генах, особенно в тех, которые отвечают за кодирование рецепторов клеток хозяина, участвующих в процессах распознавания и пенетрации вируса [5, 10, 14]. Такие исследования оценили роль функциональных SNPs (single nucleotide polymorphisms, однонуклеотидные замены) в генах, ответственных за контроль вирусной инфекции путем индукции воспаления (IFNL3/IFNL4), поляризации макрофагов (MERTK), локального и системного воспалительного ответа (PNPLA3, IL6), активации комплемента по C1q пути и потенциально способных активировать шиловидный белок SARS-CoV-2 (TLL-1) [2, 14-16], облегчать прикрепление к поверхности и проникновение вируса в клетку (АСЕ2, TMPRSS2, DPP4, гены HLA I класса) [5, 14, 17-24]. Кроме того, описан вклад SNPs в генах ABO, АроЕ, IFITM3, SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6, XCR1 и ТМЕМ189-UBE2V1, DC26, Cathepsin С [5, 9, 10, 24], ERAP2, MBL, CCL2, CCL5, Furin, MUC5B, GSTT1-M1, DBP, ICAM3, AHSG и многих других в предрасположенность к инфицированию, к тяжелому течению COVID-19 и к высокому уровню смертности [5, 10, 23].

Идентификация вышеупомянутых генетических вариантов ассоциируется с более длительным течением COVID-19 или фатальным исходом инфекции, а также поддерживает разработку прогностических инструментов, полезных для стратификации субъектов на группы риска при их обнаружении. Более того, индивидуализация ключевых генов может способствовать лучшему пониманию путей, участвующих в патогенезе новой коронавирусной инфекции, что дает основу для разработки рациональных терапевтических подходов [2, 5].

Основная роль в защите организма от инфекций отводится иммунной системе. Поэтому большое внимание уделяется поиску иммуноопосредованных маркеров прогноза, которыми могут стать SNPs в генах, участвующих в реализации противовирусного иммунитета, в частности цитокинов (IFNγ, IL4, IL6, IL10, IL17, IL37, TNFα, IFNα/β), Толл-подобных (TLR3, TLR4, TLR7) и других рецепторов [5, 6, 8-10, 14, 24-33].

В ходе COVID-19 чрезмерная продукция провоспалительных медиаторов приводит к цитокиновому шторму, который обусловливает тяжелое течение болезни и острое повреждение органов. Основной механизм этого осложнения заключается в том, что SARS-CoV-2 быстро активирует Т-хелперы 1 типа (Th1) с секрецией провоспалительных цитокинов, включая IL-6, IL-10 и IL-17 [24, 34]. При COVID-19 высокий уровень IL-6, IL-10 и низкое содержание CD4+ и CD8+ Т-клеток связывают с тяжелым течением заболевания. Описано также, что пациенты с этой формой COVID-19 имеют более высокие концентрации сывороточных IL-2, IL-6, IL-7, IL-10, чем пациенты с легкими и среднетяжелыми формами инфекции, а уровень IL-17 повышен у больных COVID-19, проходивших лечение в отделении интенсивной терапии [34].

Секреция цитокинов находится под жестким генетическим контролем, опосредуемым структурными особенностями кодируемых генов. Однонуклеотидные полиморфизмы, расположенные в регуляторных участках генов, относятся к наименее изученной функциональной группе SNPs. Однако, изменяя уровень экспрессии генов, они играют значимую роль в развитии различных патологических состояний человека, включая инфекции и злокачественные новообразования [34, 35]. Полиморфизм генов цитокинов оказывает влияние на индивидуальные различия в восприимчивости к короновирусной инфекции [14].

Носительство альтернативного аллеля гена может приводить к подавлению его экспрессии и соответственно к снижению концентрации кодируемого им продукта, а также к изменению функциональной активности белка [24], оказывая влияние на резистентность к инфекционным, и в частности, вирусным заболеваниям в популяции, что определяет возможность использования полиморфизма генов цитокинов в качестве прогностического маркера развития новой коронавирусной инфекции [8, 34]. Кроме того, полиморфизм может влиять на эффективность терапии и вакцинации против SARS-CoV-2 [24, 34].

Однако большинство работ, касающихся этой темы, направлено на изучение влияния уровня цитокинов на течение и исход заболевания. И лишь в последнее время появляются ограниченные исследования о корреляции полиморфизма генов цитокинов с возникновением COVID-19.

Описано несколько способов прогнозирования развития и течения COVID-19 с учетом полиморфизма генов цитокинов. Так, опубликовано две работы [9, 34], в которых представлены результаты генотипирования локуса IL10 у больных COVID-19 и одна статья, касающаяся полиморфизма гена IL4 [23]. Однако ни в одной из них не обследовались пациенты с заболеваниями системы крови.

Так, в своем исследовании М. Avendano-Felix et al. [9] выдвинули предположение о том, что полиморфизм гена IL10 в точках rs1800871 (- 819С>Т) и rs1800872 (-592С>А) связан с клиническим течением COVID-19 (обследовано 193 жителя Мексики). В качестве сопутствующих заболеваний у них указаны, артериальная гипертензия, сахарный диабет и другие. Генотипирование проводили методом ПЦР в реальном времени. Однако авторами не было получено никаких доказательств связи между частотами аллелей, генотипов или гаплотипов и тяжестью исходов COVID-19.

В работе L.K. Batur et al. [34] носительство гетерозигот гена IL10-1082G>A коррелировало с самой широкой распространенностью COVID-19 в Бразилии, Испании и Нидерландах и с самым высоким уровнем смертности в Испании, Великобритании и Италии (из расчета на 1 млн. человек в популяции) среди 23 стран. Проведенный анализ подтверждает представление о том, что полиморфизмы генов интерлейкинов играют важную роль в распространении COVID-19 по всему миру, несмотря на предпринимаемые ограничительные национальные и международные мероприятия.

Интерлейкин-10 (IL-10) продуцируется, в основном CD4+ Т-лимфоцитами-хелперами, а также некоторыми активированными В-клетками и макрофагами. IL-10 ингибирует функции Т-лимфоцитов и антигенпрезентирующих клеток путем подавления экспрессии провоспалительных цитокинов (фактора некроза опухоли альфа, IL-1, -6, -8, -12, а также HLA II класса). В дополнение к своим иммуносупрессивным свойствам, IL-10 повышает выживаемость, пролиферацию, дифференцировку В-лимфоцитов и выработку ими антител. Ген IL10 высоко полиморфен, картирован на 1 хромосоме (участок 1q31-q32), составляет по протяженности около 5,2 килобаз, включает пять экзонов. В гене насчитывается 194 полиморфных варианта, однако три наиболее частые и значимые точечные мутации обнаружены в области промотора: -1082 (G/A), -819 (С/Т) и-592 (С/А). Кроме того, там же описаны два микросателлитных полиморфизма (IL10.G и IL10.R). Показано, что присутствие мутантного аллеля и мутантных гомозигот коррелирует со снижением продукции IL-10 при стимуляции клеток in vitro и in vivo, с низкой концентрацией цитокина в плазме крови и более выраженным воспалительным ответом [35]. Результаты исследований при COVID-19 продемонстрировали, что при тяжелом течении инфекции в сыворотке периферической крови больных наблюдаются экстремально высокие уровни IL-10 [25, 34, 36], которые связаны с компенсаторным противовоспалительным ответом, ответственным за большое число случаев вторичных инфекций (50%) и сепсиса (100%) у выживших пациентов [34].

Ген IL4 у человека расположен на хромосоме 5q31 и состоит из 25 т.п.н, и в нем обнаружены многочисленные аллельные варианты, к наиболее значимым из которых относят 590С/Т (rs2243250), 33С/Т (rs2070874), +3437C/G (rs2227282) и 2979G/T (rs2227284). Полиморфизм rs2243250 локализован в промоторной области, rs2070874 - в 5'-нетранслируемом регионе, rs2227282 и rs2227284 - во втором интроне гена.

При исследовании полиморфизма rs2070874 гена IL4-33С>Т у больных COVID-19 выявлены различия в частоте встречаемости альтернативного аллеля в зависимости от региона проживания пациентов: его встречаемость у жителей Катара примерно в 3 раза ниже (13,7%) по сравнению с общемировыми данными (40,1%), и ниже в 5,7 раза при сравнении с населением Восточной Азии (77,9%). Среди населения Европы его частота встречаемости является самой низкой (16,8%) [23]. Таким образом, данные касающиеся связи полиморфизма гена IL4 и COVID-19 представлены лишь в одной публикации, характеризующей межпопуляционные различия при инфицировании SARS-CoV-2 и не касаются больных гемобластозами.

Интерлейкин 4 (IL-4) представляет собой плейотропный цитокин, секретируемый активированными Т-лимфоцитами и тучными клетками. Он играет важную роль в Th-иммунном ответе 2-го типа, характеризующийся производством IgE и IgG1 [37]. IL-4 связан с профиброгенным воспалительным ремоделированием тканей, что может выступать в качестве причины поражения легочной ткани при COVID-19 [38].

Принимая во внимание все вышеизложенное, острая необходимость защиты пациентов с гемобластозами от инфицирования SARS-CoV-2 путем применения общих мер (тщательной гигиены рук, ношения масок, социального дистанцирования, сокращения времени пребывания в стационаре) и вакцинации [4, 12], генотипирование локусов иммунного ответа может обеспечить прогнозирование выявления группы высокого риска инфицирования SARS-CoV-2 с поражением легких, своевременное проведение противоэпидемических и профилактических мероприятий, что приведет к существенному снижению заболеваемости и смертности вследствие COVID-19 больных с заболеваниями системы крови.

Ни один из вышеупомянутых способов не касается обнаружения генов-кандидатов предрасположенности к развитию COVID-19 у пациентов с заболеваниями системы крови.

В целом, анализ литературы показал, что ассоциация полиморфизма в промоторе гена IL4 rs2243250 с развитием COVID-19 ранее совсем не исследовалась, а связь полиморфизма гена IL10 при инфекции, вызванной SARS-CoV-2 не изучалась у больных гемобластозами, а в популяционных исследованиях получены противоречивые результаты.

Двойственные итоги молекулярно-генетических исследований могут быть результатом различных сроков отбора образцов («при поступлении», «на ранней стадии заболевания», «в первый день после госпитализации», «до начала лечения»), субстратов, взятых на исследование, методик измерения и анализируемых популяций/географических регионов проживания обследуемых [9].

Таким образом, предлагаемый способ прогнозирования возникновения COVID-19 с поражением легких у пациентов с онкогематологическими заболеваниями на основании анализа SNPs генов иммунного ответа отличается от прототипов выявлением не только отдельных генотипов генов IL4 и IL10, но и комбинаций генотипов трех локусов иммунного ответа. Поэтому данный способ обладает критерием «новизна» и по совокупности отличительных действий от аналогов в нем присутствует критерий «существенные отличия».

Цель изобретения - разработка способа прогнозирования риска развития COVID-19 с поражением легких у больных гемобластозами.

Поставленная цель достигается с помощью анализа регуляторных SNPs в генах TLR2, TLR3, TLR4, TLR9, IL1β, IL2, IL4, IL6, IL10, IL17A, TNFα, TGFβ, CD14 и FCGR2A до установления диагноза COVID-19, в его дебюте или на любом этапе наблюдения за больными с онкогематологическими заболеваниями.

Способ применяли следующим образом. При госпитализации в стационар ФГБУН "КНИИГиПК ФМБА России" и подтверждении заболевания системы крови у взрослых больных проводили взятие 2000 мкл венозной крови в вакуумную пробирку объемом 2 мл, содержащую 3,6 мг К2ЭДТА.

Дальнейшее исследование осуществляли согласно методике в три этапа с использованием комплектов реагентов «SNP-экспресс» для выявления 21 полиморфизма 15 генов TLR2, TLR3, TLR4, TLR9, IL1β, IL2, IL4, IL6, IL10, IL17A, TNFα, TGFβ, CD14 и FCGR2A методом полимеразной цепной реакции с аллель-специфичными праймерами (производства НПФ «Литех», г. Москва), на амплификаторе «Терцик» (ООО «ДНК технология», г. Москва) и с электрофоретической детекцией продуктов реакции в агарозном геле.

На первом этапе (выделение ДНК из биопроб) в чистую пробирку типа Eppendorf с замком объемом 1,7 мл вносили 1 мл цельной крови. В случае ее расслоения в процессе хранения кровь перемешивали до однородного состояния. Пробирку типа Eppendorf с замком, содержащую кровь, закрывали пробкой и центрифугировали со скоростью 3000 об/мин на микроцентрифуге-вортексе при температуре 22±1°С в течение 5 мин. После центрифугирования крови с помощью автоматической пипетки-дозатора переменного объема аккуратно удаляли плазму, оставляя ее тонкий слой, не захватывая лейкоциты. Пробирку закрывали и выдерживали при температуре минус 20°С в морозильной камере в течение 1 часа до полного замораживания форменных элементов. Затем размораживали содержимое пробирки при температуре 22±1°С и добавляли 500 мкл реактива «ДНК-экспресс-кровь». Объем добавляемого реактива должен быть равным суммарному объему оставшихся в пробирке форменных элементов и плазмы. После этого содержимое пробирки в течение 10 с тщательно перемешивали на вортексе. Пробирку устанавливали в предварительно прогретый до температуры 98°С твердотельный термостат и выдерживали в течение 15 мин. Затем пробирку помещали в высокоскоростную микроцентрифугу и центрифугировали при 1200 об/мин при температуре 22±1°С в течение 10 мин. Полученный супернатант использовали для исследования ДНК непосредственно после его приготовления или замораживали в морозильной камере при минус 20°С на срок не более 6 мес. Замороженные образцы перед использованием полностью размораживали при температуре 22±1°С.

На втором этапе (проведение полимеразной цепной реакции) использовали комплект реагентов для амплификации «SNP-экспресс». Вначале подготавливали и маркировали пробирки вместимостью 0,5 мл для проведения амплификации из расчета 2 штуки на одну пробу («норма»-N и «мутация»-М) плюс 1 пробирка для отрицательного контроля. За 20 минут до приготовления рабочей амплификационной смеси комплект реагентов для ПЦР извлекали из морозильной камеры и полностью размораживали при температуре 22±1°С. Пробирки с реакционной смесью и раствором разбавителя тщательно перемешивали (с использованием вортекса и переворачиванием пробирки). Из компонентов комплекта готовили рабочие смеси реагентов для амплификации из расчета на 1 пробу: одна пробирка с реакционной смесью «Норма»: 17,5 мкл разбавителя; 2,5 мкл реакционной смеси «Норма»; 0,2 мкл Taq-полимеразы. Вторая пробирка с реакционной смесью «Мутация»: 17,5 мкл разбавителя; 2,5 мкл реакционной смеси «Мутация»; 0,2 мкл Taq-полимеразы. Рабочие смеси для амплификации тщательно перемешивали пипетированием. В пробирки, подготовленные для амплификации, добавляли по 20 мкл соответствующей рабочей смеси. Во все пробирки вносили по 1 капле минерального масла и по 5 мкл образца под слой масла в пробирку с рабочей амплификационной смесью «Норма» и в пробирку с рабочей амплификационной смесью «Мутация». В качестве отрицательного контрольного образца добавляли разбавитель в объеме 5 мкл. Пробирки закрывали и центрифугировали на микроцентрифуге-вортексе при 3000 об/мин при температуре 22±1°С в течение 3 с. Затем перемещали пробирки в прогретый до 94°С (температура, установившаяся в режиме «Пауза») программируемый твердотельный термостат (амплификатор) и проводили амплификацию по следующей программе (таблица 1):

На третьем этапе (детекция) для разделения продуктов амплификации использовали набор реагентов для электрофоретической детекции продуктов амплификации в агарозном геле. Для этого в камеру для горизонтального электрофореза заливали ТАЕ буфер, приготовленный путем разведения 50хТАЕ в 50 раз дистиллированной водой (рН=8,3). К 3 г агарозы с низким электроэндоосмосом добавляли 2 мл 50хТАЕ буфера и 100 мл дистиллированной воды. Смесь расплавляли в микроволновой печи и при перемешивании добавляли 10 мкл 1% раствора бромистого этидия. Расплавленную агарозу охлаждали до температуры 60°С и заливали в планшет с гребенками для формировали ячеек для нанесения образцов. После застывания агарозы осторожно вынимали гребенку из геля и переносили планшет с гелем в камеру для электрофореза. В ячейки геля наносили по 15 мкл ампликона в последовательности, соответствующей нумерации проб. Подключали электрофоретическую камеру к источнику питания и задавали напряжение электрического поля 15 В/см геля. Проводили электрофоретическое разделение продуктов амплификации в направлении от катода (-) к аноду (+). Контроль за электрофоретическим разделением осуществляли визуально по движению полосы красителя в течение 15 мин. По окончанию электрофореза вынимали гель из формы и переносили его на стекло ультрафиолетового трансиллюминатора (λ=312 нм).

Оценка результатов

При ультрафиолетовом облучении агарозного геля фрагменты ДНК проявлялись в виде светящихся полос (таблица 2).

Пример интерпретации результата представлен на фиг. 1, где К-отрицательный контрольный образец; 1 - нормальная гомозигота; 2 - гетерозигота; 3 - мутантная гомозигота; 4 - контаминация или затекание амплификата из соседнего кармана геля в тесте на мутантный аллель.

Распределение генотипов в исследуемых локусах TLR2, TLR3, TLR4, TLR9, IL1β, IL2, IL4, IL6, IL10, IL17A, TNFα, TGFβ, CD14 и FCGR2A проверяли на соответствие равновесию Харди-Вайнберга с помощью точного теста Фишера. Для сравнения частот аллелей и генотипов между различными группами использовали критерий χ2 Пирсона с поправкой Иэйтса на непрерывность. Дополнительно оценивали показатель отношения шансов - odds ratio (OR) с вычислением границ 95%-го доверительного интервала (95%CI). Значение OR=1 свидетельствовало об отсутствии ассоциации риска развития поражения легких, вызванного SARS-CoV-2, у больных гемобластозами с наблюдаемым генотипом. При значении OR<1 говорили об отрицательной ассоциации (фактор пониженного риска возникновения поражения легких, вызванного SARS-CoV-2, у больных гемобластозами), a OR>1 рассматривали как положительную ассоциацию с признаком (фактор повышенного риска). Для расчета результатов использовали пакеты программ MS Office Excel 2003, Stadia, а также сайт онлайн калькуляторов для расчета статистических критериев (https://medstatistic.ru/calculators.html). Статистический анализ массивов генов с целью установления межгенных взаимодействий локусов, доказавших ассоциацию с риском поражения легких, вызванного SARS-CoV-2, у больных гемобластозами проводили с использованием непараметрического метода сокращения многофакторной размерности (MDR, Multifactor Dimensionality Reduction) http://www.healthsystem.virginia.edu/internet/addiction-genomics/Software/ [16981]. Статистически значимыми считали различия при р<0,05.

Разработанный способ выявления группы высокого риска инфекции, вызванной SARS-CoV-2 с поражением легких, у больных с заболеваниями системы крови был оценен у 390 пациентов (острым лимфобластным, острым миелоидным лейкозом, миелодиспластическим синдромом, хроническим миелолейкозом, хроническим лимфолейкозом/лимфомой из малых лимфоцитов, множественной миеломой, апластической анемией, диффузной В-клеточной крупноклеточной лимфомой, лимфомой Ходжкина), проходивших стационарное лечение в клинике ФГБУН КНИИГиПК ФМБА России с марта 2020 г. Из них у 21 пациента (1 группа) был выставлен диагноз: Коронавирусная инфекция COVID-19, вирус идентифицирован (код МКБ-10 U07.1). Другая вирусная пневмония (код МКБ-10J12.8). Диагноз инфекционного осложнения установлен на основании клинической картины, изменений в общеклиническом анализе крови, подтвержден данными эпиданамнеза, обнаружением РНК SARS-CoV-2 методом полимеразной цепной реакции в мазках со слизистой оболочки носоглотки и характерной рентгенологической картиной при компьютерной томографии (КТ) органов грудной клетки: наличие множественных билатеральных участков альвеолярной инфильтрации, средней и высокой интенсивности (по типу матового стекла), широким основанием прилежащих к костальной плевре или имеющих сливной характер.

Во 2 группу (группа сравнения) вошли 369 больных гемобластозами без признаков инфекции, вызванной SARS-CoV-2.

Генотипирование локусов иммунного ответа TLR2, TLR3, TLR4, TLR9, IL1β, IL2, IL4, IL6, IL10, IL17A, TNFα, TGFβ, CD14 и FCGR2A выявило взаимосвязь полиморфизма генов IL4-590C>T, IL10-819C>T и IL10-1082G>A с высоким риском инфекции, вызванной SARS-CoV-2 с поражением легких у пациентов с заболеваниями системы крови (таблица 3).

Установлено, что при оценке мутационного статуса генов иммунного ответа пациентов с заболеваниями системы крови и инфекцией, вызванной SARS-CoV-2 с поражением легких, характеризовало преобладание мутантных гомозигот -590ТТ гена IL4 (33,3% vs. 10,3%, χ2=12,827, р=0,002, OR=4,355, 95%CI: 1,655-11,459), гетерозигот -819AG гена IL10 (65,0% vs. 31,4%, χ2=10,366, p=0,006, OR=4,050, 95%CI: 1,575-10,419), мутантного аллеля -1082C (57,9% vs. 40,0%, χ2=5,804, p=0,016, OR=2,065, 95%CI: 1,067-3,997) имутантных гомозигот -1082CC (42,1% vs. 17,6%, χ2=7,095, p=0,029, OR=3,401, 95%CI: 1,316-8,789) гена IL10.

Кроме того, при изучении межгенных взаимодействий полиморфных маркеров генов иммунного ответа, установлена трехлокусная модель сочетания вариантов генов IL4-590C>T, IL10-819C>T и IL10-1082G>A с высокой степенью согласованности модели (Cross Validation Consistency: 10/10, 100%) и точностью предсказания (Testing Balanced Accuracy: 76,87%, χ2=25,262, p<0,0001).

На фиг. 2 представлена трехлокусная модель комбинации генотипов генов IL4-590C>T, IL10-819C>Т и IL10-1082G>A, ассоциированных с различной степенью риска развития COVID-19 с поражением легких у больных гемобластозами. На диаграмме темно-серые ячейки содержат комбинации низкого риска развития COVID-19, светло-серые - высокого риска развития COVID-19, белые обозначают, что сочетания комбинаций генотипов отсутствуют. Левые столбики - количество больных гемобластозами без COVID-19, правые - число пациентов с гемобластозами и с COVID-19. Под сочетанием «00» подразумеваются гомозиготы дикого типа, «01» - гетерозиготы, «11» - мутантные гомозиготы.

В рамках данной модели значимыми предикторами низкого риска развития COVID-19 с поражением легких у больных с заболеваниями системы крови являлись 15 сочетаний генотипов, высокого риска - 10 комбинаций генотипов генов IL4-590C>T, IL10-819C>T и IL10-1082G>A (табл. 4).

Характер и сила взаимодействий генов IL4-590C>T, IL10-819C>Т и IL10-1082G>A, обусловливающих предрасположенность к развитию COVID-19, у больных гемобластозами графически представлены на фиг. 3. Под буквой А изображена дендрограмма кластерной структуры взаимодействия исследуемых генов, под буквой В - граф межгенных взаимодействий локусов IL4-590C>T, IL10-819C>T и IL10-1082G>A. Характер взаимодействия между генами при проявлении фенотипа заболевания характеризуется цветом линии: синий - выраженный антагонизм, зеленый - умеренный антагонизм. Длинные линии в дендрограмме описывают слабую взаимосвязь между маркерами, короткие отражают сильное взаимодействие между локусами. Информационная ценность каждого маркера указана в вершинах графа. Сила и направленность взаимодействия выражены в процентах энтропии.

Наибольшая степень взаимодействия в виде выраженного антагонизма характерна для локусов IL10-1082G>A и IL10-819C>T (А), которые, согласно схеме Фрюхтерман-Рейнгольда (В), обладают наибольшим значением (3,27% и 3,17% соответственно). Они же представляют собой оптимальное межгенное взаимодействие на долю которого приходится -3,81% фенотипической энтропии, демонстрируя выраженный антагонистичный эффект этих полиморфизмов при развитии COVID-19 у больных гемобластозами.

Полученные результаты свидетельствуют об ассоциации полиморфизма генов IL4-590С>Т, IL10-819C>T и IL10-1082G>А с высоким риском развития инфекции, вызванной SARS-CoV-2 с поражением легких, у больных гемобластозами. К факторам высокого риска возникновения инфекции, вызванной SARS-CoV-2, у пациентов с заболеваниями системы крови относились: присутствие мутантного аллеля и мутантных гомозигот гена IL10-1082G>A, гетерозигот гена IL10-819С>Т и мутантных гомозигот гена IL4-590C>T увеличивающих шанс неблагоприятного течения COVID-19 в 2, 3, 4 и 4 раза соответственно, а также определенных комбинаций локусов IL4-590С>Т, IL10-819C>T и IL10-1082G>A. Следовательно, протективными маркерами в отношении возникновения новой коронавирусной инфекции выступили аллель дикого типа и генотипы, его содержащие гена IL10-1082G>A, гомозиготы дикого и мутантного типов гена IL10-819C>T, генотипы с аллелем дикого типа гена IL4-590C>T и десять определенных сочетаний генотипов этих локусов.

Таким образом, выявлены молекулярно-генетические маркеры, коррелирующие с высоким риском инфекции, вызванной SARS-CoV-2 с поражением легких, у больных гемобластозами - носительство мутантных гомозигот генов IL4-590С>Т и IL10-1082G>A, а также гетерозигот гена IL10-819С>Т. Определение этих показателей и комбинаций генотипов генов IL4-590C>Т, IL10-819C>T и IL10-1082G>A (табл. 4) позволяет прогнозировать возникновение COVID-19 и дает возможность персонифицировать тактику профилактики данного инфекционного осложнения (вакцинация, использование противовирусных препаратов) путем ее эскалации, противоэпидемических (карантинная изоляция, регулярное тестирование на предмет инфицирования SARS-CoV-2) мероприятий и, следовательно, улучшать исходы инфекции на основании риск-адаптированного подхода.

Пример 1. Больная Р., 1957 года рождения. С 22.12.2020 г. проходила лечение во взрослом отделении гематологии и химиотерапии ФГБУН КНИИГиПК с диагнозом: Острый лимфобластный лейкоз В2-вариант, делеция 14q, поздний рецидив 1 от мая 2019 г., ремиссия 2 от июля 2019 г. Поздний рецидив 2 от 12.20.2020 г. Сахарный диабет 2 типа, инсулинзависимый целевой HbA1 с<7%. Гипертоническая болезнь III стадии, риск 4. С циторедуктивной целью проведена for-фаза: дексаметазон 6 мг/м2, №5, на 15 сутки 1 курса противорецидивной терапии VDMA с редукцией доз химиотерапия отменена в связи с гипоплазией кроветворения. В общем анализе крови: лейкоциты 0,7×109/л, гемоглобин 93 г/л, эритроциты 3,0×1012/л, тромбоциты 50×109/л, СОЭ 23 мм/час. С 13.01.2021 г. отмечает повышение температуры тела до 38°С, слабость, кашель. Объективно: в легких дыхание жесткое, в нижних отделах слева и по передней поверхности грудной клетки выслушивается небольшое количество сухих хрипов. При КТ (выдержки из заключения) грудной полости (легкие и средостение, низкодозовый протокол, толщина сканируемого слоя 2,5 мм, контрастное усиление не проводилось): по всей паренхиме легких визуализируются множественные небольшие участки понижения прозрачности легочной ткани по типу матового стекла, без четких контуров (поражение легких справа 15%, слева 10%). В S3 верхней доли правого легкого определяется участок консолидации размерами 31×25 мм. В нижних долях - линейные уплотнения. При исследовании биологического материала пациента (мазок из носо- и ротоглотки) методом амплификации нуклеиновых кислот выявлена РНК SARS-CoV-2. При генотипировании полиморфизма генов иммунного ответа обнаружена комбинация генотипов высокого риска развития новой коронавирусной инфекции: IL10-1082СС × IL4-590TT × IL10-819АА (табл. 4). Пациентка переведена в стационар инфекционного профиля для лечения COVID-19.

Пример 2. Больная З., 1962 года рождения. С 03.12.2020 г. проходила лечение во взрослом отделении гематологии и химиотерапии ФГБУН КНИИГиПК с диагнозом: Хронический миелоидный лейкоз, бластный криз по мегакариоцитарному типу от 30.05.2018 г., мутация гена BCR-ABL T315I, прогрессирование на ингибиторах тирозинкиназ 2 поколения, бластный криз 2 от 03.11.2020 г., резистентное течение. Злокачественное новообразование верхненаружного квадранта правой молочной железы T2N0M0, хирургическое лечение в 2016 г., метастатическое поражение костей скелета, в процессе полихимиотерапии, 4 клиническая группа. На 23 сутки после 1 циторедуктивного курса Aza+Ida+Ara при выходе из агранулоцитоза - прогрессия заболевания, резистентность к химиотерапии (спленомегалия, появление бластных клеток в общем анализе крови). На 34 день госпитализации - повышение температуры тела до субфебрильных цифр. В общем анализе крови: лейкоциты 0,57×109/л, гемоглобин 63 г/л, эритроциты 2,3×1012/л, тромбоциты 28×109/л, СОЭ 28 мм/час. С 35 дня госпитализации - фебрильная лихорадка, объективно: в легких дыхание везикулярное, в нижних отделах ослабленное, более выраженное слева; с 38 дня - заложенность носового дыхания; с 40 дня - редкий малопродуктивный кашель. При исследовании биологического материала пациента (мазок из носо- и ротоглотки) методом амплификации нуклеиновых кислот выявлена РНК SARS-CoV-2. При КТ (выдержки из заключения) грудной полости (легкие и средостение, низкодозовый протокол, толщина сканируемого слоя 2,5 мм, контрастное усиление не проводилось): в S3 верхней доли, в S4 средней доли и S6 нижней доли правого легкого на фоне зон понижения прозрачности по типу матового стекла определяются мелкие очажки с нечеткими контурами. В S5 средней доли правого легкого визуализируется участок уплотнения размерами 18×9 мм. В нижних долях обоих легких - единичные очаги диаметром 3-6 мм. При генотипировании полиморфизма генов иммунного ответа обнаружена комбинация генотипов высокого риска развития новой коронавирусной инфекции: IL10-1082TC × IL4-590CC × IL10-819AG (табл. 4). Пациентка переведена в стационар инфекционного профиля для лечения COVID-19.

Пример 3. Больной К., 1948 года рождения. С 20.09.2021 г. проходил лечение во взрослом отделении гематологии и химиотерапии ФГБУН КНИИГиПК с диагнозом: Множественная миелома 3А стадия, лямбда-тип, t(11;14), 1 линия терапии VCD. Компрессионные переломы тел Th7-8. Атрофический гастрит. Катарально-фиброзный эзофагит.

Цереброваскулярная болезнь. Церебральный атеросклероз. Кортикальная атрофия. Дисциркуляторная энцефалопатия 2 степени. Получил 2 курс VCD (с редукцией доз). На 10 день терапии ощутил слабость, чувство нехватки воздуха. Сатурация О2 - 90-91%. При КТ (выдержки из заключения) грудной полости (легкие и средостение, низкодозовый протокол, толщина сканируемого слоя 2,5 мм, контрастное усиление не проводилось): во всех отделах легких множественные участки понижения прозрачности легочной ткани по типу матового стекла без четких контуров. На фоне интерстициальных изменений отмечается утолщение внутри- и междольковых перегородок и линейные уплотнения (справа 60%, слева 50%).При исследовании биологического материала пациента (мазок из носо- и ротоглотки) методом амплификации нуклеиновых кислот выявлена РНК SARS-CoV-2. При генотипировании полиморфизма генов иммунного ответа обнаружена комбинация генотипов высокого риска развития новой коронавирусной инфекции: IL10-1082TT × IL4-590CC × IL10-819AG (табл. 4). Пациент переведен в стационар инфекционного профиля для лечения COVID-19.

Пример 4. Больная Ш., 1957 года рождения. С 07.10.2020 г. проходила лечение во взрослом отделении гематологии и химиотерапии ФГБУН КНИИГиПК с диагнозом: Острый миеломонобластный лейкоз, М4 вариант, промежуточный риск, без цитогенетических нарушений, ремиссия от 04.06.2020 г., с декабря 2020 г. поддерживающее лечение. Сахарный диабет 2 типа, инсулиннезависимый, целевой HbA1 с <7%. Иммунодефицит с преимущественной недостаточностью антител. Хронический пиелонефрит вне обострения. Хроническая болезнь почек: С3Б. Хронический калькулезный холецистит вне обострения. Эритематозная гастропатия, ассоциированная с Н. pylori. Миома матки. Поступила в стационар с жалобами на слабость, фебрильную лихорадку с повышением температуры тела до 38,4°С без озноба. Начала получать курс сопроводительной терапии. На 3 день терапии в общем анализе крови: лейкоциты 3,4×109/л, гемоглобин 93 г/л, эритроциты 3,0×1012/л, тромбоциты 250×109/л, СОЭ 38 мм/час. При КТ (выдержки из заключения) грудной полости (легкие и средостение, низкодозовый протокол, толщина сканируемого слоя 2,5 мм, контрастное усиление не проводилось): в легких наблюдаются обширные участки понижения прозрачности легочной ткани по типу матового стекла, наиболее выраженные в средних и нижних отделах (более 50% поражения легких). В нижних долях легких - участки уплотнения легочной ткани неправильной округлой формы с неровными нечеткими контурами, в отдельных визуализируются мелкие полости. При исследовании биологического материала пациента (мазок из носо- и ротоглотки) методом амплификации нуклеиновых кислот выявлена РНК SARS-CoV-2. При генотипировании полиморфизма генов иммунного ответа обнаружена комбинация генотипов высокого риска развития новой коронавирусной инфекции: IL10-1082TT × IL4-590ТТ × IL10-819AA (табл. 4). Пациентка переведена в стационар инфекционного профиля для лечения COVID-19.

Список литературы:

1. Management of patients with hematologic malignancies during the COVID-19 pandemic: practical considerations and lessons to be learned / A. Isidori, L. de Leval, U. Gergis, P. Musto, P. Porcu // Front. Oncol. - 2020. - Vol. 10. - P. 1439. doi: 10.3389/fonc.2020.01439.

2. PNPLA3 and TLL-1 polymorphisms as potential predictors of disease severity in patients with COVID-19 / S. Grimaudo, E. Amodio, R.M. Pipitone, C.M. Maida, S. Pizzo, T. Prestileo, F. Tramuto, D. Sardina, F. Vitale, A. Casuccio, A. Craxi // Front. Cell Dev. Biol. - 2021. - Vol. 9. - P. 627914. doi: 10.3389/fcell.2021.627914.

3. COVID-19 in 96 patients with hematologic disease: the first single-center experience from the Czech Republic / M. Cernan, T. Szotkowski, A. Obr, P. Sauer, E. Faber, // Clin. Lymphoma, Myeloma & Leukemia. - 2021. - Vol. 21. - no. 9. - P. 606-612. https://doi.org/10.1016/j.clml.2021.04.016.

4. Treatment of acute leukemia during COVID-19: focused review of evidence / S. Singh, J. Singh, D. Paul, K. Jain // Clin. Lymphoma, Myeloma & Leukemia. - 2021. - Vol. 21. - no. 5. - P. 289-294. https://doi.org/10.1016/j.clml.2021.01.004.

5. Role of genetic variants and host polymorphisms on COVID-19: From viral entrance mechanisms to immunological reactions / A. Adli, M. Rahimi, R. Khodaie, N. Hashemzaei, S.M. Hosseini // J. Med.Virol. - 2022. - no. 1. - P. 1-20. doi: 10.1002/jmv.27615.

6. Interleukin-37 gene polymorphism and susceptibility to coronavirus disease 19 among Iraqi patients / A.A. Ahmed, A.H. Ad'hiah // Meta Gene. - 2022. - Vol. 31. - P. 100989. https://doi.org/10.1016/j.mgene.2021.100989.

7. COVID-19 prevalence and mortality in patients with cancer and the effect of primary tumour subtype and patient demographics: a prospective cohort study / L.Y.W. Lee, J.-B. Cazier, T. Starkey, S.E.W. Briggs, R. Arnold, V. Bisht, S. Booth, N.A. Campton, V.W.T. Cheng, G. Collins, H.M. Curley, P. Earwaker, M.W. Fittall, S. Gennatas, A. Goel, S. Hartley, D.J. Hughes, D. Kerr, A.J.X. Lee, R.J. Lee, S. Ming Lee, H. Mckenzie, C.P. Middleton, N. Murugaesu, T. Newsom-Davis, A.C Olsson-Brown, С Palles, T. Powles, E.A. Protheroe, K. Purshouse, A. Sharma-Oates, S. Sivakumar, A.J. Smith, O. Topping, C.D. Turnbull, A.D.M. Briggs, G. Middleton, R. Kerr, on behalf of the UK Coronavirus Cancer Monitoring Project Team // Lancet Oncol. - 2020. - Vol. 21. - P. 1309-1316. https://doi.org/10.1016/S1470-2045(20)30442-3.

8. Toll-like receptor 4 polymorphisms (896A/G and 1196C/T) as an indicator of COVID-19 severity in a convenience sample of Egyptian patients / S.I. Taha, A.K. Shata, S.A. Baioumy, S.H. Fouad, S.G. Anis, I.M. Mossad, N.M. Moustafa, D.M. Abdou, M.K. Youssef// J. Inflamm. Res. - 2021. - Vol. 14. - P. 6293-6303. https://doi.org/10.2147/JIR.S343246.

9. Lack of effects of the genetic polymorphisms of interleukin-10 in clinical outcomes of COVID-19 / M. Avendano-Felix, L.A. Ochoa-Ramirez, R. Ramos-Payan, M. Aguilar-Medina, A. Ayala-Ham, H. Rendon-Aguilar, E. Lizarraga-Verdugo, F. Peraza-Garay, J.J. Rios-Tostado, J.S. Velarde-Felix // Viral Immunol. - 2021. - Vol. 34. - no. 8. - P. 567-572. DOI: 10.1089/vim.2021.0022.

10. Host genetic factors determining COVID-19 susceptibility and severity / T.P. Velavan, S.R. Pallerla, Y. Augustin, P.G. Kremsner, S. Krishna, C.G. Meyer // EBioMedicine. - 2021. - Vol. 72. P. 103629. doi: 10.1016/j.ebiom.2021.103629.

11. Outcomes of patients with hematologic malignancies and COVID-19: a systematic review and meta-analysis of 3377 patients / A. Vijenthira, I.Y. Gong, T.A. Fox, S. Booth, G. Cook, B. Fattizzo, J. Razanamahery, J.C Riches, J. Zwicker, R. Patell, M.C Vekemans, L. Scarfo, T. Chatzikonstantinou, H. Yildiz, R. Lattenist, I. Mantzaris, W. A. Wood, L.K. Hicks // Blood. - 2020. - Vol. 136. - no. 25. - P. 2881-2892. doi: 10.1182/blood.2020008824.

12. SARS-CoV-2 vaccines in patients with multiple myeloma / M. Gavriatopoulou, I. Ntanasis-Stathopoulos, E. Korompoki, E. Terpos, M.A. Dimopoulos // Hemasphere. - 2021. - Vol. 5. - no. 3. - e547. doi: 10.1097/HS9.0000000000000547.

13. Multiple myeloma in the time of COVID-19 / A.S. Al Saleh, T. Sher, M.A. Gertz // ActaHaematol. - 2020. - Vol. 143. - P. 410-416. doi: 10.1159/000507690.

14. Mutations and polymorphisms in genes involved in the infections by covid 19: a review / A.B.O. Kaltoum // Gene Reports. - 2021. - Vol. 23. - P. 101062. doi: 10.1016/j.genrep.2021.101062.

15. Anti-IL-6 receptor antibody treatment for severe COVID-19 and the potential implication of IL-6 gene polymorphisms in novel coronavirus pneumonia / Z.S. Ulhaqa, G.V. Soraya // Med. Clin. (Engl. Ed.). - 2020. - Vol. 155. - no. 12. - P. 548-556. DOI: 10.1016/j.medcle.2020.07.014.

16. Interleukin 6 polymorphisms as an indicator of COVID-19 severity in humans / N. Kirtipal, S. Bharadwaj / J. Biomol. Struct. Dyn. - 2020. - Vol. 39. -no. 12.-P. 4563-4565. Doi: 10.1080/07391102.2020.1776640.

17. The host's angiotensin-converting enzyme polymorphism may explain epidemiological findings in COVID-19 infections / J.R. Delanghe, M.M. Speeckaert, M.L. De Buyzere // Clin. Chim. Acta. - 2020. - Vol. 505. - P. 192-193. DOI: 10.1016/j.cca.2020.03.031.

18. Comparative genetic analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) receptor ACE2 in different populations / Y. Cao, L. Li, Z.Feng, S. Wan, P. Huang, X. Sun // Cell Discov. - 2020. - Vol. 6. - P. 11. DOI: 10.1038/s41421-020-0147-1.

19. Individual variation of the SARS-CoV2 receptor ACE2 gene expression and regulation / J. Chen, Q. Jiang, X. Xia, K. Liu, Z. Yu, W. Tao // Aging cell. - 2020. -Vol. 19. - no. 7. - P. e13168. DOI: 10.1111/acel.13168.

20. Human ACE2 receptor polymorphisms predict SARS-CoV-2 susceptibility / E.W. Stawiski, D. Diwanji, K. Suryamohan // Commun. Biol. - 2021. - Vol. 4. - P. 475. https://doi.org/10.1038/s42003-021-02030-3.

21. Assessment of risk conferred by coding and regulatory variations of TMPRSS2 and CD26 in susceptibility to SARS-CoV-2 infection in human / S. Senapati, S. Kumar, A.K. Singh, P. Banerjee, S. Bhagavatula // J. Genet. - 2020. -Vol. 99. - no. 1. - P. 53. DOI: 10.1007/s12041-020-01217-7.

22. Способ оценки риска развития тяжелой формы COVID-19: пат. 2751410 Рос. Федерация. №2021104170; заявл. 18.02.2021; опубл. 13.07.2021, бюл. №20.

23. Host genetic variants potentially associated with SARS-CoV-2: A multi-population analysis / M.K. Smatti, Y.A. Al-Sarraj, O. Albagha, H.M. Yassine / Front Genet. - 2020. - Vol. 11. - P. 578523. doi: 10.3389/fgene.2020.578523.

24. Implications of the immune polymorphisms of the host and the genetic variability of SARS-CoV-2 in the development of COVID-19 / J. Zepeda-Cervantes, D. Tecalco-Cruz, N.S. Vaca, R.E. Sarmiento-Silva // Viruses. - 2022. - Vol.14. -P. 94. https://doi.org/10.3390/v14010094.

25. Predictive immunogenetic markers in COVID-19 / M.M. Leite, F.F. Gonzalez-Galarza, B.C. Costa da Silva, D. Middleton, E.J. Melo dos Santos // Hum. Immunol. - 2021. - Vol. 82. - no. 4. - P. 247-254. doi.org/10.1016/j.humimm.2021.01.008.

26. Association of TLR3 functional variant (rs3775291) with COVID-19 susceptibility and death: a population-scale study / G. Dhangadamajhi, R. Rout // Hum. Cell. - 2021. - Vol. 2021. - P. 1-3. doi: 10.1007/s13577-021-00510-6.

27. TLR3 (rs3775291) variant is not associated with SARS-CoV-2 infection and related mortality: a population-based correlation analysis / A. Pati, S. Padhi, S. Chaudhury, A.K. Panda // Hum. Cell. - 2021. - Vol. 34. - no. 4. - P. 1274-1277. doi: 10.1007/s13577-021-00530-2.

28. Prognostic impact of toll-like receptors gene polymorphism on outcome of COVID-19 pneumonia: A case-control study / M.M. Alseoudy, M. Elgamal, D.A. Abdelghany, A.M. Borg, A. El-Mesery, D. Elzeiny, M. О Hammad// Clinical Immunology. - 2022 - Vol. 235. - P. 108929. doi.org/10.1016/j.clim.2022.108929.

29. Genetic variants of the human host influencing the coronavirus-associated phenotypes (SARS, MERS and COVID-19): rapid systematic review and field synopsis / E. Di Maria, A. Latini, P. Borgiani, G. Novelli // Human Genomics. - 2020. - Vol. 14. - P. 30. https://doi.org/10.1186/s40246-020-00280-6.

30. Association of Toll-like receptor 7 variants with life-threatening COVID-19 disease in males: findings from a nested case-control study / C. Fallerini, S. Daga, S. Mantovani, E. Benetti, N. Picchiotti, D. Francisci, F. Paciosi, E. Schiaroli, M. Baldassarri, F. Fava, M. Palmieri, S. Ludovisi, F. Castelli, E. Quiros-Roldan, M. Vaghi, S. Rusconi, M. Siano, M. Bandini, O. Spiga, K. Capitani, S. Furini, F. Mari, GEN-COVID Multicenter Study, A.Renieri, M.U. Mondelli, E. Frullanti // eLife. - 2021. - Vol. 10. - P. e67569. DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.67569.

31. TLRs in COVID-19: How they drive immunopathology and the rationale for modulation / FX. Mabrey, E.D. Morrell, M.M. Wurfel // Innate Immunity. -2021. - Vol. 27. - no. 7-8. - P. 503-513. DOI: 10.1177/17534259211051364.

32. The genetic polymorphism of TNF-α associated with the anti-TNF-α therapy used for COVID-19 patients - another possible approach / L. Barreto Silva, G. Marinho Sampaio, R. Scavuzz iCarneiro Cunha, , A. Pereira dos Santos Neto, H. Albuquerque dos Anjos, FX. de Melo Almeida Fonseca, // Research, Society and Development. - 2022. - Vol. 11. - no. 1. - P. e47411121576. DOI: http://dx.doi.org/10.33448/rsd-v11i1.21576.

33. Frequency of interleukin-6 rsl800795 (-174G/C) and rsl800797 (-597G/A) polymorphisms in COVID-19 patients in Turkey who develop macrophage activation syndrome / F. Kerget, B. Kerget // Jpn. J. Infect. Dis. -2021. - Vol. 74. - no. 6. - P. 543-548. doi: 10.7883/yoken.JJID.2021.046.

34. Correlation between interleukin gene polymorphisms and current prevalence and mortality rates due to novel coronavirus disease 2019 (COVID-2019) in 23 countries / L.K. Batur, N. Hekim // J. Med. Virol. - 2021. - Vol. 93. - P. 5853-5863. DOI: 10.1002/jmv.27127.

35. Способ выявления первично рефрактерной формы множественной миеломы в дебюте заболевания: пат. 2749612 Рос. Федерация, №2020127910; заявл. 19.08.2020; опубл. 16.06.2021, бюл. №17.

36. A potential role of interleukin 10 in COVID-19 pathogenesis / L. Lu, H. Zhang, D.J. Dauphars, Y.-W. He // Trends Immunol. - 2021. - Vol. 42. - no. 1. - P. 3-5. doi: 10.1016/j.it.2020.10.012.

37. Association of IL4 rs2070874, FoxP3 rs3761548 polymorphisms with keratoconus in Algeria / W. Meteoukki, M. Fodil, N. Adda Negaz, N. Rahmoun, S. Lardjam Hetraf, H. Ouhaibi Djellouli, A. Djelti Messal, M. Abdi, M. Samia Aberkane, A. Chiali, A. Derdour, A. Idder, F. Zemani-Fodil // J. Ophthalmic Vis. Res. - 2021. - Vol. 16. - no. 4. - P. 558-565. DOI: 10.18502/jovr.v16i4.9745.

38. IL-4/IL-13 remodeling pathway of COVID-19 lung injury / C.B.V. de Paula, M.L.V. de Azevedo, S. Nagashima, A.P. Camargo Martins, M.A. Scaranello Malaquias, A.F. Ribeiro dos Santos Miggiolaro, J. da Silva Motta Junior, G. Avelino, Leticia A. Panini do Carmo, L. Baena Carstens, L. de Noronha // Scientific Reports. - 2020. - Vol. 10. - P. 18689. https://doi.org/10.1038/s41598-020-75659-5.

Способ прогнозирования риска возникновения инфекции, вызванной SARS-CoV-2 с поражением легких у больных гемобластозами, включающий оценку полиморфизма генов IL4 и IL10 в геномной ДНК, выделенной из лейкоцитов цельной крови, характеризующийся анализом распределения генотипов изучаемых локусов, в случае выявления сочетаний генотипов локусов IL10-1082TT × IL4-590CC × IL10-819AG, IL10-1082TT × IL4-590TT × IL10-819AA, IL10-1082TT × IL4-590TT × IL10-819AG, IL10-1082ТС × IL4-590СС × IL10-819AG, IL10-1082TC × IL4-590CT × IL10-819AG, IL10-1082TC × IL4-590ТТ × IL10-819AA, IL10-1082ТС × IL4-590TT × IL10-819AG, IL10-1082СС × IL4-590CC × IL10-819AG, IL10-1082CC × IL4-590ТТ × IL10-819AA, IL10-1082CC × IL4-590TT × IL10-819AG прогнозируют высокий риск поражения легких при COVID-19.



 

Похожие патенты:
Изобретение относится к медицине, а именно к акушерству и гинекологии, к лучевой диагностике. На 3-5-е сутки после кесарева сечения осуществляют радиотермометрию с помощью трансабдоминального и трансвагинального датчиков микроволнового радиотермометра РТМ - 01 - РЭС.
Изобретение относится к сельскому хозяйству, в частности к способу отбора коров-доноров ооцитов в технологии трансплантации эмбрионов in vitro. Для осуществления указанного способа для отбора животных дополнительно осуществляют этап оценки по биохимическим параметрам крови: по прогестерону, холестерину и каротину за 10 дней до планируемой процедуры вымывания ооцитов на 10 день полового цикла.

Изобретение относится к медицине, а именно к медицинской диагностике, и может быть использовано для прогнозирования риска развития H. pylori–позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у неродственных русских индивидуумов, уроженцев Центрально-Черноземного региона РФ.

Изобретение относится к области фармацевтики и медицины, а именно к способу прогнозирования применимости ассоциированных с опухолью неоантигенов или неоэпитопов, содержащих одну или несколько специфических по отношению к раку аминокислотных модификаций, в противораковой иммунотерапии, согласно которому 1) выявляют ассоциированные с опухолью неоантигены или неоэпитопы, содержащие одну или несколько специфических по отношению к раку аминокислотных модификаций; 2) идентифицируют среди выявленных неоантигенов или неоэпитопов те, для которых процессирование и презентация неоантигена по пути MHC I приводит к распознаванию комплексов, образованных MHC I и неоэпитопами неоантигена, CD8+ T-клетками; 3) устанавливают распределение или локализацию выявленных неоантигенов или неоэпитопов и используют вычислительную базу данных для определения тех, которые являются локализованными или распространенными в цитозоле и/или в экзосомах in vivo; 4) прогнозируют, что выявленные неоантигены или неоэпитопы являются применимыми для противораковой иммунотерапии.

Изобретение относится к области фармацевтики и медицины, а именно к способу прогнозирования применимости ассоциированных с опухолью неоантигенов или неоэпитопов, содержащих одну или несколько специфических по отношению к раку аминокислотных модификаций, в противораковой иммунотерапии, согласно которому 1) выявляют ассоциированные с опухолью неоантигены или неоэпитопы, содержащие одну или несколько специфических по отношению к раку аминокислотных модификаций; 2) идентифицируют среди выявленных неоантигенов или неоэпитопов те, для которых процессирование и презентация неоантигена по пути MHC I приводит к распознаванию комплексов, образованных MHC I и неоэпитопами неоантигена, CD8+ T-клетками; 3) устанавливают распределение или локализацию выявленных неоантигенов или неоэпитопов и используют вычислительную базу данных для определения тех, которые являются локализованными или распространенными в цитозоле и/или в экзосомах in vivo; 4) прогнозируют, что выявленные неоантигены или неоэпитопы являются применимыми для противораковой иммунотерапии.

Изобретение относится к медицине, а именно к медицинской диагностике, и может быть использовано для прогнозирования риска развития язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у неродственных русских индивидуумов, уроженцев Центрально-Черноземного региона РФ. Осуществляют забор венозной крови, выделение ДНК из периферической венозной крови и анализ полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Изобретение относится к медицине, а именно к офтальмологии и ревматологии, и может быть использовано для прогнозирования обострения хронического увеита у мужчин с анкилозирующим спондилитом. У мужчин, страдающих анкилозирующим спондилитом и увеитом, с дебютом анкилозирующего спондилита в возрасте от 12 лет и старше и длительностью заболевания от 16 лет и более, проводят забор крови.
Изобретение относится к области медицины, а именно к дифференциальной диагностике образования слизистой оболочки щеки, и может быть использовано в дифференциальной диагностике воспалительных заболеваний и злокачественных новообразований органов полости рта в условиях стоматологических, онкологических и хирургических лечебных заведений.
Изобретение относится к области медицины, а именно к способу дифференциальной диагностики образования слизистой оболочки губы, и может быть использовано в дифференциальной диагностике воспалительных заболеваний и злокачественных новообразований органов полости рта в условиях стоматологических, онкологических и хирургических лечебных заведений.

Изобретение относится к медицине, а именно к неврологии, и может быть использовано для прогнозирования степени тяжести двигательных нарушений у детей с врожденными поражениями головного мозга. Исследуют генотип плода или ребенка.

Изобретение относится к медицине, а именно к хирургической эндокринологии, и может быть использовано для дооперационной дифференциальной диагностики доброкачественной или злокачественной природы узловых образований щитовидной железы. Выполняют тонкоигольную аспирационную биопсию узловых образований щитовидной железы под контролем УЗИ.
Service Desk для клининга
Наверх